第 1-1 章。生物大分子的疏水指数
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1. 类型 1. 积分膜蛋白和水病图
2. 类型2. 亲水亲油平衡
1.类型 1. 整体膜蛋白和亲水图
⑴ 概述
①整合膜蛋白：渗透到细胞膜疏水核心的膜蛋白。
② 亲水图：也称疏水坐标。
③跨膜区：一般来说，跨膜区由约20个疏水性氨基酸组成。
⑵ 氨基酸的疏水性系数（HI）：值越大，氨基酸的疏水性越高。
表 1. 氨基酸缩写
○ A：1.8
○ C：2.5
○ 深度：-3.5
○ E：-3.5
○F：2.8
○ 重力：-0.4
○ 高度：-3.2
○ 我：4.5
○ K：-3.9
○ 长：3.8
○ 米：1.9
○ 氮：-3.5
○ 压力：-1.6
○ 问：-3.5
○ 电阻：-4.5
○ S：-0.8
○ 温度：-0.7
○ 五：4.2
○ 宽：-0.9
○ Y：-1.3
⑶ 分析方法
① 步骤1. 将跨膜片段大小对应的19个氨基酸设置为窗口大小。
② 步骤2. 将X N 端的19 个氨基酸定义为Segment 1 并计算平均HI。
③ 步骤3. 将Segment 1 向C 端移动一个氨基酸，定义Segment 2 并计算平均HI。
④ 步骤 4. 重复 步骤 3 直至到达 X 的 C 端。
⑤ 步骤 5. 在图表上绘制每个分段的平均 HI。
⑥ 步骤 6. 将跨膜区域推断为具有高疏水区域（即高平均 HI 值）的片段。
2.类型 2. 亲水亲油平衡 (HLB)
⑴ 格里芬的计算方法
① Mh: 分子内亲水部分的质量
② M：分子总质量
③ 产生 0 到 20 之间的值。
④ 不同类型表面活性剂的HLB值
图 1. 不同类型表面活性剂的 HLB 值
⑵ 戴维斯计算法
① m：分子中亲水基团的数量
② Hi：第i个亲水基团的H系数
③ n：分子中亲脂基团的数量
输入：2019.03.12 14:42