③【人与人基因同源性】鼠标](https://nate9389.tistory.com/2156#:~:text=%EC%82%AC%EB%9E%8C%EA%B3%BC%20%EB%A7%88%EC%9A%B0%EC %8A%A4%EC%9D%98%20%EC%83%81%EB%8F%99（%C2%A0同源性%C2%A0在%C2%A0人类%C2%A0和%C2%A0小鼠之间））

④【小鼠基因注释（23282个基因）】(https://blog.kakaocdn.net/dn/dSxtNu/btrTkgVXVez/wNuKXBexetJkuYfvcHCMYK/mouse%20gene%20annotation.csv?attach=1&knm=tfile.csv)

○ 基因ID

○ Entrez ID

○ 染色体数目、起始、终止、宽度

○ 绞线

○ 蛋白质 ID (p_id)

○ 成绩单 ID (transcript_id)

○ tss_id

○ 生物型

○ 别名

○ 说明

⑷ 有关其他信息，请参阅 https://www.scinapse.io/、https://typeset.io/，它们收录了数十亿篇论文。

2.每个基因的描述

○ ABCA1：在胆固醇转运中发挥作用

○ ABCC11

○ 与狐臭有关

○ 1型. A型基因：顶浆分泌汗液较少，导致体臭较弱

○ 2型. G型基因：顶浆腺主动分泌汗液

○ 3型. AA型基因：还有一种AA型基因不与G型基因混合

○ A型基因在东亚人中常见，而G型基因在非洲人和欧洲人中表达较多

○ 从ABCC11基因的表达来看，韩国人是体臭最少的族群之一。

○ 关于衰老和体臭的补充说明：随着年龄的增长，皮脂中的脂肪酸氧化时产生的一种叫做壬烯醛的物质的量会增加。这种物质积聚在毛孔中，产生霉味。另外，40岁以后，由于皮肤有益菌减少、皮肤酸化、脂质成分变化，消除壬烯醛的能力逐渐下降，导致体臭更严重。

○ ACKR3

○ 活化的内皮细胞可能发生上调

○ 它可能有助于肿瘤血管生成

○ ACTA2、Acta2 (α-SMA)

○ 结构标记

○ 平滑肌肌动蛋白基因

○ ActB、ACTB：与肌动蛋白相关。细胞运动

○ ACTG2：与细胞运动有关

○ ADAM8

○ 编码解整合素和金属蛋白酶结构域

○ 膜锚定蛋白

○ ADARB1：编码A-to-I（腺苷-肌苷）RNA 编辑酶> ○ Afp：编码胎儿血清蛋白Ealfa feto- Protein

○ ALOX5A：抗炎脂氧素 LXA4 的合成

○ ALOX5AP：抗炎脂氧素 LXA4 的合成

○ ANCR：抑制表皮分化

○ ANXA1：T 细胞炎症抑制因子

○ AQP1：水通道蛋白基因，肺泡内皮细胞标志物

○ AREG：与 TGF-β 导致的纤维化相关

○ ARHGAP11B：人类独有的基因。使人类聪明的基因

○ BCL11B：在 T 细胞中表达，作为导致 B 细胞淋巴瘤的基因

○ BRCA1：BRCA1 功能丧失与串联重复相关。

○ BRCA2：BRCA2 功能丧失与染色体缺失有关。

○ C1Qb：调节突触消除

○ C3：抑制 CD8+ 和 CD4+ T 细胞的浸润和功能。

○ C5ar1：与先天免疫相关

○ CCL2：诱导巨噬细胞和T细胞等免疫细胞的趋化因子

○ CCL18：与乳腺癌转移相关

○ CCL19：与过敏相关的炎症反应有关

○ CCR9：介导T淋巴细胞的发育和迁移

○ Cd6：与免疫细胞激活有关

○ CD24：T 细胞存活

○ CD29：整合素β-1

○ CD31（PECAM-1；血小板/内皮细胞粘附分子-1）

○ 特征：130-kDa糖蛋白、跨膜蛋白

○ 免疫球蛋白超家族基因之一

○ 在内皮细胞、血小板、白细胞等中表达

○ 功能1. 参与细胞间相互作用：白细胞-内皮细胞或内皮细胞-内皮细胞

○ 功能2. 激活白细胞中的整合素→激活炎症反应

○ 功能3. 血管生成和血管稳定

○ CD46：限制补码功能

○ CD55：限制补体功能

○ CD58：与淋巴细胞粘附有关

○ CD69：T细胞早期激活标志物

○ CD74：促炎剂。乳腺癌转移性肿瘤生长的已知标志物

○ CD80：T细胞共刺激

○ CD163：清道夫受体

○ CD276

○ 编码免疫检查点受体 B7-H3，参与 T 细胞调节

○ 在肿瘤血管系统中过度表达

○ 正在进行的实体瘤癌症免疫治疗临床试验的目标

○ CD320：免疫球蛋白

○ CD44

○ 乳腺癌干细胞样细胞的已知标志物并稳定 Treg 持久性

○ CDC7：CDC7 抑制可延迟或阻止逃避靶向治疗。

○ Cdkn1a：细胞周期抑制剂

○ Cdh17

○ 编码钙粘蛋白

○ 钙粘蛋白与 Wnt 信号传导的激活相关

○ CHIT：编码壳三糖苷酶

○ CLIC6：IPF 中上调的关键基因

○ CLU

○ 编码簇蛋白：75-80 kDa。通过二硫键连接的异二聚体蛋白质

○ 与细胞碎片清除和细胞凋亡有关

○ COL1A1：I型胶原蛋白

○ 细胞外基质。

○ 激活的成纤维细胞标志物之一。

○ 正常成纤维细胞和癌性成纤维细胞均表达COL1A1。

○ 它通过激活成纤维细胞促进肿瘤生长抑制。

○ COL1A2：I 型胶原蛋白

○ 细胞外基质。

○ 激活的成纤维细胞标志物之一。

○ 正常成纤维细胞表达COL1A2，而癌性成纤维细胞中，COL1A2 的表达受到甲基化的抑制。

○ 它通过激活成纤维细胞促进肿瘤生长抑制。

○ Col3a1：与结直肠癌的不良预后相关。

○ Col4a1：与胶原蛋白合成有关

○ Col4a2：与胶原蛋白合成有关

○ Col6a3（VI 型胶原蛋白 α3）：肝纤维化的生物标志物

○ Col7a1：与胶原蛋白合成有关

○ Col12a1：与胶原蛋白合成有关

○ COL22A1

○ 编码 XXII 型胶原蛋白 α1 链» ○ 在骨骼肌或心肌的肌肉肌腱连接处表达

○ 脑脊液1

○ 编码对骨髓细胞的激活和分化很重要的细胞因子

○ GM-CSF（粒细胞巨噬细胞集落刺激因子）

○ GM-CSF 受体的 β 链在大多数静息 T 细胞中不表达：这是为了防止过度反应。

○ GM-CSF 受体的 α 链激活需要比正常水平更高的 GM-CSF 表达。

○ Cst7：阿尔茨海默病中淀粉样β斑块炎症的生物标志物。

○ CTHRC1：病理性、肺纤维化相关成纤维细胞标志物

○ CXCL8：中性粒细胞趋化剂

○ CXCL12

○ 由 CAF 和其他基质细胞分泌。

○ 案例1. 自分泌时尚→促纤维增生激活

○ 案例2. 旁分泌方式→免疫细胞趋化性调节

○ CXCL13：B细胞趋化剂，免疫细胞归巢

○ Cyp2e1：肝脏中央小叶标志物

○ 数据中心网络

○ 在成纤维细胞中表达

○ 与I型胶原蛋白和II型胶原蛋白结合到基底膜上

○ Dlx2：转录因子 Dlx2 决定神经元前体的 GABA 能分化。

○ DMMT1

○ 参与启动子 DNA 表观遗传调控的转录因子

○ 爱洛夫

○ 促进脂肪酸碳链伸长。

○ ENG：免疫调节相关基因

○ FASN：侵袭性癌细胞的生物标志物

○ FGF2

○ 促肿瘤血管生成因子，可诱导乳腺癌化疗耐药

○ FGFR1

○ 诱导肿瘤中巨噬细胞和 MDSC 的募集

○ FOLH1

○ 内切PSMA（前列腺特异性膜抗原）

○ 从取消细胞系中分离出的抗原

○ 本来肿瘤级别高的话，一般都会有neotigen，表达量也较少，但是肿瘤级别越高，表达越多

○ PSA 在血清中被识别，但 PSMA 在细胞膜中表达，而不是在血清中表达

○ 抗 PSMA 抗体：J591

○ 前列腺癌的标准治疗正在改为PSMA靶向放射药物

○ FOXA1：乳腺癌和前列腺癌细胞所需的先驱转录因子。

○ Gad1：参与合成抑制性神经递质 GABA 的谷氨酸脱羧酶

○ Gad2：晚熟标记

○ GATA4：已知的先天性心脏病基因。

○ GDF15：T细胞抑制剂

○ GFAP：脑白质中的表达。胶质增生标记

○ GLI2

○ 一种主要的 Hedgehog 通路调节因子。

○ 在成纤维细胞中表达。

○ 它通过增强生长因子 IGF、WNT、FGF 和 HGF 的产生来形成生态位支持激素响应信号。

○ GLS：可以将谷氨酰胺代谢为谷氨酸

○ 古尔

○ 肝脏中央小叶标记

○ 催化谷氨酸代谢为谷氨酰胺

○ GM42418

○ 在实体瘤坏死区大量表达

○ GPR15：T 细胞贩运

○ GZMA（颗粒酶A）：构成CYT（细胞溶解活性评分）

○ GZMK：与炎症反应中的免疫系统功能障碍相关

○ HAVCR2：编码免疫检查点受体 TIM-3

○ [HBB](https://nate9389.tistory.com/2209#:~:text=%E2%91%A1-,HBB,-(血红蛋白%20亚基%20beta)

○ 血红蛋白基因

○ 最有效的哺乳动物 mRNA 之一

○ 积极应用于mRNA翻译及稳定性测试

○ HCN1：编码 HCN 通道的主要成孔亚基

○ HLA：与人体免疫力有关

○ Icam1：与免疫细胞招募相关

○ IGFBP：胰岛素反应

○ IGFBP2：特发性肺纤维化（IPF）的生物标志物

○ IGHA：IgA

○ IGHG：IgG

○ Il10ra：与免疫细胞招募相关

○ INSR：胰岛素反应> ○ IRF7：规范的 1 型干扰素标记物。促进转移

○ Itgal：与免疫细胞招募相关

○ JAZF1

○ 与另一种锌指蛋白 1 并列编码

○ 参与脂质代谢、糖代谢、胰岛素敏感性等

○ KLK3

编码PSA（蛋白特异性抗原）

与 PSMA 不同，存在于血清中

○ KLRC2：T细胞凝集素

○ LCN（脂质运载蛋白-1）

○ 人类基因组中有19种类LCN基因

○ 小鼠基因组中有45个LCN样基因

○ 多见于实体瘤坏死区

○ Lmod3：与线状肌病相关

○ Lrat：编码卵磷脂视黄醇酰基转移酶

○ 马拉特1

○ lncRNA MALAT1 是细胞核最富集的基因之一。

○ 影响T细胞的调节功能

○ 米夫

○ 分泌配体。

○ 它在免疫和炎症调节中发挥多效性作用，有助于肿瘤免疫逃避。

○ 它限制组织内巨噬细胞的运动。

○ MKI67：增殖标记。编码 Ki-67

○ Mmp3：与ECM分解有关

○ MMP7：肺纤维化标志物

○ MOBP：在脑白质中大量表达。少突胶质细胞的标记基因。

○ 女士1

○ 同源盒基因

○ Encodoes 与 WNT5A 相关的转录因子

○ Ncf4：与免疫细胞激活有关。

○ NDRG1：与缺氧有关。

○ NKX2-1：在脑-肺-甲状腺综合征中观察到该基因的突变

○ NR4A1：T 细胞功能障碍的关键介质

○ Nrxn2：编码 Neurexin 2，脊椎动物神经系统的关键基因

○ NSF：参与囊泡与细胞器的融合。

○ ODC1：催化多胺生物合成的第一步。

○ PCNA：细胞增殖标志物

○ PDCD1：编码免疫检查点受体 PD-1

○ Pdgfra：对少突胶质细胞分化至关重要

○ PDPN：足足蛋白

○ PIK3AP1：编码 Toll 样受体 (TLR) 信号传导接头，对于将 TLR 与磷酸肌醇 3 激酶 (PI3K) 激活联系起来至关重要。

○ Plcg2：与免疫细胞激活相关

○ 普拉瓦普

○ 介导微血管通透性

○ 形成小窝和跨内皮通道所需的

○ 肿瘤血管系统也增加

○ 准备工作

○ 在成纤维细胞中表达

○ 编码 Prolargin，一种细胞外基质蛋白

○ 与I型胶原蛋白和II型胶原蛋白结合到基底膜上

○ PRF1（perforin-1）：构成CYT（细胞溶解活性评分）

○ PRSS23：一种与乳腺癌细胞增殖相关的丝氨酸蛋白酶

○ Psmb8：相关抗原呈递

○ RARRES2：T细胞趋化因子

○ Rbp1：视黄醇结合蛋白

○ RORC：编码 RORγt

○ RPL18：通过[mTOR]激活蛋白质翻译(https://nate9389.tistory.com/1424#:~:text=%E2%91%B8%20%EC%A2%85%EB%A5%98%204.-,mTOR,-(mammalian%20target%20of)

○ S100A4、S100a4

○ 与先天免疫相关

○ HIF-1 促进的缺氧诱导基因

○ 通过促进肿瘤血管生成与癌症转移相关

○ S100A8 (MRP8)

○ 由93个氨基酸组成

○ 与钙、锌等二价阳离子结合良好

○ 因100%溶解于饱和硫酸铵而得名S100

○ 与内在免疫相关：由中性粒细胞、单核细胞和巨噬细胞释放

○ 中性粒细胞胞浆蛋白45%

○ 单核细胞来源的细胞持续低水平分泌S100A8

○ 螺旋-环-螺旋结构

○ S100A8 同二聚体不稳定，以 S100A8/S100A9 异二聚体形式存在

○ 被称为炎症反应标记基因» ○ 实体瘤坏死区大量发现

○ S100A9 (MRP14)

○ 由113个氨基酸组成

○ 与钙、锌等二价阳离子结合良好

○ 因100%溶解于饱和硫酸铵而得名S100

○ 与内在免疫相关：由中性粒细胞、单核细胞和巨噬细胞释放

○ 中性粒细胞胞浆蛋白45%

○ 单核细胞来源的细胞持续低水平分泌S100A9

○ 螺旋-环-螺旋结构

○ 被称为炎症反应标记基因

○ 实体瘤坏死区大量发现

○ SDS：肝脏门脉小叶标志物

○ SELENBP1：硒转运蛋白

○ 卖：与先天免疫有关

○ Sema7a：参与内皮细胞内的分化和信号传导。

○ Serpini1：轴突生长

○ Sfrp1：Wnt信号调制器

○ Six6：参与眼睛发育的关键基因

○ Slc1a2：谷氨酸转运蛋白

○ Slc17a6/7/8：谷氨酸神经递质转运蛋白

○ Slc25a4：离子交换

○ Slc32a1：GABA 神经递质转运蛋白

○ SLC46A3

○ 溶酶体转运蛋白

○ 脂质纳米颗粒摄取的负调节剂

○ Smad6：在维持内皮细胞的屏障功能中发挥着至关重要的作用

○ Sox2：参与神经组织的发育和视神经的形成

○ SPI1：NCF2 基因的调节因子

○ SPIC：调节骨髓谱系基因

○ Spp1

○ 编码骨桥蛋白

○ 促血管生成

○ SPRY1 : MAPK 调节器

○ SRRM2

○ 剪接体的组成部分

○ SRRM2 蛋白是核斑点 (NS) 的关键标志物。

○ 通过液体冷凝组织NS形成。

○ Syt1：囊泡运输

○ TAGLN：肿瘤抑制因子

○ Tap1：与抗原呈递相关

○ Tap2：与抗原呈递相关

○ TBX5：先天性心脏病基因

○ TCF7：编码TCF-1的基因。 Tex祖细胞

○ TEAD4：参与Hippo信号通路的转录因子

○ TGFB2 (TGF-β2)：激活TGFβRⅢ，诱导p38 MAPK表达，导致休眠

○ TGM1：分化标记物转谷氨酰胺酶1

○ THRA1/BTR：唯一包含“/”的人类基因名称

○ THY1（Thy-1）：促进抗体的产生

○ TIM-3

○ TIM-3受体以半乳糖凝集素9为配体。

○ 有膜结合型和可溶型两种。

○ TINCR：表皮终末分化（蛋白结合RNA）

○ TMBIM6：它通过 mTORC2 和 AKT 激活在癌症进展中发挥作用。

○ TOX：编码 T 细胞耗竭的关键 TF 的基因

○ TRIM2：与调节肺纤维化相关

○ TRIM8：E3 泛素连接酶

○ TSC2：编码 mTOR 的负调节因子

○ Tubb2b：微管蛋白 beta-2B 链

○ WNT5A、Wnt5a

○ 编码与[Wnt信号通路]相关的细胞因子(https://nate9389.tistory.com/1424#:~:text=%E2%91%B7-,Wnt%20signaling,-%3A%20Frizzled%20receptor)

○ 该基因突变导致罗宾诺综合征

输入：2022.06.02 20:52

7212

基因库

1.概述

2.每个基因的描述

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