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数据分析:Kaplan-Meier 生存曲线

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1. 本次死亡的患者人数

2. 审查数量

3. 到目前为止幸存的概率

4. R 代码

5. Python 代码

6. 分析指标



总时间(t) 死亡患者人数 (d) 至今存活的患者人数 (n) 审查数量 在此期间的死亡概率 (d/n) 此期间的生存概率 (1 - d/n) 到现在为止还活着的概率(L)  
6 1 23 23 0 0.0435 0.0435 0.9565 0.9565 0.9565 0.9565
12 12 1 22 22 0 0.0455 0.0455 0.9545 0.9545 0.9130  
21 21 1 21 21 0 0.0476 0.0476 0.9524 0.9524 0.8695 0.8695
27 27 1 20 0 0.0500 0.9500 0.8260  
32 32 1 19 19 0 0.0526 0.0526 0.9474 0.7826  
39 39 1 18 18 0 0.0556 0.0556 0.9444 0.7391  
43 43 2 17 17 1 0.1176 0.1176 0.8824 0.6522  
89 89 1 14 14 5 0.0714 0.0714 0.9286 0.9286 0.6056 0.6056
261 261 1 8 0 0.1250 0.8750 0.5299 0.5299
263 263 1 7 0 0.1429 0.1429 0.8571 0.4542  
270 270 1 6 1 0.1667 0.1667 0.8333 0.3785 0.3785
311 311 1 4 0.2500 0.7500 0.2839 0.2839

表 1. Kaplan-Meier 生存曲线示例


1.本次死亡人数(死亡人数)

⑴ 第一排23人,表示时间为0时,有23人还活着。

⑵ 第二排22人意味着时间为6时有22人还活着。

⑶ 有时显示存活患者人数(处于危险中的人数),有时不显示。



2. # 已审查

⑴ 审查是指因不再住院等原因没有进一步记录。

⑵ 假设被审查的患者与其他幸存者具有相同的生存概率。

⑶ 通常在图表上用⊕符号标记。



3.到目前为止幸存的概率

⑴ 存活到时间 12 的概率 = 0.9130 = 存活到时间 6 的概率 × 这段时间(6 ~ 12)存活的概率 = 0.9565 × 0.9545

⑵ 存活到时间 21 的概率 = 0.8695 = 存活到时间 12 的概率 × 这段时间(12 ~ 21)存活的概率 = 0.9130 × 0.9524



4. R代码

⑴ 与生存曲线相关的R代码(考虑# of censored)


受保护_0


스크린샷 2024-04-13 오전 10 51 57


⑵ 如果添加 p 值 : 注意,以下代码是假设的,与上表无关。


受保护_1



5. Python 代码


受保护_2


스크린샷 2024-04-13 오전 10 52 36



6.分析指标

⑴ 组间差异检验统计量

① 对数秩检验(Mantel–Cox 检验)

② Wilcoxon(Breslow)检验

③ Tarone-Ware 测试

⑵ 评估生存曲线本身的指标

① 一致性指数(C-index)

② Brier 综合评分(IBS)

③ 曲线下面积

聚类比较指标(例如AMI)



输入 2021.04.13 17:29

更新 2024.03.11 21:42

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