第 8-2 章。微生物学中心法则
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1. 转录调控
2. 信号转导
3. 代谢调节
1.转录调控
⑴ 方法1. DNA结合蛋白
①蛋白质和核酸之间的相互作用
○ 非特异性相互作用：常见于真核细胞和古细菌。
○ 具体相互作用
② 结构1. 螺旋-转角-螺旋基序
○ 识别螺旋：与 DNA 特异性相互作用。
○ 转：由三种氨基酸组成，第一种通常是甘氨酸。
○ 稳定螺旋：通过与识别螺旋的疏水相互作用来稳定识别螺旋。
③ 结构2. 锌指
○ 常见于真核调节蛋白中。
○ 与锌 (Zn) 离子结合。
○ 识别螺旋：α 螺旋的一部分。与 DNA 大沟结合。
○ DNA 结合蛋白至少含有两个锌指。
④ 结构3. 亮氨酸拉链
○ 包含每七个氨基酸出现一个亮氨酸残基的区域。
○ 不直接与 DNA 结合，但与两个识别螺旋结合，影响 DNA 方向。
⑤ 结构 4. 螺旋-环-螺旋基序
⑥ 示例 1. 诱导子和核心抑制子
⑦ 实施例2. 乳糖操纵子
⑧ 示例 3. 大肠杆菌中的麦芽糖代谢：由调节子调节。
⑨ 实施例 4. 由海马甲烷球菌（产甲烷菌）在固氮过程中合成的 NrpR 蛋白受到转录调控。
⑩ 实施例 5. 激烈火球菌（嗜热菌）缺乏葡萄糖转运蛋白，但会进行糖酵解，涉及 TrmBL1，它既充当阻遏剂又充当激活剂。
⑵ 方法2. sRNA（小RNA）：40~400个核苷酸
⑶ 方法3. 核糖开关
⑷ 方法4. 衰减
① 实施例1. 色氨酸操纵子
2.信号转导
⑴ 方法1. 二元调控系统：大肠杆菌大约有50个二元调控系统。
表 1. 大肠杆菌中的双组分调控系统
① 实施例 1. 大肠杆菌中的渗透调节：涉及 OmpC、OmpF、OmpR 和 EnvZ。
② 示例 2. 趋化性：涉及 MCP、CheA、CheW、CheY 和 CheB。
③ 实施例3. 鞭毛蛋白旋转的调节：涉及CheY和CheP。
④ 示例 4. 群体感应：检测邻近细胞密度
⑤ 实施例5. 产志贺毒素大肠杆菌的毒性：涉及AI-3。
⑥ 实施例6. 金黄色葡萄球菌的毒性：涉及ArgA、ArgB、ArgC和ArgD。
⑦ 实施例7. 大肠杆菌中的营养剥夺反应：ppGpp 产量增加抑制细胞分裂。
⑧ 实施例 8. C. crescentus 的营养剥夺反应：增加 ppGpp 产量可增强运动性。
⑨ 实施例 9. 结核分枝杆菌对宿主免疫反应的反应：ppGpp 产量的增加增强了持续细胞的形成。
⑩ 示例 10. 全球网络
表 2. 全球网络
⑪ 实施例11. 链霉菌中的双组分调节系统：涉及PhoR（膜结合组氨酸激酶传感器蛋白）和PhoP（细胞质转录调节因子）。
⑫ 实施例 12. 大肠杆菌中的热应激反应：涉及 DnaK (≒ Hsp70)、GroEL (≒ Hsp60)、GroES (≒ Hsp10) 和 RpoH (σ32)。
3.代谢调节
⑴ 方法1. 反馈抑制⑵ 方法2. 翻译后调控
① 实施例1. PPII信号转导：涉及PII和GlnD。
② 实施例2. sigma因子失活：涉及RpoE和RseA。
输入：2022.07.12 23:06