细胞类型标记基因
高级类别:【生物信息学】【生物信息学索引】(https://jb243.github.io/pages/836)
1. 概述
2. 1型. 上皮细胞
3. 2型. 内皮细胞
4. 3型. 免疫细胞
5. 4型. 基质细胞
6。类型5. 其他
a. 基因库
b. 基因评分库
1.概述
⑴ 人体由【超过400种不同类型的细胞】组成(https://www.science.org/doi/10.1126/science.abl4896#:~:text=reference%20atlas%20for-,more%20than%20400%20cell%20types,-of%20the%20 human)
⑵ 表示规则
① 当指代基因时,用斜体表示,当表示基因的蛋白质产物时,用斜体表示
② 不过这里我统一用纯文本
⑶ Homo sapiens (人类)
① 基因全部大写
② 基于GRCh38参考(ENSG)的36601个基因
⑷ Mus musculus(小鼠)
① 基因仅第一个字母大写,其余均为小写
② 基于mm10参考(ENSMUSG)的32285个基因
⑸ 【人鼠同源性】(https://jb243.github.io/pages/2156#:~:text=Gene%20homology%20 Between%20 human%20and%20mouse)
⑹ 事实上,通常区分仅高表达和排他表达(+)。
⑺ 数据1. Tabula Spaiens:基本上,以下细胞类型列表是基于Tabula Sapiens(文件)
⑻ 数据2. Tabula Muris (ref, 文件)
⑼ 数据3. Tabula Microcebus (文件)
⑽ 数据4. 如何提取适用的标记基因请参考sc-type算法 (file)
⑾ 数据5. PanglaoDB: PanglaoDB总数据库
⑿ 数据 6. SCEVAN: SEVAN 补充数据
⒀ 数据7. 按组织的相对细胞分布 (参考)⒁ 数据8. CellMarker 2.0: <a href = “https://blog.kakaocdn.net/dn/HhtlU/btsmseikV1o/i8ltfrUXZH2innRQnvTbE0/Cell_marker_All.xlsx?attach=1&knm=tfile.xlsx”>CellMarker_All.xlsx</a>
⒂ 数据 9. HCA(人类细胞图谱)
⒃ 数据 10. 3CA(魏茨曼科学研究所)
⒄ 数据11. STdeconvolve
⒅ 数据 12. CCLE([参考](https://nate9389.tistory.com/840),[文件](https://drive.google.com/file/d/1O_52q9ttLSQoUPbhR3t5K_0bqtYvv6Js/view?usp=sharing))
⒆ 数据13. cellxgene数据库:可以在下面找到CL:0001061等细胞本体信息文件 或链接。
⒇ 数据 14. MeSH 术语(例如,成纤维细胞)
⒇ 数据 15. 单细胞门户
⒇ 数据 16. Bgee
⒇ 数据 17. BRAIN Initiative 细胞普查网络 (BICCN)
⒇ 数据 18. 人类生物分子图谱
⒇ 数据 19. HuBMAP
⒇ 有关其他信息,请参阅 https://typeset.io/、https://www.scinapse.io/,它们策划了数十亿篇论文。
2. 1. 型上皮细胞
⑴ 概述:泛上皮细胞
① (+) EPCAM、KRT19、Epcam、Krt8、ANKRD30A、MUC6、MYBPC1
② (+) PATE4、SEMG1、PRPS2、SEMG2、ENPP3、FADS2、GSTM3、ABCG2、ELF5、PNMT(白板)
③ (+) 4833423E24Rik、Krt33b、Cryba2、Bnc1、Krtap3-2、Sox21、Nmu、Gabrp、Clca4、Krt75(白板)
④ (+) CD24、CEACAM1、AGR2、GPA33、CEACAM5、SFN、TSTD1、PIGR、MUC13、SELENBP1、ELF3、TSPAN1、GUCA2A、PHGR1、LGALS4、TSPAN8、VSIG2、EPCAM(PanglaoDB)
⑤ (+) SLPI、KRT7、ELF3、KRT19、FXYD3、PIGR、AGR2、WFDC2、TACSTD2、CLDN4 (3CA)
⑵肾上腺皮质上皮
① 1.类肾小球带上皮细胞
○ (+) Akr1b7,星
⑶基底细胞
① (+)KRT5、KRT14、KRT19、TP63
② (+) PTPRZ1、TP63、DSC3、KRT14、S100A2、CLCA2、MIR205HG、KRT15、EXPH5、DENND2C(白板)
③ (+) KRT5、KRT17、ANXA11、PLAU、SRSF4、KRT23、ITGA2、RAB13、LAMB3、ACADVL、HEBP2、KRT15、PLP2、MT1X、S100A14(PanglaoDB)
⑷ 脑上皮
① 1.类脑癌细胞上皮
○ (+) CD44、MBTPS2、PARP1(sc 型)
② 2.类脑癌干细胞
○ (+) FUT4、MSI1、NES、PROM1、SOX2、THY1(sc 型)
③ 3 级 脉络丛细胞
○ (+) Clic6、Cab39l、Rfx3
④ 4.类垂体前叶细胞
⑤ 5.类室管膜细胞(室管膜细胞、室管膜胶质细胞)
○ (+) Cdc153
○ (+) FOXJ1、ENKUR、FAM216B、DNAH12、IQCG、SPEF2、ODF3B、TEKT1、LRRC23、PIFO、DYNLRB2、RSPH1、CCDC153、ZMYND10、CFAP44(PanglaoDB)
⑥ 6. 脑膜细胞
⑦ 7 级. 坦西特
⑧ 8. 大脑皮层层
○ (+) NCAM、Cux2、Lamp5
○ 8-1. 白质
○ (+) MOBP
○ 8-2. 灰质
○ (+) SNAP25
○ 8-3. L6
○ (+) KRT17
○ 8-4. L5
○ (+) PCP4
○ 8-5. L4
○ (+) 罗布、罗布
○ 8-6. L3
○ (+) RORB、CUX2、HPCAL1、Cux2、Nova1
○ 8-7. L2
○ (+) RORB、CUX2、Cux2、Nova1
○ 8-8. L1
○ (+) 相关
○ 8-9. 皮质中间神经元
○ (+) 灯5
○ 8-10. 压后皮质
○ (+) Tshz2
⑨ 9级胼胝体
○ (+) 车2
⑩ 10 类. 纹状体
○ (+) Ppp1r1b
○ 10-1. 腹侧纹状体»> ○ (+) Pdyn
⑪ 11 类. 齿状回 (DG)
○ (+) Prox1、Rfx3、C1ql2
⑫ 12 类. 梨状皮层
○ (+) Lmo3, Rfx3
⑬ 第 13 类. 杏仁核
○ (+) Nova1
⑭ 14 类. 下丘脑内侧核团
○ (+) Nova1
⑮ 15 类. 丘脑
○ (+) Tcf7l2
⑯ 16 类. 室管膜
○ (+) Nnat
⑰ 17类. 海马和CA(cornu ammonis)
○ (+) Prox1、Neurod6
○ 17-1. CA1
○ (+) Wfs1
○ 17-2. CA2
○ 17-3. CA3
○ (+) Chgb
○ 17-4. CA4
⑱ 第 18 类. VLMC(血管和软脑膜细胞)
○ (+) Slc6a13
⑸ 癌上皮
① (+) CD44、EPCAM、ERBB2、FOLH1、KRT18、PROM1、KIT、CLDN4
② 反洗钱
○ (+) MPO
○ 1. 恶性标志物
○ (+) EIF4A1、CDK6、CAT、SPINK2、MSRB3、EIF3E、EIF2S3、PSMA6、ANGPT1、RSL1D1 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) PCNP、CFD、SPN、DSE、RNA酶2、SRGN、EMB、MNDA、TPM3、CLEC12A (3CA)
③ B16F10
○ (+) DCT、PMEL、TYRP1、MLANA
④膀胱癌
○ (+) KRT7、KRT14
⑤乳腺癌
○ 1. 恶性标志物
○ (+) ANKRD30A、ESR1、TRPS1、PBX1、BMPR1B、GATA3、ERBB4、AFF3、ASH1L、PRLR (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) ABCC11、APOBEC3B、AR、CAV1、CCND1、CDH1、CEACAM6、CENPF、CXCL12、EGFR、ERBB2、ESR1、FOXA1、GATA3、KIT、KRT7、LDHB、LRRC15、MDM2、MKI67、PCLAF、PGR、PTGDS、RUNX1、S100A4、 SCD、SFRP1、SNAI1、TACSTD2、TCF4、TOP2A、ZEB1、ZEB2
○ (+) ANKRD30A、TRPS1、ESR1、MGP、PRLR、TBC1D9、PIP、ELAPOR1、PBX1、ERBB4 (3CA)
⑥ CCRCC(透明细胞肾细胞癌)
○ 1. 恶性标志物
○ (+) NNMT、ANGPTL4、RARRES2、FABP7、TMEM176A、IGFBP3、CP、EGLN3、VEGFA、HILPDA (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) NDUFA4L2、NNMT、ANGPTL4、CRYAB、HILPDA、SLC3A1、EGLN3、IGFBP3、CA9、CNDP2 (3CA)
⑦胆管癌
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) CXCL6、CDA、TESC、ONECUT2、ITGB1、AGFG2、LMTK3、C4orf48、LRCH4、CCL20 (3CA)
⑧慢性粒细胞白血病
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) HNRNPH1、H3-5、MPL、ARHGDIB、SPINK2、SRSF6、ANKRD10、CD69、TRA2A、PPIAL4G (3CA)
⑨ CRC(MSS)
○ (+) CEACAM5
○ 1. 恶性标志物
○ (+) AREG、GDF15、DPEP1、MYC、ASCL2、CEACAM6、RBCK1、PRAP1、S100P、KRT23 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) CXCL3、AREG、CDX1、CEACAM5、PHGR1、CLDN3、DPEP1、FAM3D、IER3、PHLDA2 (3CA)
⑩CT26
○ (+) BAIAP2L1、RPL39L
⑪ 弥漫大B细胞淋巴瘤
○ 1. 恶性标志物
○ (+) GTSF1、IRAG2、HMGA1、RGS13、GPHPR、RBBP7、IFT57、AIM2、BASP1、GMDS (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) CD79B、CD79A、TCL1A、MS4A1、CORO1A、NCF1、CD37、LIMD2、LTB、HLA-DQA1 (3CA)
⑫EMT6
○ (+) RBP1、CRABP2
⑬ 室管膜瘤
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) C9orf24、SPAG6、ELN、IGF2、PLTP、DYNLT5、CFAP126、ZMYND10、ARMC3、PSAT1 (3CA)
⑭ GBM
○ (+) GFAP
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) PTPRZ1、PMP2、NOVA1、QKI、SCRG1、MT3、CADM2、PTN、NLGN1、LHFPL3 (3CA)
⑮肝癌
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) APOA2、APOC3、APOC1、ALB、AMBP、RBP4、APOE、TF、AHSG、TTR (3CA)
⑯ 头颈部鳞状细胞癌
○ (+) KRT75
○ HNSCC(HPV 阴性)
○ 1. 恶性标志物
○ (+) KRT5、KRT17、KRT6A、CXCL14、KRT14、KRT6B、TP63、FABP5、COL17A1、DSG3 (3CA)
○ 2 型. 癌症类型标记物
○ (+) KRT14、KRT6B、LGALS7、CLCA2、ISG15、IFI27、LGALS7B、GJB2、SERPINB5、IGFBP6 (3CA)
○ HNSCC(HPV 阳性)
○ 1. 恶性标志物
○ (+) CDKN2A、CALML5、KRT17、CCL20、CSTA、S100A2、LY6K、SLC2A1、CENPW、PCNA (3CA)
○ 2 型. 癌症类型标记物
○ (+) CALML5、FDCSP、CSTA、S100A8、S100A9、TACSTD2、PITX1、KREMEN2、RHCG、SPRR3 (3CA)
⑰肾癌
○ (+) CD70
⑱ LL2
○ (+) RPL29、KRT18>⑲肺腺癌
○ 1. 恶性标志物
○ (+) CEACAM6、NAPSA、PHLDA2、GDF15、ABCC3、TCIM、OCIAD2、TXNDC17、HOPX、MAL2 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) SFTPB、SCGB3A2、NAPSA、HOPX、SCGB3A1、SLC34A2、SFTA2、SCGB1A1、RNA酶1、C16orf89 (3CA)
⑳ 肺鳞癌
○ 1 型. 癌症类型标记物
○ (+) AKR1C2、AKR1C1、AKR1B10、ADH7、EIF5AL1、CBR1、GSTM3、EIF4EBP1、ALDH3A1、CDK5RAP2 (3CA)
㉑ 恶性
○ (+) MCM7、NME1、NONO、PFDN2、MZT2A、NHP2、VBP1、C1orf43、CCT3、TXNRD1 (3CA)
㉒MC38
○ (+) FAM159B、SNHG9
㉓ 黑色素瘤
○ 1. 恶性标志物
○ (+) PMEL、S100B、TYR、PRAME、MIA、CAPN3、MLANA、APOD、PLP1、GPM6B (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) PMEL、TYR、MLANA、APOD、CAPN3、SERPINE2、MIA、SDCBP、PRAME、S100B (3CA)
㉔MM
○ 1. 恶性标志物
○ (+) GNAS、NME2、SYVN1、CDV3、TENT5C、CANX、KRTCAP2、HSPA5、SLAMF7、SRPRA (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) TENT5C、JCHAIN、SLAMF7、UBE2J1、FKBP11、DERL3、SYVN1、HSP90B1、MZB1、TNFRSF17 (3CA)
㉕ 神经母细胞瘤
○ 1. 恶性标志物
○ (+) ELAVL4、CD24、PCSK1N、TUBB2B、NPY、UCHL1、CNTNAP2、MAPT、NCAM1、BEX1 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) STMN2、HAND2、RBMS3、PHOX2A、ELAVL4、RTN1、NPY、CNTNAP2、RBFOX1、ZFHX3 (3CA)
○ 3.型脑癌细胞上皮
○ (+) CD44、MBTPS2、PARP1(sc 型)
○ 4型. 脑癌干细胞
○ (+) FUT4、MSI1、NES、PROM1、SOX2、THY1(sc 型)
㉖ 卵巢癌
○ 1. 恶性标志物
○ (+) CD9、KRT8、S100A1、PCBD1、GFUS、PCSK1N、TNNT1、POLR2H、SLC39A4、SNRPE (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) SOX17、RHEX、CMTM7、KLK7、PTGS1、MUC16、DMKN、SPON1、KCNK15、PAX8 (3CA)
㉗ PDAC
○ 1. 恶性标志物
○ (+) CD24、GPRC5A、ANKRD36B、KRT19、LAMC2、LAMA3、ITGA3、COL17A1、TMPRSS4、ITGB4 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) MMP7、CLDN18、SYT8、GCNT3、ADAM9、TFF1、CTSE、C19orf33、VILL、SDCBP2 (3CA)
㉘ 前列腺
○ (+) FOLH1, KLK2
○ 1. 恶性标志物
○ (+) MESP1、PPP3CA、MZT2A、ODC1、MZT2B、TM7SF2、NME4、TIMM13、MBOAT2、DDT (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) KLK3、KLK2、NKX3-1、PDLIM5、KLK4、SLC45A3、ACP3、TRPM4、LRRC26、FOLH1 (3CA)
㉙SA1N
○ (+) ITIH3
㉚ 小细胞肺癌
○ 1. 恶性标志物
○ (+) HES6、CHGA、STMN1、SEC11C、CDKN2A、TUBB2B、UCHL1、GRP、ASCL1、BEX1 (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) GRP、HES6、ASCL1、INSM1、UBE2S、CALCA、H1-10、BOLA2B、PCSK2、ACYP1 (3CA)
㉛ 胃癌
○ (+) CEACAM6
㉛甲状腺癌
○ (+) TSHR、TG
㉛ 肾母细胞瘤
○ 1. 恶性标志物
○ (+) MXRA8、BCAM、WT1、CLIC5、PTPRO、IGFBP2、PCOLCE2、TCF21、MME、SBSPON (3CA)
○ 2. 癌症类型标记物
○ (+) PODXL、CCN2、TCF21、IGFBP7、CLIC5、NPHS2、BCAM、MME、NHSL2、MXRA8 (3CA)
㉛ 主要癌症生物标志物
图 2. 主要癌症生物标志物
⑹ 纤毛上皮细胞
① (+) FOXJ1、PAEP、UCA1、SCGB1D2、RP11-519G16.5、DCDC2、C2orf88、LAMC2、SCGB2A1、OCLN(白板)
⑺ 眼上皮
① 1.类角膜上皮细胞
○ (+) KRT3、KLF6(sc型)
○ (+) KRT12、MUC22、MGARP、CTSV、ERICH5、RP11-96L14.7、CRTAC1、KRT3、RAET1L、CREG2(白板)
② 2. 角膜角质细胞» ○ (+) LEPR、LCN1、LACRT、FOXL2、NTRK2、OGN、BOC、CHRDL1、OMD、NECAB1(白板)
③ 3.类眼睛感光细胞
○ (+) RBP3、RS1、KCNV2、IMPG1、RDH8、RTBDN、RP11-442N1.1、PDC、CPLX4、RP11-6E9.5(白板)
○ 3-1. 杆状感光细胞
○ (+) Rho、Pdc、NRL、ROM1、CRX、ARR3、CABP4、CACNA1D、DYNLRB2、EDN2、FRMPD2、GJD2、KCNQ5、KCNA4、LRIT1、LRIT2、MAF、MED1、RORB、RP1L1、TSPAN10、TTC8、Gcap2、Samd7、Cerkl、 SAMD11、SLC24A1、RP1、PDE6B(sc 型)
○ 3-2. 视锥细胞
○ (+) Arr3、Opn1sw、NRL、ROM1、CRX、ARR3、OPN1LW、OPN1MW、CABP4、CACNA1D、EDN2、GJD2、GNB3、KCNQ5、LRIT1、MED1、RP1L1、THRB、TSPAN10、TTC8、Opmw、SLC24A1、RP1、PDE6B (sc型)
④ 4.类眼表细胞
⑤ 5.类视网膜色素上皮细胞
○ (+) EZR、RPE65、BEST1、ANO2、BMP2、BMP4、CLU、EFEMP1、IL4、KCNJ5、MED1、RDH5、RGR、SBSPON、TGFBR1、TMEM98、TTC8、TRAF1、Cerkl(sc 型)
○ (+) AC067969.2、RPE65、ITGAV、LINC00276、TMEM98、BEST1、FHIT、RBP1、RLBP1、ITGB8(白板)
⑥ 6类.癌细胞
○ (+) EPCAM (sc型)
⑦ 7. 葡萄膜细胞
⑧ 8. Schwalbe 系细胞
⑻腺体
① 1. 唾液腺腺泡细胞
○ (+) BPIFA2、LPO、PRB2、CA6、PRB1、MUCL1、PRH1、PRB4、PRH2、HTN1(白板)
② 2.类导管上皮细胞
○ (+) TFCP2L1、ANKRD36C、FOLR1、SCGB3A1、CALML5、DMBT1、LRRC26、AZGP1、CCL28、TCN1(白板)
③ 3. 十二指肠腺细胞
○ (+) TFF2、LIPF、C6orf58、GOLM1、A4GNT、KCNE2、FUT9、PGC、AGR2、SCG5(白板)
④ 4.类泪囊上皮细胞
○ (+) SMR3A、PROL1、DCT、LCN1、LINC01474、LACRT、ANGPTL7、KRT12、RP11-54H7.4、PLCB4(白板)
⑤ 5.类泪腺功能单位细胞
⑥ 6.类乳腺管腔上皮细胞
○ (+) SERPINA3、EGLN3、PRSS8、ANGPTL4、HILPDA、ITGB6、RP5-857K21.6、EFHD1、SERINC2、DSG2(白板)
○ (+) KRT18、SLPI、KRT19、CD74、AGR2、SERPINB3、WFDC2、LCN2、BTG1、CLDN4、ANXA1、HMGA1、TNFSF10、HIF1A、CEBPD、KRT8、CD9、AQP3、CDH1、MUC1(PanglaoDB)
⑦ 7类. 粘液分泌细胞
○ (+) MUC5AC、BPIFA1、MUC5B、ANKRD36C、BPIFB1、LINC00342、SLC5A8、MUC4、SLC26A4、TMC5(白板)
⑧ 8.类唾液腺细胞
○ (+) Gstm1、Wfdc18
○ (+) CENPF、NEK2、DEPDC1、TOP2A、MKI67、ANLN、IQGAP3、HMMR、MUC7、KLK5(白板)
⑨ 9.类分泌细胞
⑩ 10. 口腔粘膜的复层鳞状上皮
○ (+) Krt5、Krt15
⑪ 11.类乳腺上皮细胞
○ (+) SERPINB5、KRT5、CLDN4、KRT17、NEDD9、KRT19、KRT7、KRT8、KRT18(PanglaoDB)
⑫ 第 12 类. 甲状旁腺
○ 12-1. 嗜酸细胞
○ 12-2. 甲状旁腺主细胞
⑬ 13类. 乳腺细胞
○ (+) ADAM9、AGR3、ALDH1A3、AQP3、BACE2、C15orf48、C5orf46、CCDC6、CD9、CDC42EP1、CLIC6、CTTN、DAPK3、DMKN、DNTTIP1、DSC2、EIF4EBP1、ENAH、FASN、FLNB、HMGA1、HOOK2、HPX、 JUP、KRT23、LYPD3、MLPH、MYO5B、OCIAD2、OPPRPN、PIGR、PTRHD1、QARS、S100A14、SCGB2A1、SDC4、SERHL2、SERPINA3、SH3YL1、SLC25A37、SLC5A6、SMS、SQLE、SRPK1、SVIL、TCIM、TMEM147、 TOMM7、TPD52、TRAAPPC3、USP53、ZNF562
⑼ 肝上皮
① 1. 胆管细胞:胆管
○ (+) SSTR2、SLC4A2、KRT7、KCNN2、ITGB4、GGT6、CFTR、AQP4、AQP1、PIGR、GGT1、JAG1、GPBAR1、GGT7、KRT19、ONECUT2、ALPL、HNF1B、ALB、AGR2、TFF3、TFF1、SOX9、EPCAM、CLDN4、MMP7、 TFF2、SCGB3A1、FXYD2、DEFB1、CD24、LCN2、CXCL1、CXCL6、LGALS2、TACSTD2、ELF3、SPP1、MUC5B、LGALS4、KRT8(sc 型)
○ (+) CHST4、FGFR2、GC、TM4SF4、APCS、AMBP、AGT、SLC17A4、SEMA3E、CXCL6(白板)
○ (+) PIGR、KRT19、AGR2、TFF3、EPCAM、CLDN4、CD24、LCN2、ELF3、LGALS4(PanglaoDB)
② 2.类癌症干细胞» ○ (+) ANPEP、CD44、EPCAM、POU5F1、PROM1、THY1
⑽肠上皮细胞
① (+) TRDC
② (+) UNC5CL、C1orf177、TRIM31、LINC00955、RP3-417L20.4、HMGN1P20、ALPI、RP11-395B7.2、EGFR-AS1、RP11-462G2.1、DEFB1、CA7、RP11-468N14.13、ARL14、 AC024592.9(sc型)
③ 1.类大肠上皮肠上皮细胞
○ (+) 2610528A11里克
○ (+) MUC12、NXPE1、CLDN3、PHGR1、CDX1、MUC13、RP11-357H14.17、FXYD3、LGALS4、CDH17(白板)
④ 2.类小肠上皮肠上皮细胞
○ (+) RBP2、CCL25、MUC17、PRAP1、CGN、SI、ARL14、FABP2、EPS8L3、CDHR5(白板)
⑤ 3.类大肠上皮潘氏细胞
⑥ 4.小肠上皮潘氏细胞
○ (+) GOLM1、CTSE、ANXA10、ONECUT2、CDHR5、TSPAN8、CDHR2、KRT20、MUC3A、SLC5A1(白板)
⑦ 5. 结肠潘氏细胞
○ (+) CA7、OTOP2、BEST4、GUCA2A、FRMD1、SPIB、CLDN3、HEPACAM2、KRT20、SDCBP2(白板)
⑧ 6. 支气管上皮浆液细胞
○ (+) C6orf58、CXCL17、CCDC129、LINC01482、PRR4、BPIFB1、DMBT1、ATP12A、TCN1、GLYATL2(白板)
⑨ 7类. 气管上皮浆液细胞
○ (+) GLYATL2、BPIFB1、PROM1、MUC5B、BPIFA1、TMC5、SCGB3A1、AGR2、DMBT1、FCGBP(白板)
⑩ 8.类间皮细胞
○ (+) AP000705.7、HAS1、TNNT1、BNC1、DSC3、WT1、WNT10A、C21orf62、PTPRQ、CEMP1、C3、CRB2、KLK11、PHYHIP、TGM1(sc 型)
⑪ 9 类. BEST4+ 细胞
⑫ 区域 1. 绒毛尖端
○ (+) CREB3L3、KLF6、ATF3、JUN、ACE2、MEP1A/B、DEFB1(抗菌肽)、乳糜微粒组装体(MTTP、APOB、DGAT2)、BMP 分子(BMP8A、BMP8AB)、非经典 WNT 配体(WNT5A)、γδ T/NK 基因标记(TRDC、GZMA、GZMB)
○ 1-1. 小鼠绒毛尖端
○ (+) Sct、肠上皮细胞嘌呤代谢基因(Enpp3、Ada、Nt5e、Slc28a2)、Ido1(杯状细胞基因)、免疫抑制基因
○ (-) Il18
○ 1-2. 人体绒毛尖端
○ (+) MHC-I(HLA-A、HLA-B)、MHC-II(HLA-DRA、HLA-DRB1、CD74)、IL18、促炎巨噬细胞基因(C1QC、NLRP3、ADAMDEC1)
⑬ 区域 2. 绒毛中部区域
○ (+) PPARD、HNF1B、TG 再合成酶(MOGAT2、MOGAT3、DGAT1)
⑭ 区域 3. 绒毛底部
○ (+) GSTA2、最经典的簇细胞标记(TRPM5、IL17RB、PLCG2、SH2D6、LY6H)、SLC11A2(铁导入)、AQP1、SCTR、IL11RA、抗菌蛋白(REG3B、REG3G)、TMEM159、BSCL2
⑮ 区域 4. 地窖
○ (+) MYC、HES1、TFRC(铁导入)、AQP1、SCTR、IL11RA、防御反应(REG3A、DMBT1)、TMEM159、BSCL2、BMP4、BMP 抑制分子(GREM1、GREM2)、WNT 配体(WNT2、WNT2B、WNT10A/B)
○ 4-1. 小鼠的隐窝
○ (+) Sst、Chgb
⑾肾上皮细胞
① (+) NAT8、AC093326.1、SLC13A1、MIOX、TMEM27、GLYAT、PDZK1、TINAG、BBOX1、AC009014.3(白板)
② 1. 类 Henle 细胞环
○ (+) UMOD、AQP1、IRX1、IRX2、IRX3、MECOM、POU3F3、TBC1D4、SLC12A1、DEFB1、GEM、RGS5、CYP4B1、DRAM1、NEK6、CDKN1C、CALCRL、CLCNKA、CRYAB、SPP1、PPP1R1B、LRRC66、IGF1、 CLDN1、CLDN10(sc型)
○ (+) CXCL1、GEM、THBS1、PTGS2(PanglaoDB)
○ 1-1. Henle升肢上皮细胞环
○ (+) Slc12a1、Umod、Egf、Wfdc15b、Gpx6、Nccrp1、Clcnka、Ppp1r1a、Kng2、Cldn19(白板)
○ 1-1-1. Henle 厚升肢上皮细胞环
○ (+) KNG1、FXYD2、UMOD、LOC109729779、ATP1B1、ATP1A1、LOC105865250、SLC12A1、DNASE1、LDHB(白板菌)
○ 1-1-2. Henle 薄升肢上皮细胞环
○ (+) SPP1、FXYD2、WFDC2、ZC3H10、KNG1、UMOD、CTSD、S100A6、RPS18、TMEM176B、(Tabula Microcebus)
○ 1-2. Henle 降肢上皮细胞环
○ 1-2-1. Henle 厚降肢上皮细胞环»> ○ 1-2-2. Henle 薄降肢上皮细胞环
○ (+) SPP1、CLU、ZC3H10、PTGDS、FXYD2、RPS18、AQP1、RPL26、CTSD、S100A6(Tabula Microcebus)
③ 2. 集合管细胞
○ (+) Slc12a3、Rhcg、Calb1、Spink8、Pgam2、Uroc1、D630042F21Rik、Hsd11b2、Slc26a4、Emx1(白板)
○ 2-1. α-嵌入细胞
○ (+) ATP6V1G3、ATP6AP2、RHBG、ATP1B1、LOC109729779、RHCG、LOC105879013、FOXI1、AQP6、AU129_gr01(Tabula Microcebus)
○ (+) FOXI1、OXGR1、ATP6V1G3、AQP6、CA2、NR1I4、SLC4A1、RHCG、ATP6V1B1、AVPR1A、P2RY14、FXYD2、TMEM213、CA2、DMRT2(sc 型)
○ 2-2. β-闰细胞
○ (+) FOXI1、OXGR1、ATP6V1G3、SLC26A4、CA2、NR1I4、RHCG、ATP6V1B1、AVPR1A、INSRR、FXYD2、TMEM213、CA2、AP1S3(sc 型)
○ 2-3. 主细胞
○ (+) KCNE1、APELA、AQP2、AQP3、GATA3、ELF5、STC1、TBX3、CLDN4、KCNJ1、AVPR2、FXYD4、HSD11B2、SCNN1G(sc 型)
○ 2-4. 内髓细胞
○ (+) S100A4、PLEKHB1、ALDH1A3、TM6SF1、SLC14A2(sc 型)
④ 3. 肾小管细胞
○ (+) Dach1、Calb1
○ 3-1. 肾远曲小管细胞
○ (+) KLK1、KCNJ1、KL、EGF、TMEM213、TMEM52B、SOSTDC1、SLC12A3、EMX1、CLDN3、CLDN8、UMOD、PCOLCE、CDC42EP3、CLCNKB、FXYD2、POU3F3(sc 型)
○ 3-2. 肾近曲小管细胞
○ (+) 0610005C13Rik
○ (+) FXYD2、ATP1B1、SLC3A1、CUBN、PDZK1、LRP2、POU3F3、AGXT2、GSTA2、CYP2E1、CRYL1、GLYAT、SORD、UPB1、SOD3、HNF4A、CDKN3、NAPSA、SLC7A13、SLC17A3、HGD(sc 型)
○ (+) DPP4、ENPEP、LRP2、PDZK1、SLC34A1、ASS1、PCK1、SLC4A4、GLYAT、FBP1、FOLR1、AK4、SLC5A8、FAH、CRYL1、SLC13A1、TMEM27、APOE、HGD、SERPINF2(PanglaoDB)
○ 3-2-1. 肾近端直管上皮细胞
○ (+) Spink3、Slc34a1、Slc39a5、Miox、Slc13a1、Rdh16、Ugt2a3、Lrrc19、Pck1、Slc22a8(白板)
○ (+) ALDOB、FXYD2、GPX3、MIOX、SMIM24、APOC3、LOC105867418、SPP1、AQP1、AU129_gr01(Tabula Microcebus)
○ 3-2-2. 肾近曲小管上皮细胞
○ (+) GPX3、ALDOB、FXYD2、MIOX、APOC3、LOC105866477、SMIM24、AU129_gr01、SLC34A1、LOC105867418(Tabula Microcebus)
○ 3-3. 连接小管细胞
○ (+) CALB1、TRPV5、FXYD2、ATP6V1B1、SLC8A1(sc 型)
⑤ 4. 输尿管芽细胞
○ (+) GFRA1、RET、WNT9B、CLDN6、LAMA1、NMU、Wnt11、Etv4、WNT7B(sc 型)
⑥ 5.类结膜上皮细胞
○ (+) AQP5、POLR2J3、FAM83A、PAX6、GJB4、SYT8、SOX15、FGFBP1、SERPINB2、FAM110C(白板)
⑿ 肺上皮
① 1. 类气道上皮细胞
○ (+) ADH7、AQP1、CDH1、SEC14L3(sc 型)
② 2.类上皮细胞
○ (+) ANPEP、EPCAM、IL10、IL6R(sc型)
③ 3.类肺泡上皮细胞
○ (+) T1a、AQP5
④ 4.类支气管上皮细胞
○ (+) MUC5AC
⑤ 5 类. Typei 肺细胞(肺泡 Typei,AT1)
○ (+) GPRC5A、AGER、RTKN2、HTI-56(表面标记)
○ (+) AGER、AKAP5、AQP3、AQP5、CCN2、CLDN18、CLIC5、COL4A3、COL4A4、CRLF1、CYP4B1、EGFL6、EMP2、FSTL3、GPRC5A、HOPX、ICAM1、IGFBP6、KRT7、MEX3B、MMP11、P2RX7、PDPN、 PXDC1、RTKN2、SCNN1A、SCNN1B、SCNN1G、SEC14L3、SEMA3B、SEMA3E、SMARCA1、VEGFA(sc 型)
○ (+) AGER、GGTLC1、MS4A15、CEACAM6、ANKRD29、AQP4、C4BPA、KAL1、ATP13A4、ARHGEF26(白板)
⑥ 6 类. ii 型肺细胞(肺泡 Typeii,AT2)
○(+)SFTPB、SFTPC、MUC1、SLC34A2、Foxp2、Nkx2-1、Tmem213、LYZ、ALPL、C3、DMBT1
○ (+) ABCA3、ADGRF5、AGER、CD36、CD3G、CEBPA、CLDN18、CRLF1、CTNND1、CXCL2、CXCR2、DDX3Y、EGFL6、ETV5、GRK2、IL1B、INMT、IRX1、LAMP3、LPCAT1、LRG1、MUC1、NAPSA、NKX2-1、NRN1、 PGC、PIGR、PPBP、PPP1R14C、RUNX3、S100G、SDC1、SFTA2、SFTPA1、SFTPB、SFTPC、SFTPD、SLC34A2、SOAT1(sc 型)
○ (+) GKN2、SFTPA1、SFTPA2、SLC22A31、SFTPC、SFTPD、ROS1、NAPSA、ABCA3、CACNA2D2(白板)» ○ (+) SFTPC、LOC105870139、LOC105873688、LOC105883485、SFTPB、TMSB4X、LOC105879971、SFTPD、CTSH、CXCL17(Tabula Microcebus)
○ (+) NKX2-1、MUC1、CLDN18、LAMP3、SFTA2、SFTPD、SLC34A2、SFTPB、SFTPA1、SFTPC、ADGRF5、LPCAT1、NAPSA、ABCA3、PGC、CXCL2、PIGR(PanglaoDB)
⑦ 7类. 循环上皮细胞
⑧ 8. ECM 高上皮细胞
⑨ 9 级 簇状
⑩ 10级. 俱乐部牢房
○ (+) Scgb3a2、S100a6、Aqp5、SCGB1A1
○ (+) CYP2B7P、FOLR1、NEDD4L、KIAA1244、SCGB3A1、AGR3、OCLN、SHROOM3、ERBB2、CXCL17(白板)
○ 10-1 气道俱乐部单元
⑪ 11类. 气管双阳性,α-β胸腺细胞
⑫ 12 类. 间皮细胞
○ C2、CALB2、CD44、CDH1、DES、EFEMP1、EPCAM、GSTA3、KRT5、KRT7、KRT72、LGALS7、LRRN4、ME1、ME2、MSLN、MUC16、OSR1、RSPO1、THBD、UPK3B、WT1(sc型)
⑬ 13. 类气管杯状细胞
○ (+) MUC5AC、RP11-412H8.2、BPIFA1、BPIFB1、MUC5B、ATP12A、CXCL17、AGR2、VMO1、LCN2(白板)
⒀ 肌上皮细胞
① (+)KRT1
② (+) FBXO2、MYLK、ACTG2、SYNM、TFAP2C、KCNMB1、FAT1、SAA1、MIR143HG、KRT17(白板)
③ 1.类乳腺肌上皮细胞
○ (+) ACTG2、C6orf132、DSP、DST、GLIPR1、KARS、KLF5、KRT5、KRT6B、MYLK、NARS、OXTR、PTN、TRAF4、TUBB2B
⒁ 神经上皮细胞
① (+) NES、SOX2、NOTCH1、HES1、HES3、CDH1、OCLN、SOX10(sc 型)
⒂ 胰腺上皮
① 1.类癌症干细胞
○ (+) CD24、CD44、FLOT2
② 2.类胰腺导管细胞
○ (+) CFTR、HNF1B、KRT20、MUC1、ONECUT1、AMBP、HHEX、ANXA4、SPP1、PDX1、CFB、GDF15、AKR1C3、MMP7、DEFB1、SERPING1、TSPAN8、CLDN10、SLPI、SERPINA5、PIGR、CLDN1、LGALS4、PERP、 PDLIM3、WFDC2、AQP1、ALDH1A3、KRT19、TFF1、TFF2(sc 型)
○ (+) SLC4A4、CFTR、CLDN10、RP11-528G1.2、SCTR、PKHD1、SFRP5、DCDC2、ANXA4、RP11-680F8.1(白板)
○ (+) GDF15、MMP7、SLPI、PERP、WFDC2、KRT19、KRT7、CLDN4、TACSTD2、CTSH、S100A10(PanglaoDB)
⒃ 前列腺上皮
① 1.类前列腺上皮基底细胞
○ (+) HCAR2、HCAR3、CYP4F8、RMST、HOXB8、SLC16A12、SPINK2、TNS4、GATA3-AS1、PIK3C2G(白板)
② 2. 前列腺上皮俱乐部细胞
③ 3. 类腺细胞
④ 4. 前列腺上皮小丘细胞
⑤ 5. 前列腺上皮小丘俱乐部细胞
⑥ 6. 前列腺上皮管腔细胞
○ (+) KLK3、KLK2、ACPP、LINC01297、KLK4、NEFH、RP11-356O9.1、RPL7P16、RP11-388N2.1、NKX3-1(白板)
⒄ 鳞状上皮细胞
⒅ 胃上皮细胞
① 1.类纤毛上皮细胞
○ (+) CCDC37、C11orf88、FAM216B、LDLRAD1、TUBA4B、KIF19、DYDC2、ANKRD66、C9orf117、C10orf67、AC013264.2、LRRC71、CAPSL、TSPAN19、STOML3(sc 型)
② 2.类鳞状上皮细胞
○ (+) KRT6B、CAPNS2、KRT6C、FGFBP1、KRT6A、KRT17、ADH7、SERPINB10、KRT16、S100A3、CLCA2、LY6D、KRT4、AC019349.5、GPR87(sc 型)
③ 3.类间皮细胞
○ (+) RP11-74M11.2、AP000705.7、BNC1、SPHKAP、PTPRQ、NPHS1、TNNT1、TFPI2、BDNF、PDZRN4、LRP2、GFPT2、HAS1、WT1、COL8A1(sc 型)
⒆ 表面外胚层细胞
① (+) CCL21、RELN、MMRN1、PKHD1L1、ANGPT2、WFS1、SCN3B、SEMA3A、PIEZO2、PROX1(白板)
⒇ 胸腺上皮细胞
① (+) Tcrg-C1、Tbata
② (+) RP11-81F13.2、KCNJ5、RP11-153K16.1、RP11-81F13.1、LL22NC03-75H12.2、RP11-112J1.2、RP11-114G22.1、RP6-24A23.6、C11orf16、 SLC46A2、CACNA1I、PTPRT、NPFFR2、RP1-223B1.1、C12orf56(sc 型)
③ 1 类. DN3 胸腺细胞
○ (+) TRBV25-1、TRAC、BCL11B、AP3M2、CD48、RPL22、TRBC2、RRN3P1、CD3D、TCF7(白板)
④ 2 类. DN4 胸腺细胞
○ (+) CENPF、TOP2A、KIFC1、KIF14、CEP55、FAM72B、NUSAP1、UBE2C、KIF15、TPX2(白板)
⑤ 3 级 双阳性,α-β 胸腺细胞> ⑥ 4. 髓质胸腺上皮细胞
⒇ 膀胱上皮
① 1. 膀胱细胞
○ (+) Asz1、Tgm5、Car3、Cck、Pitx1、Cntn4、Krtdap、Prss35、Hoxa11、Cpz(白板)
② 2. 膀胱尿路上皮细胞
○ (+) DHRS2、BTBD16、UPK1A、TRIM31、PADI3、ATP1A4、PSCA、APOL1、VSIG2、UPK3A(白板)
○ (+) Krt39、Muc15、Sprr2b、Ugt2b35、Gpa33、Upk1a、Sprr1a、Ivl、Gjb6、1110032A04Rik(白板)
○ (+) ZC3H10、RPS27、RPS18、RPLP1、RPS28、S100A6、RPL37、LOC105857397、RPL36、RPL37A(Tabula Miceocebus)
⒇ 子宫上皮
① 1.类子宫上皮细胞
○ (+) LINC01541、ASRGL1、UCA1、SCGB2A1、PAEP、STX18、SEMA3B、DLX5、PAPSS1、ITGB8(白板)
⒇ 间皮细胞
① (+) SERTM1、SYT4、ITLN1、GALNT9、MGAT4C、UPK3B、PTPRQ”、RP11-826N14.4、TMTC2(白板)
② (+) INS、REG3G、RPS18、S100A6、ZC3H10、TMSB4X、LOC105875474、RPS27、PRSS2、S100A4(Tabula Microcebus)
③ (+) CALB2、MUC16、KRT5、KRT7、MSLN、WT1、PKHD1L1、SULF1、MIR22HG、COBLL1、GBP2、MEDAG、CRLS1、EFEMP1、RSPO1、RARRES2(PanglaoDB)
④ 1.类肺间皮细胞
○ (+) C2、CALB2、CD44、CDH1、DES、EFEMP1、EPCAM、GSTA3、KRT5、KRT7、KRT72、LGALS7、LRRN4、ME1、ME2、MSLN、MUC16、OSR1、RSPO1、THBD、UPK3B、WT1(sc 型)
⑤ 2. 肠间皮细胞
○ (+) AP000705.7、HAS1、TNNT1、BNC1、DSC3、WT1、WNT10A、C21orf62、PTPRQ、CEMP1、C3、CRB2、KLK11、PHYHIP、TGM1(sc 型)
⑥ 3. 脾间皮细胞
○ (+) QRFPR、SLPI、LHX9、PLA2G2A、CGN、NPHS1、KRT5、LRRN4、KLK11、OLR1、PTPRQ、COL8A1、PDZK1IP1、HAS1、SFRP2(sc 型)
⑦ 4. 胃间皮细胞
○ (+) RP11-74M11.2、AP000705.7、BNC1、SPHKAP、P TPRQ、NPHS1、TNNT1、TFPI2、BDNF、PDZRN4、LRP2、GFPT2、HAS1、WT1、COL8A1(sc型)
⒇ 舌上皮
① 1.类味觉感受器细胞
② 2.类唾液粘液细胞
○ (+) KRT14、THBS1、KRT17(PanglaoDB)
③ 3. 唾液腺腺泡细胞
○ (+) BPIFA2、LPO、PRB2、CA6、PRB1、MUCL1、PRH1、PRB4、PRH2、HTN1(白板)
⒇ 嗅上皮细胞
⒇皮肤上皮
① 1 类. 角质形成细胞
○ (+) KRT4、IGFL1、LGALS7、SPINK5、RHCG、GBP6、IVL、CYSRT1、THEM5、SULT2B1(白板)
○ (+) CALML5、CD24、KRT5、KRT14、KRT17、AQP3、KRT15、S100A14、SFN、KRT10(PanglaoDB)
○ 1-1. 棘细胞(棘细胞)
○ (+) Krt1、Krt10
○ 1-2. 基底细胞
○ (+) Krt14、Krt5
○ 1-3. 增殖基底细胞
○ (+) Mki67、Krt14、Krt5
② 2.类黑素细胞
③ 3级默克尔细胞
④ 4.类皮脂细胞
⑤ 5. 类毛细胞
⑥ 6. 毛囊 (HF)
○ 6-1. 毛囊相关细胞
○ (+) Krt15、Krt17、Krt79
○ 6-2. HFSC(毛囊干细胞)
○ (+) Lgr5、Cd34
○ 6-3. 漏斗部
○ 6-4. 滤泡间表皮
○ 6-5. 交界区
○ (+) Lrig1、GATA6
○ 6-6. 峡部
○ (+) Plet1、Lgr6
○ 6-7. 凸起
○ (+) CD34、KRT15、SOX9、Nfalc1、Tcf3、Lhx2、Gli1
○ 6-8. 毛胚
○ (+) Lgr5
○ 6-9. 皮脂腺
○ (+) SCD1、FAS、FABP、亲脂蛋白
○ 6-10. 基底膜
⑦ 区域 1. 表皮
○ (+) Krt5、Krt14
⑧ 区域 2. 真皮
○ (-) Krt5、Krt14
3。 2. 型内皮细胞
⑴概述:泛内皮细胞
① (+) CD31(PECAM1)、CD34、VWF、PLVAP、CDH5、TIE-2、Axin2、WARS、AQP1、TIFA、Cyyr1、Hspa1b、NCOA7、DUSP23、Cdh5、Esm1、Vtn、Vim(波形蛋白)
② (+) PECAM1、CD34、KDR、CDH5、PROM1、PDPN、TEK、FLT1、VCAM1、PTPRC、VWF、ENG、MCAM、ICAM1、FLT4、SELE(sc 型)
③ (+) TM4SF18、PLVAP、WWTR1、MKL2、SOX18、CD320、S1PR1、NOTCH4、RAPGEF5、LIMS2(白板)> ④ (+) Tlx1、Gm694、C1qtnf9、Kcna5、Rbp7、Fabp4、Aqp7、Glycam1、Apold1、Sele(白板)
⑤ (+) PECAM1、VWF、CLEC14A、EMP1、RNASE1、CTGF、HYAL2、CALCRL、EMCN、ADGRL4、CLDN5、ECSCR、CDH5、TGFBR2、ENG、EGFL7、FLT1、EPAS1、CD34、SRGN、S100A10、IGFBP7、SPARC、SLC9A3R2、MGP、 SPARCL1、TM4SF1、ID1、CD9、ID3、CAV1、GNG11、S100A13、IFI27、PCAT19、TIMP3(PanglaoDB)
⑥ (+) CLDN5、TIE1、VWF、KDR、ROBO4、EMCN、MYCT1、HYAL2、TEK、ACVRL1、FLT4、MMRN2、ANGPT2、ARHGEF15、CD93 (SCEVAN)
⑦ (+) RAMP2、VWF、CLEC14A、PLVAP、RAMP3、ADGRL4、CLDN5、EGFL7、GNG11、ENG (3CA)
⑵ 肾上腺血管内皮细胞
① (+) CCL23、FGF23、SMIM9、RP13-1016M1.2、RP11-100L22.1、RP11-327L3.3、RP1-149A16.12、GPR182、DLL4、GALNT15、CALCRL、CD300LG、FLT4、FCN3、GPIHBP1 (sc型)
⑶血管生成内皮细胞
① (+) CD105、VEGFR2、KIT、NRP2、COL15A1、PCDH17、ITGA6
⑷壁细胞
⑸ 周细胞:包裹内皮细胞的成纤维样细胞。壁细胞的一种
① (+) Rgs5、Abcc9、NG2、Flt1、MCAM1
② (+) GUCY1A2、COX4I2、NDUFA4L2、RGS5、NOTCH3、GJA4、GUCY1B3、FHL5、STEAP4、C2orf40(白板)
③ (+) PDGFRB、NOTCH3、COX4I2、HIGD1B、MCAM、NDUFA4L2、VIM、MFGE8(PanglaoDB)
⑹ 组织1.心血管系统
① 1.类动脉内皮细胞
② 2. 毛细血管需氧细胞
③ 3.类毛细血管内皮细胞
○ (+) FCN3、CA4、GPIHBP1、CD300LG、CDH5、PODXL、ROBO4、EMCN、BTNL9、HYAL2(白板)
○ (+) LOC105857591、B2M、LOC105855951、RAMP2、CD74、LOC105867540、MFGE8、CALCRL、RAMP1、LOC105856764(Tabula Microcebus)
④ 4.类心脏内皮细胞
○ (+) H19、CLIC5、F8、SLC14A1、TNNT3、MCF2L、KANK3、TMEM88、TCF15、TSPAN18(白板)
⑤ 5.类动脉内皮细胞
○ (+) IGFBP3、SEMA3G、MECOM、HEY1、CLEC14A、KIAA1462、JAM2、EFNB2、PIK3R3、SHE(白板)
⑥ 6.类血管树内皮细胞
○ (+) SELE、IL6、RND1、CNKSR3、STC1、SELP、ACKR1、SOX7、ADAMTS9、OLFM1(白板)
⑦ 7类. 静脉内皮细胞
○ (+) CCL14、OLFM1、ACKR1、DOC2B、PLVAP、FAM110D、RAMP3、SELP、LPCAT4、SLCO2A1(白板)
○ (+) TMSB4X、ZC3H10、ACKR1、RPS18、LOC105857591、ADIRF、SELE、B2M、RPS12、RPL37A(Tabula Microcebus)
⑧ 8.类淋巴管内皮细胞
○ (+) LYVE1
○ (+) MMRN1、CCL21、PKHD1L1、PROX1、FLT4、SMAD1、TFF3、NR2F1、RHOJ、LAYN(白板)
○ (+) CCL21、B2M、ADIRF、VIM、RAMP2、TMEM176B、PLAC9、MMRN1、TIMP3、LOC105855951(Tabula Microcebus)
⑨ 9级心脏淋巴内皮细胞
○ (+) GPR182、GPR97、STAB2、HOXD9、TBX1、CCL21、HOXD10、TSPEAR、ABCA4、PGM5-AS1、TFF3、LINC00636、RP11-341G23.4、HOXD4、RP11-451M19.3(sc型)
⑩ 10类. 心脏血管内皮细胞
○ (+) ESM1、SLC9C1、OPN5、QRFPR、MIR4454、AC007743.1、PKD1L1、TM4SF18、APLNR、CLRN1-AS1、CD300LG、C1QTNF9、AC019100.3、MADCAM1、RP11-298O21.5(sc 型)
⑪ 11类.血管内皮细胞
○ (+) EPHX4、POSTN、CCL14、TMEM255B、LCN6、CYTL1、NOS3、ACKR1、RILPL1、HSPA12B(白板)
○ 区域 1. 内膜
○ 区域 2. 中膜
○ 区域 3. 外膜
⑫ 12 类. 直肠血管升肢细胞
○ (+) LOC105855951、B2M、HYAL4、LOC105869179、LOC105871594、LOC105870764、LOC105870765、S100A6、RAMP2、CD74(Tabula Microcebus)
⑬ 13类. 直血管降肢细胞
○ (+) S100A6、AQP1、TIMP3、S100A4、TMSB4X、LOC105855951、HSPB1、MGP、B2M、JUN(Tabula Microcebus)
⑺ 组织2.消化系统
① 1.类肝窦内皮细胞
○ (+) OIT3、CRHBP、CLEC4G、IL33、INSR、DNASE1L3、HECW2、BMPER、FAM167B、NTN4(白板)
② 2.类肠内皮细胞» ○ (+) PCAT19、GPR126、FOXC1、JAM2、NRN1、CLDN5、SLCO2A1、THBD、PTPRB、ICAM1(白板)
③ 3级肝内皮细胞
○ (+) FLT1、APPBP2、ARGLU1、ATP10D、BNIP1、BST2、BTNL9、C11orf96、CCDC85B、CCL14、CD4、CDC73、CDKL1、CHD4、CLEC1B、CLEC2B、CLEC4G、CLEC4M、CRBN、CRHBP、CTSL、DCLRE1C、 DIPK2A、DLC1、DLG1、DLK1、DNASE1L3、DOCK1、DUSP5、EFNB2、ENG、F8、FCN2、FCN3、FILIP1、FOSB、FXYD6、GBP4、GGA2、GNG11、HES1、HYI、IL1R1、IL33、KDR、KIF1B、KLHL28、LDB2、MCAM、 MCM3AP、MEF2C、MFN1、MGAT5、MPZL3、MRC1、OIT3、PIK3C2A、PPWD1、PTPRC、RASGEF1B、RASGRP3、RELN、RIN2、SECISBP2L、STAB1、STRN3、TCF12、TEX264、TFRC、TRAAPPC11、TSPAN7、USP48、 VWF、ZNF286B、STAB2、CD34、PECAM1(sc 型)
④ 4.类肠血管内皮细胞
○ (+) SOX17、GPIHBP1、PRND、CLEC3B、FLT1、MMRN2、BTNL9、APLNR、LHX6、NOTCH4、RP11-3K16.2、ESAM、RP11-328D5.1、ESM1、GJA5(sc型)
⑤ 5级肠淋巴内皮细胞
○ (+) RP11-474N8.5、TBX1、STAB2、CCL21、LINC00636、TSPEAR、ART5、CTC-236F12.4、GPR1、RP11-322E11.5、MPP7、Y_RNA、ABCA4、PLIN5、TP63(sc型)
⑥ 6.类胃血管内皮细胞
○ (+) SELE、PRND、APLNR、ARHGEF15、PLVAP、FLT1、PCDH12、MADCAM1、GPIHBP1、GALNT15、RP4-601K24.1、MEOX1、A2M、CCM2L、CLEC14A(sc 型)
⑦ 7类. 胃淋巴内皮细胞
○ (+) NTS、STAB2、CCL21、RADIL、RP11-444A22.1、TFPI、RP11-142C4.6、TNFAIP8L3、LY86-AS1、PTGS2、RP11-554D15.1、EFCC1、MMRN1、Y_RNA、NFATC1(sc 型)
⑧ 8. 门静脉
○ (+) Adgrg6、Gja5
⑻ 组织3.排泄系统
① 1.类肾内皮细胞
○ (+) F8、AU021092、Emcn、Fam167b、Rsad2、Plvap、Esm1、Cldn15、Bhlhe22、Ppap2a(白板)
○ (+) TGFBR2、NOTCH4、ADGRL4、EMCN、ENG、PECAM1、PLAC8、PLVAP、TEK、KDR、VWF、MMRN1、CD93(sc 型)
○ 1-1. 肾小泡细胞
○ (+) NCAM1、EMX2、LHX1、BMP2、DKK1、DLL1、GREB1、PAPSS2、PCSK9、POU3F3、TMEM100、WT1(sc 型)
② 2.类膀胱内皮细胞
○ 毛细血管内皮细胞
○ 淋巴管内皮细胞
○ 静脉内皮细胞
⑼ 组织 4. 肌肉内皮细胞
① 1. 类淋巴管内皮细胞
○ (+) NTS、TFF3、CCL21、STAB2、PTX3、PCLO、IL7、P4HA3、C 6orf141、PIK3C2G、ASGR2、ANKRD36BP2、NALCN、FAM26F、NHLRC1(sc 型)
② 2.类血管内皮细胞
○ (+) MIR4454、SLC5A4、AL118508.1、CA4、RP11-206M11.7、PRSS51、NOS3、GRIN2A、GFRAL、CD300LG、MADCAM1、RP11-327L3.3、C1QTNF9、ANO2、AP001597.1(sc型)
⑽ 组织5.神经系统
① 1.类视网膜血管内皮细胞
○ (+) LCN1、LACRT、SELP、ELOVL7、SELE、SYT15、MYRIP、CXorf36、THSD7A、CD200(白板)
② 2.类眼内皮细胞
○ (+) PECAM1、VWF、CDH5、BMP2、BMP4、CD34、CD55、FLT1、MED1、TGFBR1、TMEM98、TNFSF12、CD93、SLCO1A4、CLDN5、ICAM1、GNG11(sc 型)
③ 3.类脑内皮细胞
○ (+) PECAM1、VWF、A2M、APOLD1、FLT1、TM4SF1、CD34、MCAM、ENG、PTPRC、VCAM1、CDH5(sc 型)
⑾ 组织 6. 前列腺内皮细胞
① (+) PECAM1、CD34、MCAM、CDH5、VWF、ENG、KDR、PDPN、SELE、A2M(sc 型)
⑿ 组织 7. 呼吸系统
① 1.类肺内皮细胞
○ (+) Cldn5、Hpgd、Rasgef1a、Tmem100、Lyve1、Adrb1、Clec14a、Prx、Ripply3、Sox11(白板)
○ (+) CD34、EGFL7、EMCN、ESAM、FLT1、KDR、MCAM、PECAM1、RAMP2、TEK、VWF(sc 型)
② 2. 支气管血管内皮细胞
③ 3.类动脉内皮细胞
④ 4.类毛细血管内皮细胞
⑤ 5. 类发炎内皮细胞
⑥ 6.类肺静脉内皮细胞
⑦ 7类. 全身静脉内皮细胞
⑧ 8.类肺微血管内皮细胞⒀ 组织8.胎盘血管内皮细胞
① (+) RP11-1028N23.4、RP11-297H3.3、AC007743.1、RP11-327L3.3、CD34、ARHGEF15、CXorf36、LRRC36、SOX7、RP11-328D5.1、NTS、CDRT1、LINC01049、ROBO4、 HS3ST3A1(sc型)
⒁ 组织9. 脾血管内皮细胞
① (+) RP11-189E14.5、ODF3L2、RP4-765C7.2、AC019100.3、RP11-172F10.1、CTD-2207L17.2、RP1-154K9.2、AC010084.1、SLC5A4、OR5G5P、HOXD3、 SNTG1、EEF1A1P31、ADAMTSL1、MYRIP(sc 型)
⒂ 组织10. 胸腺血管内皮细胞
① (+) ADAMTS9、PROX1、MET、AC011526.1、MEOX2、ANO2、CTD-3179P9.1、NOVA2、AOC3、CXorf36、GPR116、PODXL、NRN1、PTPRB、LINC00472(sc 型)
⒃ 组织 11. 肿瘤相关内皮细胞 (TEC)
① (+)CD144
⒄ 组织 12. 淋巴管
① (+) TFF3、CCL21、TFPI、FABP5、PROX1、RGS16、PPFIBP1、EPHB4、ITGA9、MMM1、PDE2A、IGF1、CD9、LYVE1、FLT4、MAF、NRP2
4。 3. 型免疫细胞
⑴免疫细胞
① (+) LCP2、LSP1、FYB、PLEK、HCK、IL10RA、LILRB1、NCKAP1L、LAIR1、NCF2、CYBB、PTPRC、IL7R、LAPTM5、CD53 (SCEVAN)
② state 1. ISG(干扰素刺激基因)表达免疫细胞
○ (+) IFIT1、IFIT2、IFIT3、IFIT5、ISG15、CCL3、CCL4、CCL3L3、RSAD2、OASL、CXCL10、IFI15、ISG20(sc 型)
⑵ I类.白细胞(白细胞、白细胞)
① (+)CD45
② (+) SPRR2D、S100A7、SPRR2E、TIPARP、RUNX3、CD3G、GLIPR1、GPR183、RGS1、SPRR2A(白板)
③ A 类. 淋巴细胞
○ (+) NK1.1、B220、CD4、CD8
○ (+) CCL5、TMSB10、RPS27、LOC105874071、RPL13A、RPLP1、IL32、RPS11、GZMA、RPS15A(Tabula Microcebus)
○ 状态 1. 先天淋巴细胞
○ (+) TCF7、CD69、TAGAP、AREG、TRAC、PIK3IP1、IL7R、CXCR4(白板)
④ B 类. 骨髓细胞
○ (+) CD68、CD14、CD11b、ITGAX (CD11c)、ADGRE1、MHC-II、Ly6G、Ly6C、CD86、HLA-DRA、F4/80、CST3、LYZ、Lamp3、ITGAM
○ (+) GPR34、CCR1、HLA-DRB5、C3AR1、CD68、CSF1R、SLC1A3、CLEC7A、MAFB、SIGLEC10(白板)
⑶ A-1. B细胞(B淋巴细胞)
①泛B细胞
○ (+) CD19(几乎全部存在于 B 细胞中)、CD20 (MS4A1)、CD79A、CD79B、BLK、PTPRC、CD24、CD40、CD72、CD220、APOBEC3A、PELI1、ANKRD28、C2orf42、CCPG1、CLECL1、DNAAF1、DUSP5、ERN1、FAM107B、 ITM2、LGALSL、RAB30、SLAMF1、TRIB1、VOPP1、TNFRSF5、CLEC2C、FCRL4、HAVCR1、CR2、IL35、LILRB1、SPN、TLR9、TNFRSF13C、TNFRSF17、XBP1、MME、Btla、LAT2、BASP1、CD45R、B220、IgD、 TNFSF9、EBF1
○ (+) LINC01781、BLK、TNFRSF13B、CD19、VPREB3、LY9、GNG7、BANK1、MS4A1、LINC02397(白板)
○ (+) Ms4a1、Cd79a、Crisp3、Faim3、Cd79b、Fcer2a、Tnfrsf13c、Cr2、Bank1、Cd19(白板)
○ (+) CD74、RPS27、RPL12、RPS15A、RPS28、RPL37、LOC105855163、RPL23A、RPL27A、RPS11(Tabula Microcebus)
○ (+) CD69、CD79A、CD79B、IGHM、HLA-DRA、LTB、MZB1、VPREB3、CXCR4、IGLC2、IGKC、BCL11A、CD74、CD52(PanglaoDB)
○ (+) HLA-DOB, HLA-DQA1, MS4A1, CD79B, BLK, GNG7, SPIB, TCL1A, FCRLA, HVCN1, NCF1, BANK1, CD79A, CD19, VPREB3 (SCEVAN)
○ (+) MS4A1、BANK1、CD79B、CD79A、VPREB3、CD19、BLK、CD37、FCER2、ADAM28 (3CA)
○ (-) CD11b
② 1.类前B细胞
○ (+) Cd19、Cd43、Cd45r、Cd127、BP-1、cμ、λ5
○ (-) Cd19、Cd2
③ 2. 前 B 细胞
○ (+) CD19、CD20、CD34、CD38、CD45R、CD22
○ (+) CD27、IgD、CD24、PTPRC、PAX5、CD24、CD38、CD79A、DNTT、C10orf10、VPREB1、ARPP21、CD99、IGLL1、CD9、CD79B、TCL1A、IGLL5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、VPREB3、IGLL5(sc 型)
○ 2-1. 大 B 细胞前体(小鼠)
○ (+) Cd19、Cd43、Cd45r、Cd127、BP-1、HSA、λ5
○ (-) Cd2、Cd22、Cd117、cμ
④ 3. 前 B 细胞
○ (+) CD19、CD20、CD38、CD40、CD45R、CD34、CD79A、CD79B、Pou2af1、Cd93、Elk3、Satb1、Tox» ○ (+) CD19、CD27、IgD、CD24、PTPRC、PAX5、CD24、CD38、CD79A、NSMCE1、PCDH9、ACSM3、CCDC191、TCL1A、CD79B、TCL1A、IGLL5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、VPREB3、IGLL5(sc 型)
○ 3-1. 大前B细胞(小鼠)
○ (+) Cd19、Cd45r、Cd127、BP-1、cμ
○ (-) 镉2
○ 3-2. 小前 B 细胞(小鼠)
○ (+) Cd2、Cd19、Cd127、B220、cμ
○ (-) Cd43, sµ
⑤ 4. 未成熟 B 细胞
○ (+) CD19、CD20、CD40、CD45R、IgM、CD38、CD5、CD53、TCL1A
⑥ 5 级 移行 B 细胞
○ (+) CD10、CD19、CD20、CD25、CD30
○ (-) CD27
○ 5-1. 移行 1 (T1) B 细胞
○ (+)B220、Cd19
○ (-) Cd23
○ 5-2. 移行 2 (T2) B 细胞
○ (+) Cd23、Cd93、B220、IgD
⑦ 6. 边缘区 B 细胞
○ (+) CD1、CD19、CD20、CD21、CD27、Notch2、Cd1d、Cd21、Cd93、HSA、CD1D
○ (-) Cd35,
⑧ 7类. 滤泡B细胞/B2细胞
○ (+) IgD、CD21、CD22、CD23、Cd19、Cd21、Cd35、Cd93
⑨ 8 类. B1 细胞
○ (+) CD11b、CD19、CD20、CD27、CD43、CD70、IgM、CD5
○ (-) CD23、CD38
○ 8-1. B1前体
○ (+) Cd19、Cd45ra
○ (-) B220
⑩ 9 级 血浆 B 细胞
○(+)CD27、CD38、CD40 CD78、CD95、CD138、CD319、IL-6、CXCR4、IGHG3、IGKC、IGHM、IGHG2、IGKV4-1、IGLV3-1、IGHA1、IGHG1、JCHAIN、Cd19、Cd138、IGKC、BCMA、 BCL2、BCL6、XBP1、FKBP2、SELM、SSR3、VIMP、SPCS3、ERLEC1
○ (+) CD27、IgD、CD38、CD24、CD20、MS4A1、PTPRC、PAX5、CD24、CD79A、JCHAIN、SSR4、FKBP11、SEC11C、DERL3、PRDX4、IGLL5、CD79B、TCL1A、IGLL5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、CD138、 VPREB3、IGLL5(sc 型)
○ (+) IGHG1、IGJ (JCHAIN)、IGHG3、MZB1、TXNDC5、IGHG2、DERL3、IGLC2、IGHG4、IGLC3(白板)
○ (+) LOC109729893、LOC105882024、JCHAIN、LOC105877808、LOC105862709、MZB1、HERPUD1、B2M、RPLP1、RPS18(Tabula Microcebus)
○ (+) SDC1、CD38、CD27、CYCS、CD74、TNFRSF17、CD79A、EAF2、GNG7、IGKC、MZB1、IGLC2、IGHG1、IGHG2、IGHG3、IGHGP、IGLC3、JCHAIN、IGHA1、IGHG4、IGHA2、SSR4(PanglaoDB)
○ (+) MZB1、JCHAIN、FKBP11、XBP1、SSR4、DERL3、SEC11C、SDF2L1、PRDX4、SPCS3 (3CA)
○ (-) CD20、CD79A、CD79B、BLNK、MS4A1、IgM、Cd21、Cd22、Cd23、IgD、IgM
○ (-) CD20、MS4A1(sc型)
⑪ 10 类. 记忆 B 细胞
○ (+) CD19、CD20、CD27、CD40、CD80、PDL-2、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CXCR6、IgA、IgG、IgE、B220、MHC II 类、BCL2、CD53、CD21、FAS
○ (+) CD19、CD27、IgD、CD24、CD20、MS4A1、PTPRC、PAX5、CD24、CD79A、JCHAIN、SSR4、FKBP11、SEC11C、DERL3、PRDX4、IGLL5、CD79B、TCL1A、IGLL5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、CD138、 CD27、VPREB3、IGLL5(sc 型)
○ (+) AIM2、ADAM28、TLR10、CD19、TNFRSF13B、CD22、P2RX5、RP5-887A10.1、SCIMP、MS4A1(白板)
○ (-) CD38、CD150
⑫ 11 类 调节性 B 细胞
○ (+) IgD、CD1、CD5、CD21、CD24、TLR4、IL-10、TGFβ
⑬ 12 类. NF B 细胞
○ (+) B220、Cd2、Cd19、HSA、IgM
○ (-) Cd21、Cd23、Cd35
⑭ 13. 类激活的生发 B 细胞
○ (+) B220,MHC II 类
⑮ 14 类. 布雷格
○ (+) CD1D、CD27、CD5
⑯ 15. 类成熟 B 细胞
○ (+) CD22、CD21、IGHA1
⑰ 状态 1. 幼稚 B 细胞
○ (+) CD19、CD20、CD23、CD40、CD150、IgD、IgM、CD22、CD53、CD21
○ (+) CD19、IgD、CD38、CD24、CD20、MS4A1、PTPRC、PAX5、CD24、CD79A、JCHAIN、SSR4、FKBP11、SEC11C、DERL3、PRDX4、IGLL5、CD79B、TCL1A、IGLL5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、CD138、 VPREB3、IGLL5(sc 型)
○ (+) TCL1A、IGHD、LINC00926、FCRL1、STAG3、RP11-693J15.5、FCER2、PAX5、FAM129C、CD22(tabual sapiens)
○ (+) BANK1、CD37、CD69、CD79A、CD79B、IGHD、IGHM、IGKC、LTB、MS4A1、SELL、TCL1A、VPREB3、FOXP1、CD52、HLA-DQB1、TNFRSF13C、LINC00926、BIRC3、CD74(庞老数据库)
○ (-) CD27
⑱ 状态 2. 切换 B 细胞
○ (+) CD27
○ (-) IgD
⑲ 状态 3. 未转换的 B 细胞
○ (+) CD27、IgD
⑳ 状态 4. 激活的 B 细胞
○ (+) CD80、CD86、FAS> ⑳ 状态 5. 功能性 B 细胞
○ (+) CD27、CCR7、CD197
⑷ A-2. T细胞(T淋巴细胞)
①泛T细胞
○ (+) CD2、CD3(CD3D、CD3E、CD3G)、KLRC1、TUBA4A、TENT5C、CD274、CYTIP、GPR183、RHOH、SMAP2、ICOS、LAG3、CD47、CCR10、CD58、ITGAE、ITGAL(LFA-1)、PTGDR2、IL10、IL13、 IL17A、IL2、IL21、IL22、IL25、IL26、IL5、IL9、IGFB1、FOXO4、FOXP1、TBX21、PTPRC (CD45)、Ptprc、Cd28、Cd247、Ifng
○ (+) CD96、SYTL3、RORA、IL7R、CD7、CD2、LEPROTL1、CNOT6L、TRAC、RUNX3(白板)
○ (+) Lcn4、Il7r、Folr4、Cd3d、Tnfsf8、Ms4a4b、Cd3g、Cd40lg、Vipr1、Cxcr6(白板)
○ (+) CCL5、TMSB10、IL32、LOC105874071、GZMA、LOC105858493、LOC105881712、S100A4、NKG7、CRIP1(Tabula Microcebus)
○ (+) CD3D、CD3G、CD3E、LTB、IL7R、TRBC1、TRBC2、CD7、TRAC、IL32、CXCR4、CD2、CLEC2D、S100A4、LCK、JUNB、CD52(PanglaoDB)
○ (+) HLA-B、PTPRC、SH2D1A、CD3E、LCK、CD48、ACAP1、GIMAP7、SEPTIN1、CD69、LINC00861、CDC42SE2、CD96、TSTD1、GIMAP4 (SCEVAN)
○ (+) CD3D、CD3G、CD3E、IL32、CD2、IL7R、SPOCK2、CD6、CD8B、CD52 (3CA)
○ (-) CD11b
② 1 类. 辅助 T 细胞(Th)
○ (+) CD4
○ (+) LEF1、TCF7、BCL11B、CAMK4、ITK、IPCEF1、INPP4B、CD6、SCML4、PRKCQ-AS1(白板)
○ (+) AC092580.4、OXNAD1、KLRB1、STAT4、CRIP1、SYTL3、PDE4D、RCAN3、CD3G、RORA(白板)
○ (+) LOC105855976、IL32、RPS27、LOC105874071、IL21、CGA、LRRC31、FOXP3、LOC105873674、GABBR2(Tabula Microcebus)
○ 1-1. Th1(辅助 T 细胞 1)
○ (+) CD4、CXCR3、IFNγ、IL-2、IL-12、IL-18、STAT4、STAT、TNF、T-Bet、IFNG、GZMB、Tbx21
○ (-) CD8A、CD8B、FOXP3、IL2RA
○ 1-2. Th2(辅助 T 细胞 2)
○ (+) CD4、CCR4、IL-2、IL-4、GATA-3、Gata3、IL-13
○ (-) CD8A、CD8B、FOXP3、IL2RA
○ 1-3. Th9
○ (+) PU.1、IL-9
○ 1-4. Th17
○ (+) RORγt、IL-17、RORA、RORC、RBPJ、BHLHE40、CCR6、IL23R、Rorc
○ Th17 化学吸引
○ (+) CXCL16、CCL20
○ 1-5. Th22
○ (+) AHR、IL-22
○ 1-6. Tfh(滤泡辅助T细胞)
○ (+) BCL6、CXCR5、IL-21
○ (+) AL135905.2、CD28、CD5、PBX4、KCNA3、CD7、CCR7、CD6、LSR、RP4-765C7.2(白板)
○ 1-7. 效应 CD4+ T 细胞
○ (+) CD4、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD25、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CCR7、CD45、CCR6、CD11b、CD30、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、PTPRC、Trac、Ltb、Cd52、Trbc2、 Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) TCF7、LEF1、ITK、BCL11B、CITED2、CD3E、CAMK4、IL7R、CD69、SPOCK2(白板)
○ (-) 卖出,CCR7(sc 型)
○ 1-8. 记忆 CD4+ T 细胞
○ (+) CD4、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD25、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CCR7、CD45、CCR6、CD11b、CD30、CD45RO、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、出售、CCR7、S100A4、Trac、 Ltb、Cd52、Trbc2、Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) TRAT1、TRAC、LCK、BCL11B、TCF7、ITK、PIK3IP1、SPOCK2、IL7R、CD3G(白板)
○ 1-9. 表达金属硫蛋白的 T 细胞:金属硫蛋白保护细胞免受氧化应激和细胞毒性
○ (+) MT1、MT2
○ 1-10. SRRM2-T 细胞
○ (+) PNISR、SRRM2
○ 1-11. 初始 CD4+ T 细胞
○ (+) CCR7、LEF1
○ (+) CD4、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CCR7、CD45、CCR6、CD11b、CD30、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、PTPRC、SELL、CCR7、Trac、Ltb、Cd52、Trbc2、 Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) PRKCQ-AS1、CCR7、TXK、TRAC、NOSIP、LCK、TCF7、CCDC109B、BCL11B、PIK3IP1(白板)
○ (-) CD25、CD44、CD69、HLA-DRA、CD95(sc 型)
③ 2. 细胞毒性 T 细胞 (Tc)
○ (+) CD8、Cd8a
○ (+) AC092580.4、CD8A、CD8B、CCL5、GZMA、KLRD1、SYTL3、CD2、CD3G、CD96(白板)
○ (+) CCL5、IL32、LOC105881712、LOC105874071、TMSB10、LOC105881288、GZMA、LOC105866296、NKG7、LOC105858493(Tabula Microcebus)» ○ (+) CD2、CD5、CD69、GZMB、TRAC(PanglaoDB)
○ 2-1. 细胞毒性T细胞(杀伤T细胞)
○ (+) IFNγ (IFNG)、TNF、CD8、EOMES、CD8A、CD8B、Thy1.1、KLRG-1、GZMH、PRF1
○ (+) GZMK、CD8A、CD8B、MATK、DUSP5、GZMM、PTPRCAP、CTSW、ZAP70、DUSP2(白板)
○ (-) CD4
○ 2-2. CD8 阳性 α-β 效应 T 细胞
○ (+) CD8、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD25、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CD45、CD8A、CD8B、CCR6、CD11b、CD30、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、PTPRC、GNLY、Trac、Ltb、Cd52、 Trbc2、Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) GNLY、CEP78、KLRF1、NKG7、PTGDR、RP11-489E7.4、HIST1H1E、HIST1H1D、SAMD3、GZMM(白板)
○ (+) GZMK、CD8B、CD8A、DUSP2、GZMM、CCL4、CMC1、CD3E、CCL5、CD69(白板)
○ (-) 卖出,CCR7(sc 型)
○ 2-3. 记忆CD8+ T细胞
○ (+) CD8、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD25、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CD45、CD8A、CD8B、CCR6、CD11b、CD30、CD45RO、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、出售、GNLY、S100A4、 Trac、Ltb、Cd52、Trbc2、Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) GZMK、SH2D1A、CD8A、CD8B、GZMM、DUSP2、CCL5、GZMA、CTSW、CMC1(白板)
○ 2-4. 初始 CD8+ T 细胞
○ (+) CCR7
○ (+) CD8、CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CD45、CD8A、CD8B、CCR6、CD11b、CD30、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、PTPRC、出售、GNLY、Trac、Ltb、Cd52、 Trbc2、Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) LYAR、FGFBP2、GZMH、MYBL1、KLRD1、GZMA、CD8A、CCL5、KLRG1、GNLY(白板)
○ (-) CD25、CD44、CD69、HLA-DRA、CD95(sc 型)
④ 3类. Treg细胞(调节性T细胞)
○ (+) CD4、CD25、CD127、CD152、TGFβ、IL-10、IL-12、FOXP3 (FoxP3)、STAT5、IL2RA、CTLA4、TIGIT、IL1RL1、ICOS、TNFRSF9
○ (+) FOXP3、RTKN2、TIGIT、CTLA4、IL2RA、IKZF2、BATF、TRBV25-1、SPOCK2、CD28(白板)
○ (-) CD8A、CD8B
○ 3-1. 初始调节性 T 细胞
○ (+) TIGIT、CTLA4、CD5、ABCC1、PTPRCAP、ITK、SPOCK2、IKZF2、LEF1、RP4-765C7.2(白板)
⑤ 4. γ δ T 细胞(Tgd 细胞,γδ-T 细胞):与 α beta T 细胞相比,典型的 T 细胞类型。先天性T细胞之一
○ (+) CD2、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD25、CD45RA、CD62L、CD27、CD127、FOXP3、CD45、CCR6、CD11b、CD30、CD6、CTLA4、IL2RA、GZMB、PTPRC、TRDV2、TRGV9、TRGC1、Trac、Ltb、Cd52、 Trbc2、Shisa5、Lck、Thy1、Dapl1(sc 型)
○ (+) GNLY、GZMB、FGFBP2、NKG7、PRF1、KLRF1、HOPX、CST7、KLRD1、CTSW、SPON2、GZMA、CD247、CD7、CCL5、TRDC(庞老数据库)
○ (-) 出售,CCR7(sc 型)
⑥ 5. 前 T 细胞
○ 5-1. DN1 胸腺 pro-t 细胞
○ (+) GZMK、CCL4、SOCS1、PRDM1、TRBV25-1、CD2、KLRB1、CCL5、IL7R、TRAC(白板)
⑦ 6类. DN T(双阴性T细胞)
⑧ 7类. MAIT(粘膜相关不变T细胞):先天样T细胞之一
○ (+) SLC4A10
⑨ 状态 1. 激活的 T 细胞
○ (+) CD69、CD25
○ 1-1. 提前激活
○ (+) GZMK、GZMM、GZMA、NKG7
⑩ 状态 2. 细胞毒性
○ (+) 颗粒酶、穿孔素
⑪ 状态 3. 天真
○ (+) CD45RA、CD62L、CCR7、LEF1、SELL、TCF7、IL7R
○ (+) CD3D、SELL、CCR7 (PanglaoDB)
⑫ 状态 4. 记忆
○ (+) 卖出、CD69、CD247、IL7R、CD3E、GIMAP4、CD2、PTPRC、TCF7、LTB、LCK、TRAC、CD3G、CD3D、TRBC2、CD7(PanglaoDB)
○ 4-1. 效应记忆(EM;Tem):通过外周组织循环。
○ (+) CD45、CD3、CD4、CD44、CD45RO
○ (-) CD62L、CCR7
○ 4-2. 中枢记忆(CM;Tcm):保留在次级淋巴器官,具有较强的增殖能力。
○ (+) CD45、CD3、CD4、CD44、CD62L、CD45RO、CD62L、CCR7
⑬ 状态 5. 效应器
○ (+) CD45RA
○ (-) CD62L、CCR7
⑭ 状态 6. 有经验
○ (+) INPP5F、GPR25
⑮ 状态 7. 祖细胞耗尽
○ (+) TCF1/TCF7、PD-1、TIM-3> ⑯ 状态 8. 极度疲惫
○ (+) Tox/Tox2、PDCD1 (PD-1)、TIGIT、HAVCR2、LAG3、CTLA4、ENTPD1
⑰ 状态 9. 不成熟
○ (+) Rag2、Arpp21、Rag1、A930003A15Rik、Dntt、Syt13、Capn3、Cd8a、Ccr9、Cd8b1(白板)
⑸ A-3. NKT 细胞(自然杀伤 T 细胞)
① (+) CD56、CD3
② 1 类. I 型 NKT (iNKT)
○ (+) TCR、Va24、Vβ11
○ (+) CMC1、KLRB1、HIST1H1D、DUSP2、TXK、CD69、CD3E、CITED2、HIST1H1E、AREG(白板)
③ 2 类. II 型 NKT
④ 3.类成熟NKT细胞
○ (+) KLRF1、PRF1、FGFBP2、GNLY、IL2RB、GZMB、NKG7、SAMD3、CTSW、PYHIN1(白板)
○ (+) CCL5、IL32、LOC105874071、RPS27、RPL13A、GZMA、TMSB10、RPS11、LOC105881712、CST7(Tabula Microcebus)
⑤ 4 类. CD4+ NKT 样细胞
○ (+) CD4、CD56、CD2、CD16、CD94、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、NKp46、CD11b、CD161、CD314、CD69、NKG7、CD122、NKG2D、GZMB、GZMA、GZMM、COX6A2、ZMAT4、KIR2DL4(sc 型)
⑥ 5类. CD8+ NKT细胞
○ (+) CD8、CD56、CD2、CD16、CD94、CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、NKp46、CD11b、CD161、CD314、CD69、NKG7、CD122、NKG2D、GZMB、GZMA、GZMM、GNLY、COX6A2、ZMAT4、KIR2DL4(sc 型)
⑹ A-4. 自然杀伤细胞 (NK)
① pan-NK细胞(普通NK细胞)
○(+)NCAM1、NCAM2、FCGR3A、CD56、CD94、NKp46、KLRB1、KLRC1、KLRD1、KLRF1、KLRK1、NCR1、FCGR3B、KLRG-1、GNLY、CD244、PRF1、FCER1G、CD247、NK1.1、CCL3、SLAMF6、 NCR2、TNFRSF18、LAG3、CD7、NCR3、KIR3DL1、XCL1、CD160、CD49b、IL-15、FGFBP2
○ (+) Klra8、Gzma、Klra23、Ncr1、Klra18、Ccl5、Gzmb、Cma1、Klra9、Klre1(白板)
○ (+) CCL5、GZMA、LOC105874071、IL32、TMSB10、NKG7、LOC105881712、CST7、LOC105881899、LOC105855163(Tabula Microcebus)
○ (+) CD56、CD2、CD16、CD94、NKp46、CD11b、CD161、CD314、CD69、NKG7、CD122、NKG2D、GZMB、GZMA、GZMM、FCGR3A、GNLY、COX6A2、ZMAT4、KIR2DL4(sc 型)
○ (+) CD69、KLRD1、GNLY、NKG7、IL32、GZMH、CTSW、CCL4、CD2、CCL5、GZMA、GZMB、DUSP2、CST7、CXCR4、S100A4、IL2RG、HOPX(PanglaoDB)
○ (+) GNLY、NKG7、KLRD1、KLRF1、CTSW、PRF1、KLRB1、GZMB、HOPX、CCL4 (3CA)
○ (-) CD3D、CD3E、CD3G、CD3Z、CD4、CD8(sc型)
② 1类. PB成熟NK细胞
○ (+) CD16
○ (-) CD56
○ 1-1. 细胞毒性
○ (+) 颗粒酶、穿孔素
③ 2 类. PB 未成熟/调节性 NK 细胞
○ (+) CD56、NCR
○ (-) CD16
④ 3. CD3 阴性 NK 细胞:更一般
○ (-) CD3
⑤ 4. CD3 阳性 NK 细胞
○ (+) CD3
⑥ 状态 1. 已激活
○ (+) CD69
⑦ 状态 2. 不成熟
(+) SCN1B、SNORD3B-1、RUNX2、CIDEB、TMIGD2、STAC、TNFSF4、BCAS1、PCDH9、TSIX(白板)
⑺ A-5. 核细胞
⑻ B-1. 粒细胞
①全粒细胞
○ (+) CD203c、CD15、CD11b、CD63、CD66b、CD123、CD16、CD33、CD117、CD45、Fc-ε RI-α、CD125、CD13、CD14、CD25、CD44、CD69、CD9、HLA-DR、CCR3、CD116、CD11c、CD193、 CD24、CD32、CD43、CXCL8、FCGR3B、MNDA、SIGLEC8、AZU1、MPO、CTSG、LYZ(sc 型)
○ (+) MPO、AZU1、PRTN3、ELANE、MS4A3、CLEC11A、RNA酶3、MKI67、TOP2A、UHRF1(白板)
○ (+) S100a8、S100a9、Krt81、Ngp、Camp、Lcn2、1100001G20Rik、Ceacam10、Mmp8、Retnlg(白板)
② 1.类嗜碱性粒细胞:分散形式的颗粒
○ (+) MS4A2、FcεR1α、Hgf
○ (+) CD22、CD63、CD203c、CD123、CLC、MS4A3、TCN1、CPA3、HDC、GATA2、MS4A2、IL4、GCSAML、TPSAB1(sc 型)
○ (+) VWA5A、LTC4S、C1orf186、MS4A2、CPA3、TPSB2、HPGDS、TPSAB1、SLC18A2、KIT(白板)
○ (-) CD19、CD45、CD117
○ 1-1. 已激活
○ (+) CD63、CD203c
③ 2. 嗜酸性粒细胞:颗粒形成两团
○ (+) CD45、CD125、CD193、F4/80、Siglec-8、CD16
○ (+) CD11b、CD193、CD123、CD125、CD15、SIGLEC8、CLC、GATA1、CEBPE、SEMG1、ALOX15、CCL23、PRSS41、PRSS33、THBS4、FOXI1(sc 型)> ④ 3. 中性粒细胞:颗粒形成三团
○ (+) CD11b、CD16、CD18、CD32、CD44、CD55、Ly6G、S100A8、S100A9、CSF3R、CD66b、CD15、SSEA1、NEAT1、CEACAM8、Itgb2、CD45
○ (+) CXCR1、CMTM2、MMP25、MGAM、CD177、PADI4、FCGR3B、MMP9、CXCR2、PROK2(白板)
○ (+) S100A12、S100A9、S100A8、CAMP、ACTB、LTF、TMSB4X、LCN2、RETN、PGLYRP1(Tabula Microcebus)
○ (+) CD66b、CD11b、CD15、CD16、CXCL8、FCGR3B、MNDA、CXCR2、MPO、ELANE、PRTN3、MPO、AZU1、LYZ、S100A8、S100A9、PI3、CHI3L1、ANXA3、CXCL1、TGM3、BTNL3、C4BPA、 MMP9、CD24、BPI、LTF、GCA、Camp、Ngp、Chil3、Ltf(sc 型)
○ (+) MPO、LYZ、ELANE、S100A8、PRTN3、AZU1、CTSG、SERPINB1、S100A4(PanglaoDB)
○ 3-1. cd24 中性粒细胞
○ 3-2. nampt 中性粒细胞
⑤ 4级. 肥大细胞
○ (+) CD32、CD33、CD117、CD203c、FcεR1α、MS4A2、类胰蛋白酶、C5ar1、GATA2
○ (+) CD117、CD203c、CD25、KIT、SLC18A2、CD33、CD32、FCER1A、TPSD1、HPGDS(sc 型)
○ (+) HDC、TPSB1、TPSB2、CPA3、MS4A2、C1orf186、HPGDS、KIT、SLC18A2、VWA5A(白板)
○ (+) KIT、CPA3、TPSAB1、IL1RL1、RGS1、HDC、TPSB2、RGS13、MS4A2、VWA5A、HPGDS、DUSP1(PanglaoDB)
○ (+) CPA3、CMA1、CTSG、SIGLEC6、MS4A2、HDC、PRG2、SLC18A2、TAL1、TPSAB1、SIGLEC8、HPGDS、AMHR2、LAX1、NDST2 (SCEVAN)
○ (+) TPSB2、TPSAB1、CPA3、MS4A2、HPGDS、VWA5A、LTC4S、SLC18A2、KIT、HPGD (3CA)
○ 4-1. 已激活
○ (+) CD203c
⑥ 5. 类粒细胞生成细胞
○ S100a8、S100a9、Camp、Ngp、Fcnb、Lcn2、Chi3l3、1100001G20Rik、Cebpe、Ltf(白板)
⑼ B-2. 树突状细胞 (DC)
①泛树突状细胞
○ (+) IL3RA、CD1C、BATF3、THBD、CD209、CD11C、HLA-DR、CLEC4C、NRP1、FCER1A、CD14、ETV6、CD80、CD86、ADGRE5、IL2RG、LILRA4、CMRF-44、IFNa、BTLA、CADM1、ITGAE、LY75、 CLEC4K、CD1B、ITGAM、H2-Ab1
○ (+) CD86、CPVL、HLA-DPB1、HLA-DPA1、HLA-DQB1、HLA-DMB、HLA-DMA、CXCL16、HLA-DRA、YWHAH(白板)
○ (+) TMSB4X、CD74、LOC105869751、LOC105872012、CST3、LOC105876793、TMSB10、RPS27、IFI30、LOC105869753(Tabula Microcebus)
○ (+) S100A9、HLA-DRA、HLA-DQA1、HLA-DMA、HLA-DQB1、HLA-DRB1、HLA-DPA1、HLA-DPB1、S100A4、CLEC7A、AIF1、LST1、CTSS、PTPRC、FTL、ANXA1、LGALS3、H2AFY、HLA-A、HLA-B、 HLA-C (PanglaoDB)
○ (+) SYNGR2、HLA-DQA2、FMNL1、PNRC1、NUB1、LGALS2、HLA-DPB1、FLT3、LSP1、EIF3L (3CA)
② 1 类. 活化树突状细胞 (aDC)
③ 2 类. 未成熟树突状细胞 (iDC)
④ 3级肝树突状细胞
○ (+) HLA-DRB5、SNRPGP14、HLA-DQA1、FCER1A、P2RY6、HLA-DQB1、S100B、RAB7B、CLEC10A、RP11-242C19.2(白板)
⑤ 4.类成熟常规树突状细胞
○ (+) IDO2、FSCN1、CCL22、GPR157、TVP23A、IDO1、WFDC21P、TBC1D8、LAMP3、EBI3(白板)
⑥ 5.类骨髓树突状细胞
○ (+)ITGAX、CD83、CD1C、NRP1、CLEC4C、CD86、IL3RA、CD80、CD1A、ITGAX、CD40、HLA-DQA1、CD11c、HLA-DR、HLA-DPB1、HLA-DPA1、CLEC10A、CST3、GPR31、ODF3L1、PRB2、CD207、ARSE、 CLEC141、MRC、EBLN1、CRIP3(sc 型)
○ 5-1. cd1c 阳性骨髓树突状细胞
○ (+) MRPS6、C15orf48、KYNU、HLA-DQA2、VMO1、EPB41L3、IL4I1、TFRC、GK、AGPAT9(白板)
○ 5-2. cd141 阳性骨髓树突状细胞
○ (+) LGALS2、WFDC21P、CPVL、C1orf54、EBI3、BATF3、CLIC2、ADRBK2、HLA-DQA1、FLT3(白板)
⑦ 6级. 少突胶质细胞
⑧ 7 类。 浆细胞样树突状细胞 (pDC):一种罕见的 DC 亚型。该细胞参与血液中的免疫系统,并产生过量的干扰素 1。pDC 分泌 IFN-α 来激活 T 细胞,但分泌颗粒酶 B 来抑制 T 细胞扩增。» ○ (+) SIGLECH、KLK1、HLA-DR、IL3RA (CD123)、IRF8、TCF4 (E2-2)、SPI1 (PU.1)、FLT3L
○ (+) ITGAX、CD83、CD1C、NRP1、CLEC4C (BDCA-2)、CD86、IL3RA、CD80、CD1A、ITGAX、CD40、HLA-DQA1、CD11c、HLA-DR、HLA-DPB1、HLA-DPA1、CLEC10A、CST3、TPM2、LRRC26、ASIP、 GPM6B、KRT5、NTM、SCT、SHD、KCNA5、SCARA5、EPHA2、MYMX(sc 型)
○ (+) IRF7、SLC15A4、PLD4、LAMP5、IRF4、RUNX2、GZMB、BCL11A、CHAF1A、ADA(白板)
○ (+) LILRA4、GPR183、PTCRA、FAM129C、SPIB、GZMB、CXCR4、IRF7、IRF8、JCHAIN、SERPINF1、ITM2C、TCF4、BCL11A、MZB1、DERL3、NRP1(PanglaoDB)
○ 7-1. 已激活
○ (+) CD83
⑨ 8 类. 常规 DC (cDC):先天免疫细胞之一。
○ (+) CD11c、HLA-DR、LY75
○ 8-1. cDC1(擅长交叉演示)
○ (+) XCR1、CLEC9A、THBD、BATF3、CADM1、IRF8
○ 8-2. cDC2
○ (+) CD1C、SIRPα、CLEC10A、FCER1A、IRF4、ITGAX
○ 状态 1. 已激活
○ (+) CD83
⑩ 9. 功能缺陷 DC
⑪ 10 类. 调节性 DC(regDC;耐受性 DC;tDC)
○ (+) MHC II、CD11b、CD11c、PD-1、B7-H1、LAMP3、CD83
○ 10-1. CD83highCCR7+ IL-10DC
○ 10-2. CD83lowCCR7- IL-10DC
○ 【目前未发现明确的表面标记】(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3717058/#:~:text=do%20not%20yet%20have%20a%20specific%20marker)
⑫ 11 类. 类朗格汉斯 DC (LanghDC)
⑬ 12. 类迁徙 DC (migDC)
⑭ 13 级. AXL+SIGLEC6+ DC (ASDC)
⑽ B-3. 巨噬细胞
①泛巨噬细胞
○ (+) CD11b、CD68、CD163、ADGRE1、ITGAM、CSF1R、CD14、FCGR3A、Cd74、Arg1、CD80、CD86、CXCL5、APOC1、BASP1、FAM49A、GJB2、LPXN、LY86、MAP3K8、MNDA、PLD4、PPARG、SEC24A、 SERPINB9、IL1a、IFNb2、CDF、BSF1、BCGF1、TGIF、CSIF、IL13、P600、CSFR、CLEC13D、M130、PDL2、B7DC、RETNLB、CCR2、CSF1、CLEC6A、ITGB2、PDCD1LG2、CSF2、LYZ、PLAUR、LST1、IBA1、CD169、 Mrc1、Ccr1、Dab2、CD169、LY6G、MGL2、F13a1、SELENOP、CD45
○ (+) MARCO、ACP5、OLR1、PLTP、SLCO2B1、MS4A4A、C1QC、MSR1、FBP1、MRC1(白板)
○ (+) Cd300c、Siglech、Apol7c、Gm8221、H2-M2、Cox6a2、Lilra5、Atp2a1、Cd209g、Cd209f(白板)
○ (+) FTL、FTH1、LOC105882215、CD74、TMSB4X、APOE、CST3、LOC105869751、C1QA、SPP1(Tabula Microcebus)
○ (+) CD68、CD163、CD14、CD11b、CD206、CD80、CD86、CD16、CD64、CCL18、CD115、CD11c、CD32、HLA-DR、MRC1、MSR1、GCA、Pf4(sc 型)
○ (+) ITGAM、FCGR3A、LILRB4、TREM2、CXCL16、CD83、RBPJ、GPNMB、VSIG4、MS4A4A、C5AR1、CCL2、S100A4、NRP2、CD36、MS4A7、CLEC7A、CD74、CSF1R、LGALS3、CYBB、ITGAX、TYROBP、 DAB2、MAF、AIF1、CYP27A1、SLC7A7(PanglaoDB)
○ (+) CD68、CD163、MS4A4A、CYBB、FCER1G、CLEC5A、MS4A6A、HK3、MSR1、IGSF6、CHIT1、DNASE2B、FDX1、SLAMF8、VSIG4 (SCEVAN)
○ (+) C1QA、C1QB、C1QC、CD14、AIF1、MS4A7、LYZ、FCGR2A、CSTB、CD68 (3CA)
○ (-) CD56、CD11c
② 1 类. M1 巨噬细胞
○ (+) iNOS、IL-6、CD86、CD80、CD68、MHCII、IL-1R、TLR2、TLR4、SOCS3、ITGAX (CD11c)、CD16、FCN1、HLA-DR、pSTAT1、IL-12、MHC-II、CD80、27E10、CCL2、S100A8、S100A9、 CXCL9、CXCL10
③ 2. M2 巨噬细胞
○ (+) MRC1、CD163、CD204、CD206、VEGF、cMAF、ARG1、YM1、CCL20、CCL22、1IDO1
○ 2-1. M2a
○ (+) CD163、SR、CD206、CD200R、TGM2、DecoyR、IL-1R II、Fizz1、精氨酸酶-1、MHCII
○ 2-2. M2b
○ (+) CD86、MHCII
○ 2-3. M2c
○ (+) CD163、TLR1、TLR8
○ 2-4. M2d
○ (+) VEGF
○ 2-5. 肿瘤相关巨噬细胞 (TAM)
○ (+) CCL2、CD3、CD31、CD68、CD163、HLA-DR、iL-10、iNOS、PCNA、VEGF
○ 2-5-1. 组织驻留巨噬细胞
○ (+) C1QC+
○ 2-5-2. 经典肿瘤浸润巨噬细胞
○ (+) LYZ+
○ 2-5-3. 血管生成巨噬细胞
○ (+) SPP1
○ 2-6. TCR 阳性
○ (+) CD68、Fyn、LAT、Lck、ZAP70
○ 2-7. CD169-阳性»> ○ (+) CD11b、CD11c、CD68、F4/80、MHCII
④ 1 类. 骨髓源性巨噬细胞 (BMDM)
⑤ 2.级尘埃盒
⑥ 3 类. 库普弗细胞
○ (+) CLEC4F、ID3、ZEB2、LXRα、CD206
○ (+) CD14、CD68、TNF、LYZ、MPO、VSIG4、PROK2、STARD5、MSR1、PPARA、TREM1、SLC11A1、MMP13、VDR、CHIT1、OSM、PPARD、CLEC4F、ADGRE1、IL1B、SLC40A1、G6PD、TIMD4、MNDA、SLC15A3、 DNASE1L3、MARCO、HFE、CD38、CD163、CCR5、CLEC1B、CLEC4G、GPIHBP1、FOLR2、PLTP、FTL、IRF7、SPIC、CSF1R、C1QC、C1QA、C1QB、CLEC4E(sc 型)
⑦ 4.类小胶质细胞
○ (+) BHLHE41、SLC2A5、HAMP、FCGR1A、SLC1A3、AP1B1、B3GNT5、HAVCR2、LILRB4、CSF1R(白板)
○ (+) NAIP、CX3CR1、P2RY12、CCR1、FGD2、FCGR2A、DOCK8、TREM2、FOLR2、ADAM28、C1QC、P2RY13、C1QA、CD68、C1QB (SCEVAN)
○ 4-1. 眼部小胶质细胞
○ (+) P2RY12、ITGAM、CD40、PTPRC、CD68、AIF1、CX3CR1、TMEM119、ADGRE1、C1QA、NOS2、TNF、ISYNA1、CCL4、ADORA3、ADRB2、BHLHE41、BIN1、KLF2、NAV3、RHOB、SALL1、SIGLEC8、SLC1A3、 SPRY1、TAL1、CX3CR1、CX3CL1(sc 型)
○ 4-2. 脑小胶质细胞
○ (+) IBA1、Cd68、TMEM19、P2RY12、SALL1、CD11b、CD169、CD68、CD86、CD26、IBA1、Csf1r、Selplg、Laptm5、Tmem119、C1qa、Trem2、Cx3cr1、Itgam、HLD-DR、CD44、CD45
○ (+) P2RY12、ITGAM、CD40、PTPRC、CD68、AIF1、CX3CR1、TMEM119、ADGRE1、C1QA、NOS2、TNF、ISYNA1、CCL4、ADORA3、ADRB2、BHLHE41、BIN1、KLF2、NAV3、RHOB、SALL1、SIGLEC8、SLC1A3、 SPRY1、TAL1(sc 型)
○ 1 型. DAM(疾病相关小胶质细胞)
○ (+) Cd74、Itgax、Clec7a
○ (+) Cd74、Clec7a、H2-D1、Lpl、H2-Q7、H2-Aa、Itgax、H2-Ab1、H2-Eb1、Axl、Irf7、H2-Q6、Lgals3bp、Oasl2、Cd52、B2m、Ly9、H2-K1、Cox6a2、Rpl41、Cd72、 Atp1a3、C3、Cd300lf、Plaur、Ccl5、Ch25h、Ccl3、Cxcl16、Cd83、Ccl6、Hif1a、Abcg1、Rab7b、Cyp4f18、Tlr2、Arrdc4、Ccl4、Slc2a6、Bhlhe40、C4b、Nceh1、Pkm、Id2、Gng12、 Plekhm2、Atf3、Alas1、Aldoa、Gaa、Alpp2、Smg9、ENSMUSG00000106106 (Androvic_DAM)
○ (+) 5430435G22Rik、Clec7a、Baiap2l2、Cox6a2、Psat1、Capg、Lgi2、Nceh1、Fxyd5、Apbb2、Ifi27l2b、Cd63、#Cd63-ps、Cadm1、Sulf2、Kcnj2、Myo1e、Scpep1、Rps24、 #Rps24-ps3、Cd34、Slamf9、Crlf2、AL928935.1、Bcl2a1b、Gm6030、Cd74、Serpine2、Gm16247、Echs1、Gm7331、Gm7363、Gm5239、Rpl36a、Rpl36a-ps1、Scd2、Gm5805、 Gm10136、Gm9493、Gm15772、Gm10186、Tyrobp、Mir682、Naglu、Gm13192、Mt1、Gm10443、Ssr4、Gm13826、Atp6v0c、Gm10279、Gm5963、Gm5244、Hif1a(Hammond_DAM)
○ 2 型。 ARM(激活反应小胶质细胞)
○ (+) Gpnmb、Lgals3、Fabp5、Lgals1、Lilrb4a、Ccl9、Anxa5、Gm1673、Gm10116、Anxa2、Lag3、S100a1、Fabp3、Gpx3、Plin2、Cstb、Plaur、Folr2、Vat1、Gng12、Pkm、Hpse、Ldha、 Atp6v0d2、Tmem106a、Gpr137b、Tpi1、Lamp1、Ifitm2、Slpi、Adssl1、Cd68、Aig1、Ybx1、Slc16a3、Ctsa、Bnip3、Pgk1、Sepp1、Timp2、Sh3bgrl、Eno1b、Crip1、Creg1、Psmb6、Gatm、Aprt、 X0610012G03Rik、Uap1l1、Chchd10、Plek、Npl、Ctsd、Atp1a1、Eno1、Dab2、Clta、Wbp5、Gpi1、Cyba、Vps29、Edem1、Emp3、Cd28、C3ar1、Dtnbp1、Glmp、Spcs2、Fabp3.ps1、Gabarap、Bri3、 Akr1a1、Alas1、Lmo2、Degs1 (Hammond_ATM)
○ 3型. LDAM(脂滴积聚小胶质细胞)
○ (+) Gpnmb、Lgals3、Apoe、Hpse、Ftl1、Cst7、Cybb、Spp1、Fth1、Cd63、Igf1、Ctsb、Lyz2、Crip1、Anxa5、Fabp5、Fam20c、Plin2、Capg、Atp6v0d2、Soat1、Tpi1、Pld3、Tmem106a、 Mif、Apoc1、Csf1、Anxa4、Slc66a1、Ctsd、Rps26、P2rx4、Gpi1、Anxa2、Cd48、Nhp2、Vim、Lck、Gapdh、Tecpr1、Rtcb、Timp2、Coro1c、Ahnak2、Pla2g7、Aprt、Rftn1、Prelid1、Rrp12、 Tubb5、Plbd2、Tmem205、Rab3d、Akr7a5、Xrcc1(Androvic_Foamy)
○ 4. 损伤反应性小胶质细胞
○ 5 型. IRM(干扰素反应小胶质细胞)»» ○ (+) Usp18、Stat1、Ifit1、Iigp1、Ifitm3、Ifit2、Gm4951、Phf11a、Phf11b、Tgtp2、Ifi209、Oasl1、Ifit3b、Ifit3、Phf11d、Ifi27l2a、Rtp4、Sp100、Trim30a、Herc6、 Irgm1、Ccl12、Rnf213、Ifi204、Isg20、Lta4h、Mgat1 (Androvic_IRM)
○ (+) Ifi27l2a、Ifitm3、Ccl12、Bst2、Ifit3、Isg15、Ifi204、Irf7、Cxcl10、Oasl2、Rtp4、Ccl5、B2m、Rps28、Rps29、Rpl41、Ch25h、Gm10076、Slfn2、H2-Q7、Zfos1、 Tspo、Stat1、Cd72、Rpl32、Rpl10a、Rpl37a、Usp18、Ccl2、Rpl38、Tor3a、Rps19、Rpl36、Phf11b、Rpl35、Rpl39、Rps16、Oas1a、Ifit2、Zbp1、Rps26、Rsad2、Gm4951、Rpl37、 Trim30a、Rps18、Sp100、Rps20、Ly6e、Rps24、Fau、Fcgr4、Rps12、Ly6a、Parp14、Rpl19、Rps15a、Rps27a、Ifit1、Rpl24、Grn、Rpsa、Rps27rt、Gm9843、Rps27、Xaf1、Rpl12、Rpl26、 Rps2、Wdr89、Rpl28、Rps21、Rpl35a、Rplp2、Rpl22l1、Gm2000、Rps11、Rpl36a、Cxcl13、H2-Q4、Rpl29、Rps5、Rpl31、Rps25、Stat2、Rps8、Rps15、Rpl27a、Rps10、Rpl34、 AI607873、Rps14、Mnda、Rplp0、Rps13、Rpl18a、Rps23、Rpl9、MX1、Rpl21、Pyhin1、Rpl17、Rpl22、Rps7、Psme1、Tpt1、Rpl15、Phf11d、Gm4955、Rpl27、Rps6、Rpl7a、Fgl2、 Ms4a4c、Rps17、Rpl13a、Gapdh、Rpl6、Gnb2l1、Ifit3b、Rpl30、Rpl13、Rpl23a、Rpl18、Tap1 (Hammond_IRM)
○ 状态 1. 成熟的小胶质细胞
○ (+) P2ry12、Fcrls、丝氨酸2
③ APC(抗原呈递细胞)
○ (+) H2-Ab1
⑧ 第 5 类. 脾细胞
⑨ 6.类免疫抑制巨噬细胞
○ (+) CD163、MSR1
⑩ 7 类. TIM4+ 血管周围巨噬细胞
○ (+) TIM4、LYVE1、FOLR2、cMAF
○ (-) MHCII
⑪ 8 类. MHCII+ 血管周围巨噬细胞
○ (+) MHCII、cMAF
○ (-) TIM4、LYVE1
⑫ 9类. CNS相关巨噬细胞
○ (+) Mrc1、Cd163、Msr1
⑬ 10 类. 促纤维化巨噬细胞
○ (+) SPP1、FN1
⑭ state 1. 老化巨噬细胞
○ (+) Cd274、Clec4d
○ (-) Coro1a
⑾ B-4. 单核细胞
① (+) CD14、FCGR1A、CD68、S100A12、NR4A1、CD4、CD11C、HLA-DR、SPI1、NCF2、IBA1、CD11b、CD169
② (+) FOLR3、TCIRG1、RP11-1143G9.4、RNA酶2、SULT1A1、FCN1、CD300E、PRAM1、ARHGAP4、C19orf38(白板)
③ (+) Lyz2、Lyz1、Galnt9、Ms4a8a、Apoc2、Gm9733、Ms4a6c、Ccr2、Ccl9、Ccl6(白板)
④ (+) FTH1、SOD2、TMSB4X、CCL15、LGALS1、CD74、S100A4、PGLYRP1、CXCL8、FTL(Tabula Microcebus)
⑤ (+) OAS1、IRF7、PLSCR1、MX1、HLA-DRA、IFIT1、IFIT3、TNFSF10、S100A9、S100A4、CD44、PTPRC、PSAP(胖老数据库)
⑥(-)CD206、CD86
⑦ 1 类. 经典单核细胞(C 单核细胞)
○ (+) CD14、S100A8、S100A9
○ (+) CD14、CD11b、CD68、HLA-DR、CD33、CD11c、CD123、CD15、CD3D、CD3G、CD3Z、CD66b、VCAN、S100A12、CXCL8、S100A8、S100A9、LYZ、CST3、Elane1(sc 型)
○ (+) FLT3、TMEM170B、IFI30、RNA酶2、FCN1、ADAMTS2、EMILIN2、CD33、SH3BP2、SLC43A2(白板)
○ (-) CD56, CD16 (=FCGR3A) (sc型)
⑧ 2.类非经典单核细胞(N单核细胞)
○ (+) FCGR3A (CD16)、CDKN1C、MTSS1
○ (+) CD16、CD11b、CD68、HLA-DR、CD33、CD11c、CD123、CD15、CD3D、CD3G、CD3Z、CD66b、FCGR3A、CDKN1C、LST1、FCER1G、MS4A7、RHOC、S100A8、S100A9、CST3、C1QC、Elane1 (sc型)
○ (+) LRRC25、CSF1R、LILRB2、FCGR3A、CD86、LST1、MS4A6A、CLEC7A、C3AR1、MS4A4A(白板)
○ (-) CD14
○ (-) CD56(sc型)
⑨ 3类. 中间单核细胞(I单核细胞)
○ (+) CD14、CD16、CD11b、CD68、HLA-DR、CD33、CD11c、CD123、CD15、CD3D、CD3G、CD3Z、CD66b、IL1B、S100A8、S100A9、CST3、C1QC、Elane1(sc 型)
○ (+) FBXL5、BID、CD300E、FGL2、MPEG1、RNA酶2、C3AR1、LILRB2、CYBB、MS4A6A(白板)
○ (-) CD56(sc型)
⑿ B-5. 1 类. MDSC(骨髓源性抑制细胞)> ① (+) Gr-1, CD11b
② 1级. eMDSC(早期MDSC)
○ (+) CD33
○ (-) HLA-DR, 林
③ 2 类. PMN-MDSC(多形核 MDSC)
○ (+) ITGAM (CD11b)、CD33、CD15、CEACAM8 (CD66b)、Ly6G、CXCR2、FCGR3B、IL1R2、LCN2、MMP9、MPO、OLR1、RETN、S100A8、S100A9
○ (-) CD14、Ly6C、HLA-DR
○(低)Ly6C
④ 3 级 M-MDSC(单核细胞 MDSC)
○ (+) ITGAM (CD11b)、CD33、CD14、CCR2、CEBPB、IL10、MERTK、MRC1、MSR1、STAT3
○ (-) HLA-DR、CD15、Ly6C、Ly6G
○(低)HLA-DR
○(高)Ly6C
⒀ B-6. 单核细胞
⒁ B-7. 幼单核细胞
⒂ 第二类。 红细胞(红细胞,红细胞)
① (+) Hbb-bt、Hbb-bs、Hba-a2、Hba-a1、Car2、GATA1、E2f2、Fam46c、Slc25a37、Tfrc、Tmod1
② (+) ALAS2、HBQ1、HBM、EPB42、HBB、HBD、HBA1、HBA2、SLC4A1、TRIM58(白板)
③ 1 类. 成红细胞
④ 2. 类红细胞和红细胞前体细胞
○ (+) CD235ab
○ (+) ALAS2、HBB、HBA1、HBA2、GYPB、AHSP、HBM、FECH、BPGM、HBD、HEMGN、HMBS、NCOA4、SLC4A1、SLC25A39、SLC25A37、EPB42、GYPC、SNCA(PanglaoDB)
⑤ 3 类. 网织红细胞
⒃ 第三类。 巨核细胞:骨髓中的血小板生成
① (+) CD61、CD41、CD42b、CD41a、CD42a、CXCR4、CD110(sc 型)
② 1 类. 血小板
○ (+) CD41、CD42b、CD61、CD31、PPBP、PF4、GNG11、SDPR、CLU、CD41、CD110(sc 型)
○ (+) RUFY1、NRGN、LY6G6F、PRKAR2B、MTURN、MMD、TSPAN33、PF4、CTSA、GP9(白板)
○ (+) CCL5、ITGA2B、PF4、F13A1、GP9、NCOA4、RGS18、PPBP、TREML1、CD9、NRGN、OST4、SPARC、GPX1、CAVIN2、PPPDF、MYL9、MAP3K7CL、GNG11、GRAP2、MPIG6B、ARHGDIB、CDKN2D、 HLA-A、PDLIM1、SRGN(PanglaoDB)
③ 2.类前体细胞
○ (+) CD42b
⒄ 第四类。 祖先
① 共同淋巴祖细胞 (CLP)
○ (+) CD34、CD38、CD10、CD45RA
② 共同骨髓祖细胞 (CMP)
○ (+) CD34、CD38、CD135
○ (+) RP11-620J15.3、PRSS57、DPPA4、CYTL1、GATA1、KLF1、RP11-354E11.2、AC002454.1、MYB、SPTA1(白板)
○ (-) CD7、CD10、CD45RA、CD90/Thy1
③早期祖细胞
○ (+) Epha5、Tcf4、Erbb4
④ 红系细胞
○ (+) GMPR、SLC25A39、HBA2、HBA1、HBB、HBQ1、SNCA、HBD、ALAS2、CA1(白板)
○ (+) LOC105883507、LOC105856254、AHSP、GPX1、PRDX2、LOC105856252、CA2、LOC105856255、RPS12、BLVRB(Tabula Microcebus)
⑤ 红系祖细胞
○ (+) Ter119、Abcb4、Ammecr1、Myh10、Podxl、Tmem56
○ (+) FAM178B、RHAG、KLF1、SPTA1、GATA1、GFI1B、KCNH2、KEL、RP11-620J15.3、CA1(白板)
○ (+) LOC105883507、RPS18、RPS12、ZC3H10、RPLP1、RPL13、RPS20、RPS5、RPL10、RPS14(Tabula Microcebus)
○ (+) PTPRC、GYPA (CD235a)、RUVBL1、TFRC (CD71)、FOLR1、CD36、ITGA4、HBB、CD235a、HBD、CA1(sc 型)
⑥ 粒细胞-单核细胞祖细胞 (GMP)
○ (+) CD34、CD38、CD45RA、CD123、CD135
○ (-) CD10
⑦ 造血干细胞 (HSC)
○ (+) CD34、CD45、CD49、CD90/Thy1、Cd150、Vcam1
○ (+) PRSS57、AVP、CRHBP、DPPA4、PINK2、CYTL1、MYB、KIAA0125、MLLT3、RP11-620J15.3(白板)
○ (+) Ctsg、Mpo、Prtn3、Elane、Nkx2-3、Ms4a3、Kcnk12、Prss57、Muc13、Bex6(白板)
○ (+) CD105、CD34、CD44、CD73、CD45、CD29、STRO-1、NANOG、SOX2、CD133、CD166、CD146、CD31、巢蛋白、OCT4、CD117、KDR、CXCL8、AVP、CRHBP、ALDH1A1、CD49、CD90、CD69、CD24、 CD45RA、角蛋白-19、ASPM、CD10、CD123、ABCG2、CD135、CD49f、EpCAM、角蛋白-7、SCA-1、CD14、CD150、CD271、HLA-DR(sc 型)
○ (-) CD45RA、Cd127、Cd135、PTPRC、CD38
⑧ 巨核细胞-红系祖细胞(MEP)
○ (+) CD34、CD38
○ (-) CD7、CD10、CD45RA、CD135、IL3Rα
⑨ 间充质干细胞(MSC)
○ (+) VIM (波形蛋白), Vim» ○ (+) THBS4、SMOC2、LINC01088、BMPER、GFRA1、PQLC2L、CILP、LAMA2、NEGR1、VGLL3(白板)
○ (+) Ifi205、Ptx3、Ccl11、Lrrn4cl、Saa1、Tnfaip6、Scg3、Stmn4、D630033O11Rik、Mt2(白板)
○ (+) GSN、DCN、LOC105866476、APOD、IGFBP3、JUNB、LOC105866554、EGR1、FOS、CHIT1(Tabula Microcebus)
○ 1类.间充质细胞
○ (+)Hao1、3110079O15Rik、Ucma、Col9a1、Wif1、Mia1、Hapln1、Lect1、Clec3a、Acan(白板)
⑩ 多能祖细胞(MPP)
○ (+) CD34
○ (+) CD105、CD34、CD44、CD73、CD45、CD29、STRO-1、NANOG、SOX2、CD133、CD166、CD146、CD31、巢蛋白、OCT4、CD117、KDR、CXCL8、AVP、CRHBP、ALDH1A1、CD49、CD90、CD69、CD24、 CD45RA、角蛋白-19、ASPM、CD10、CD123、ABCG2、CD135、CD49f、EpCAM、角蛋白-7、SCA-1、CD14、CD150、CD271、HLA-DR(sc 型)
○ (-) CD45RA、CD90/Thy1、PTPRC、CD38
⑪ 浆母细胞
○ (+) Cd38、MHC II 类、CD27、CD38、CD80、
○ (+) ZNF587P1、CTD-2031P19.4、MTND5P11、AC074289.1、ZWINT、RP11-380M21.2、CDC42P6、PHTF1、RNU4-1、CEP128(白板)
⑫ 祖细胞
○ (+) CD105、CD34、CD44、CD73、CD45、CD29、STRO-1、NANOG、SOX2、CD133、CD166、CD146、CD31 (PECAM1)、Nestin、OCT4、CD117、KDR、AVP、CRHBP、ALDH1A1、STMN1、CD38、PTPRC、CD135 (sc型)
⑬ 造血内皮祖细胞
○ (+) CD34
⒅ 组织1. PBMC(外周血单个核细胞)
⒆ 组织2. BALF(支气管肺泡灌洗液)
⒇ 组织3.肿瘤
①肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)
○ (+) CD45、CD3
⒇ 组织4. 胰腺免疫细胞
①免疫系统细胞
○ (+) MS4A1、CD19、CD4、CD8A、CD7、CTLA4、CD27、CCR7、CYTIP、IGHD、CD38、IL2RA、ISG20、SELL、IL7R、FOXP3、IGKC、IGLC3、IGLC2、CD79A、CD68、CD163、CD14、ITGAM、MRC1、MS4A7、 CD3D、CD3E、CD3G(sc型)
②肥大细胞
○ (+) KIT、ENPP3、IL2RA、ISG20、SLC18A2、CD9、FCER1A、TPSB2、FCER2(sc 型)
③间充质细胞
○ (+) ITGB1、NT5E、THY1、ENG、KIT、ALCAM(sc 型)
④ 胰腺祖细胞
○ (+) ONECUT1、PDX1、PTF1A、CXCR4、ISL1、NKX2-2、EPAS1、ARX、NEUROG3、SOX9、RPL23A、CTNNB1、YAP1、RGS16、MFNG(sc 型)
⑤ 胰腺星状细胞
○ (+) TIMP1、RGS5、SPON2、GEM、DYNLT1、PDGFRB、KRT10、CYGB、CCN2、MMP14、NDUFA4L2、PDGFRA、INHBA、TGFB1(sc 型)
○ (+) SNRPE、FAM162B、CDK4、NGFR、SEPT4、PTH1R、HEYL、ARHGAP42、ARHGEF17、SYDE1(白板)
○ (+) TIMP1、SPON2、GEM、DYNLT1、PDGFRB、KRT10、MMP14、NDUFA4L2、COL6A1、FN1、COL4A1、COL6A2、MGP、COL3A1、SPARC、COL1A1、TIMP3、TNFAIP6、COL1A2、SFRP2、COL6A3、THY1 (胖老数据库)
⑥ 胰岛周围雪旺细胞
○ (+) MPZ、EGFL8、GFRA1、OLFML2A、GULP1、SLITRK6、VGLL3、GFRA3、INSC、SLITRK2、FIGN、LRRTM1、SEMA3B、NGFR、PNLIPRP1、GFRA2(sc 型)
○ (+) MPZ、OLFML2A、GULP1、GFRA3、INSC、SLITRK2、FIGN、SEMA3B、NGFR(PanglaoDB)
⒇ 组织5. 肝脏免疫细胞
①免疫系统细胞
○ (+) CD19、MS4A1、IL2RA、PTPRC、CD4、CD8A、CD3D、CD3E、CD3G、CD11c、CD14、CD16、CD56、CD16、CD42b、CD7、CD8、IgD、CD38、CD24、CD20、CD14、CD16、HLA-DR、CD11b、CD11c、 CD123、CD15、CD33、CD66b、CD27、CD94、CD45(sc 型)
② 库普弗细胞
○ (+) CLEC4F、ID3、ZEB2、LXRα、CD206
○ (+) CD14、CD68、TNF、LYZ、MPO、VSIG4、PROK2、STARD5、MSR1、PPARA、TREM1、SLC11A1、MMP13、VDR、CHIT1、OSM、PPARD、CLEC4F、ADGRE1、IL1B、SLC40A1、G6PD、TIMD4、MNDA、SLC15A3、 DNASE1L3、MARCO、HFE、CD38、CD163、CCR5、CLEC1B、CLEC4G、GPIHBP1、FOLR2、PLTP、FTL、IRF7、SPIC、CSF1R、C1QC、C1QA、C1QB、CLEC4E(sc 型)
③肝祖细胞
○ (+) KRT7、KRT19(sc型)
④肥大细胞
○ (+) KIT、ENPP3、IL2RA、ISG20、SLC18A2、CD9、FCER1A、TPSB2、FCER2(sc 型)
⑤间充质干细胞
○ (+) CD44、ENG、NT5E、ITGB1、THY1(sc 型)
⑥ 单核细胞
○ (+) FCGR3A、FCGR3B、CD14、Elane1(sc型)
⑦巨噬细胞
○ (+) Abcc3、Adgre1、Itgam、Mertk、Mrc1、Sdc3
⑧ 髓系» ○ (+) Cd34、Rassf4
⑨ 中性粒细胞
○ (+) Arsb、B4galt6、Gca、Olr1、Sgms2
⒇ 组织6. 眼睛免疫细胞
①小胶质细胞
○ (+) P2RY12、ITGAM、CD40、PTPRC、CD68、AIF1、CX3CR1、TMEM119、ADGRE1、C1QA、NOS2、TNF、ISYNA1、CCL4、ADORA3、ADRB2、BHLHE41、BIN1、KLF2、NAV3、RHOB、SALL1、SIGLEC8、SLC1A3、 SPRY1、TAL1、CX3CR1、CX3CL1(sc 型)
②眼部免疫细胞
○ (+) CD25、CD69、CD4、CD3、ITGAM、C1qa、Fcer1g、CD19、CD20、Trac、Ltb、Cd52、Trbc2(sc 型)
⒇ 组织7.肾脏免疫细胞
①免疫细胞
○ (+) CD19、IGHA2、IGHG3、IGHM、IGKC、JCHAIN、CD40、CD79A、CPNE5、FCRL5、HLA-DRA、IGHA1、IGHG1、IGHG2、IGKV1-12、IGLC2、IGLC3、IGLC7、IGLL5、MS4A1、MZB1、 PKHD1L1、PNOC、POU2AF1、TNFRSF13C、CD3D、TRAC、IL7R、CD3E、CD8A、TRBC2、CD52、FCGR3A、IL32、KLRD1、CD68、CXCL8、FCGR3B、MNDA、KIT、PTGS2、SLC18A2、Trac、Ltb、Cd52、Trbc2、 Shisa5(sc型)
②造血细胞
○ (+) CORO1A、MNDA、SRGN、HLA-DPA1、LST1(sc 型)
⒇ 组织8.脑免疫细胞
①免疫系统细胞
○ (+) MS4A1、CCR6、CXCR3、CD4、IL2RA、ISG20、TNFRSF8、Trac、Ltb、Cd52(sc 型)
② 小胶质细胞
○ (+) IBA1、Cd68、TMEM19、P2RY12、SALL1、CD11b、CD169、CD68、CD86、CD26、IBA1、Csf1r、Selplg、Laptm5、Tmem119、C1qa、Trem2、Cx3cr1、Itgam、HLD-DR、CD44、CD45
○ (+) P2RY12、ITGAM、CD40、PTPRC、CD68、AIF1、CX3CR1、TMEM119、ADGRE1、C1QA、NOS2、TNF、ISYNA1、CCL4、ADORA3、ADRB2、BHLHE41、BIN1、KLF2、NAV3、RHOB、SALL1、SIGLEC8、SLC1A3、 SPRY1、TAL1(sc 型)
○ 1型. DAM(疾病相关小胶质细胞)
○ (+) Cd74、Itgax、Clec7a
○ 2型. ARM(激活反应小胶质细胞)
○ 3型. LDAM(脂滴积聚小胶质细胞)
○ 4. 损伤反应性小胶质细胞
○ 5型. IRM(干扰素反应小胶质细胞)
○ 状态 1. 成熟小胶质细胞
○ (+) P2ry12、Fcrls、丝氨酸2
③ APC(抗原呈递细胞)
○ (+) H2-Ab1
⒇ 组织 9. 月免疫细胞
①肺泡巨噬细胞
○ (+) HLA-DR、CD169、CD206、SIGLECF、CD11c、PPARγ、C/EBPβ
○ (+) FTH1、FTL、TMSB4X、TYROBP、C1QA、RPLP1、LGALS3、CTSD、ACTB、RPS18(Tabula Miceocebus)
○ (+) ABCG1、CCL3、CD36、CLEC7A、CSF2RB、CXCL2、G0S2、GAL、GDA、GNGT2、GPNMB、IL18、IL1B、ITGAX、KLHDC4、MARCO、MCEMP1、MPP1、MRC1、OLR1、PLET1、S100A4、TLR2、TNFAIP2、 TRIM25(sc型)
②间质巨噬细胞
○ (+) HLA-DR、CD206、CD93、CXCR4、PTGDS
○ (-) CD169
③免疫系统细胞
○ (+) ADGRE1、ARG1、BIRC5、CCL17、CCL18、CD14、CD163、CD19、CD22、CD3D、CD3E、CD3G、CD4、CD44、CD5、CD68、CD74、CD80、CD83、CD86、CD8A、CD8B、CDCA3、CDK1、CEBPE、CR2、CSF1R、 EAF2、FCER2、FCGR3A、FLT3、GIMAP3P、HLA-DRA、HMMR、IGHM、IL2RA、ITGAE、ITGAM、ITGAX、LAX1、MS4A14、MZB1、NRP1、NUSAP1、PAX5、PRG2、PTPRC、SLPI、THBD、TNFRSF17、TRBC1、XCR1(sc 型)
⒇ 组织10. 肾上腺免疫细胞
①髓系细胞
○ (+) MS4A14、LILRA1、RP11-554D14.6、AC007040.8、MS4A7、RP11-489O18.1、CLEC10A、MS4A4A、RN7SL138P、CD163、CD14、SIGLEC1、VSIG4、CLEC7A、LILRA2(sc型)
② 红细胞
○ (+) TPSAB1、CTD-2008P7.9、RP11-85G21.3、CTSE、CTA-392E5.1、EIF5AP2、CTA-363E6.6、C17orf99、SLC4A1、TRIM10、MIR144、ART4、AHSP、GYPA、HBM(sc 型)
③淋巴细胞
○ (+) GZMH、XCL1、KLRC3、RP11-94L15.2、GZMA、IL2RB、TRAT1、SH2D1A、DTHD1、CD3E、ZNF831、GNLY、PRF1、IGHD、THEMIS(sc 型)
⒇ 组织11.心脏免疫细胞
①淋巴细胞
○ (+) GZMB、FCRL2、KLRC2、XCL1、LINC00861、PRF1、CD3G、SH2D1B、ANTXRLP1、VPREB3、SH2D1A、CRTAM、CXCR6、RP11-94L15.2、GZMK(sc 型)
② 骨髓细胞
○ (+) XCR1、TMPRSS4-AS1、TIMD4、PRTN3、MMP9、CD86、CLEC5A、SIGLEC1、CLEC7A、C1QC、P2RY13、FCN1、CSTA、CD300LF、MS4A6A(sc 型)
③ 红细胞» ○ (+) RP5-857K21.7、CENPW、SLC46A1、GSPT2、RHCE、SLC7A11、P2RX6、SKA1、FARSA、ZNF90、TMCC2、RP11-225B17.2、TMEM161A、ZNF583、ENPP4(sc型)
⒇ 组织12.肠道免疫细胞
① 成红细胞
○ (+) AHSP、SPTA1、HBG2、HBA2、HBM、HBG1、HBA1、SLC4A1、HBB、GYPA、HEMGN、HBZ、ALAS2、MIR144、MYL4(sc 型)
② 骨髓细胞
○ (+) VSIG4、RPL32P1、CD207、AP000439.1、HCAR3、C5orf20、AC010492.4、P2RY13、LILRB2、LILRB5、IL1B、C1QB、CD163、C1QC、DNASE1L3(sc 型)
③淋巴细胞
○ (+) IL17A、ICOS、SH2D1A、GZMK、RP11-553L6.2、TRGC1、RP11-104L21.3、TRDC、GZMA、VPREB1、CCR4、LTA、NCR2、CD247、RP11-94L15.2(sc型)
⒇ 组织13.肌肉免疫细胞
① 1 类. 成红细胞
○ (+) RHAG、GYPA、AHSP、GYPB、HBZ、ALAS2、SLC4A1、SLC14A1、EIF5AP2、HBM、HBA1、EPB42、RP11-57H12.2、ALS2CR12、SLC25A37(sc 型)
② 2. 类骨髓细胞
○ (+) FCN1、MS4A4E、TMPRSS4-AS1、CD86、FLT3、P2RY13、IL10RA、FOLR2、MNDA、HLA-DQB1、MS4A4A、AMICA1、CYTH4、MS4A6A、CFP(sc 型)
③ 3. 淋巴细胞
○ (+) IL7R、CD8A、NKG7、CD247、NCR1、RP11-61O1.1、TRAC、CD3E、ITK、CD2、MATK、RP11-444A22.1、SYTL1、IL2RB、GZMA(sc 型)
⒇ 组织14.胎盘免疫细胞
① 1. 类淋巴细胞
○ (+) IGJ、IGHM、KLRC3、GZMH、PTGDR、IGHGP、IKZF3、IFNG-AS1、TIGIT、KLRC2、LCK、ANKRD36BP2、TNFRSF18、IGHG3、LINC00861(sc 型)
② 2. 类骨髓细胞
○ (+) SIGLEC10、RP11-1143G9.4、LYZ、ADAMDEC1、LILRB2、HLA-DRB5、SDS、HLA-DOA、SIGLEC1、MMP9、LILRB4、C1QB、TLR2、TLR7、S100A8(sc 型)
⒇ 组织15. 脾脏免疫细胞
① 1. 类淋巴细胞
○ (+) RN7SL337P、KLRC4-KLRK1、RP11-553L6.2、RP11-861A13.4、RP11-38J22.6、ZNF860、RP11-693J15.5、RP11-61O1.1、FCRL3、CTD-2215E18.1、 RP5-1028K7.2、IKZF3、LINC00861、IL9RP3、VAV3-AS1(sc 型)
② 2. 类骨髓细胞
○ (+) CLEC9A、RP11-489O18.1、RP3-522P13.3、RP11-807H22.7、RP11-1080G15.1、FCN1、EMR4P、TMPRSS4-AS1、RP11-157G21.2、CSF2RA、OSCAR、 RP3-522D1.1、CD163L1、RUFY4、DLEU7-AS1(sc型)
③ 3 类. 成红细胞
○ (+) HDC、PRSS57、EIF5AP2、PPAPDC1A、MTL5、CTA-392E5.1、ACSBG1、RP5-964N17.1、GYPA、SLC25A21、RP11-146I2.1、MIR144、SLC2A14、CTA-363E6.6、SLC4A1 (sc型)
④ 4.类白髓巨噬细胞
○ (+) CD68
○ (-) F4/80
⑤ 5. 边缘区巨噬细胞
○ (+) SIGN-R1, LXRα
⑥ 6. 红髓巨噬细胞
○ (+) VCAM1、Spi-C
○ (-) CD11b
⒇ 组织16.胃免疫细胞
① 1 类. 成红细胞
○ (+) KLF1、SLC4A1、HBM、NFE2、HBZ、GYPB、HBG2、HBB、ALAS2、SPTA1、HBA1、HEMGN、RNF224、HBG1、HBA2(sc 型)
② 2. 类骨髓细胞
○ (+) C1QC、HLA-DQB1、MS4A6A、CD14、C1QB、CD163L1、IGSF6、CCDC26、C1QA、NCF2、HLA-DRB1、HLA-DRB5、CLEC7A、MS4A7、HLA-DPA1(sc 型)
③ 3. 淋巴细胞
○ (+) ICOS、CD27、NKG7、CD28、CD3D、CHI3L2、TRAT1、THEMIS、CD52、KLRB1、CD79B、CCL5、TRBC2、SIRPG、CD3E(sc 型)
⒇ 组织 17. 胸腺免疫细胞
① 1.类抗原呈递细胞
○ (+) IL1RN、EBI3、FGD2、MCOLN2、MMP9、TLR10、LINC00996、CD80、CXCL10、SLAMF7、P2RY13、SLC24A4、HCK、C1QB、LYZ(sc 型)
⒇ 组织 18. 膀胱免疫细胞
① 1 类. B 细胞
② 2.类巨噬细胞
③ 3.类肥大细胞
④ 4. NK 细胞
⑤ 5. 类浆细胞
⑥ 6.类浆细胞样树突状细胞
⑦ 7 类. T 细胞
5。 4. 型基质细胞
⑴全基质细胞
① (+) Slc7a10、Slc38a5、Slc36a2、Adrb3、Scn3a、C7、Prkg2、A330076H08Rik、Inmt、Foxf2(白板)
② (+) DCN、PAPPA、SFRP4、THBS2、LY86、CXCL14、FOXF1、COL10A1、ACTG2、APBB1IP、SH2D1A、SULF1、MSR1、C3AR1、FAP (SCEVAN)
⑵ 组织 1.结缔组织
① 概述» ○ (+) ADAMTS5、COL5A2、GPSM2、ITGBL1、TNXB、GPR133、CHRDL1、NBL1、SEMA3C、ELN(白板)
② 1类.脂肪细胞
○ (+) ADH1B、ADIPOQ、ANKRD29、CAVIN2、CLEC14A、EGFL7、HOXD8、HOXD9、KDR、LPL、MMRN2、NOSTRIN、PDCD1LG2、PDE4A、RAMP2、RAPGEF3、SOX18、TFAP2A、TIMP4、UCP1、PLIN1、PPARG
○ (+) STAT6、TFE3、APPL2、APOL6、PXMP2、CAVIN1、MMP2、COL6A2、MT2A、TIMP1、METRN、METRNL、MYO1C、NQO1、SYAP1、CRNDE、TSPO、LRP1、HOXC9(PanglaoDB)
③ 2.类前脂肪细胞
④ 3.类软骨细胞
○ (+) Sox9, Col2a1
○ 3-1. 柱状软骨细胞
○ (+) Sulf1、Robo1
○ 3-2. 早期肥大软骨细胞
○ (+) Runx2、Ibsp
○ 3-3. 晚期肥大软骨细胞
○ (+) Spp1、Mmp9
○ 3-4. 髓核细胞
○ (+) Pax1, Fmod
○ 3-5. 肥大前软骨细胞
○ (+) Prrx1、Fbxl7
○ 3-6. 圆形软骨细胞
○ (+) Sox5、Sox9
⑤ 4.类脂肪细胞
○ (+) GABRA4、SCD、CIDEA、PNLIPRP3、AWAT2、ACSBG1、KRT79、LCN1、GLDC、FAR2(白板)
⑥ 5. 类成纤维细胞
○ (+) DCN、PRELP、RGS5、ACTA2 (α-SMA)、PDGFRB (PDGFRβ)、CD29、FAP、FSP1、CAV1(caveolin 1)、Apod、Apoe、IGF1、MMP1、MMP12、PIM1、TAC1、TCEAL7、FBLN2、Fgr、Ccr2、Ccbe1、MMP11、COL12A1
○ (+) CD248、SFRP2、COL1A1、GAS1、CCDC80、PCOLCE2、ISLR、COL5A1、PLA2G2A、FBN1(白板)
○ (+) DCN、APOD、CFD、MGP、GSN、APOE、FBLN1、LGALS1、MMP2、LUM(Tabula Microcebus)
○ (+) LUM、COL6A2、MMP2、IGFBP6、CDH11、COL6A3、C1S、RARRES2、SPON2、CTGF、COL1A2、COL3A1、VIM、FSTL1、GSN、SPARC、S100A4、COL1A1、MGP、SERPINH1、DCN、EGR1、FOSB、KLF6、 STAT3、CXCL14(PanglaoDB)
○ (+) AMOTL2、DPT、ISLR、SVEP1、FGF7、ELN、TCF21、ASPN、COL14A1、PRDX4、S1PR2、C7、COL6A3、MMP2、VIM (SCEVAN)
○ (+) COL1A2、COL1A1、DCN、COL3A1、LUM、TAGLN、C1S、TPM2、C1R、BGN (3CA)
○ 5-1. 活化成纤维细胞
○ (+) COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL22A1、FAP、NOX4、POSTN、THBS4、NNMT、COL5A1、SPP1、FN1、CTHRC
○ 5-2. 肺泡成纤维细胞
○ (+) MGP、APOD、APOE、DCN、JUN、CTGF、FOS、MFAP4、SELENOP、JUNB(Tabula Microcebus)
○ 5-3. 癌症相关成纤维细胞 (CAF)
○ (+) FAP、THY1、FST1、BGN、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL5A1、COL6A1、COL6A2、COL6A3、CD90.2、FSP1、VIM、PDFGRB、S100A4
○ (-) CD45
○ 5-3-1. CAF-S1(免疫抑制功能)
○ 5-3-1-1. myCAF(肌成纤维细胞)
○ (+) NDUFA4L2、MAP1B、SPARCL1、RGS5、TPPP3、MCAM、FN1、ACTA2
○ (+) HSD17B2、TCF21、FOXF1、NR2F1、PDPN、PLAT、EMILIN1、PDGFRA、APCDD1、CYGB(白板)
○ (+) APOD、APOE、MGP、COL1A2、LGALS1、DCN、COL1A1、TAGLN、FBLN1、CFD(Tabula Microcebus)
○ 类型 1. ecm-myCAF
○ (+) LRRC15、GBJ2
○ 2 型. TGFβ-myCAF
○ 类型 3. 伤口-myCAF
○ 4 型. IFNαβ-myCAF
○ 类型 5. acto-myCAF
○ 5-3-1-2. iCAF(炎症)
○ (+) IL6、CXCL12
○ 类型 1. 排毒-iCAF
○ (+) ADH1B、GPX3
○ 类型 2. IL-iCAF
○ 3 型. IFNγ-iCAF
○ 5-3-2. CAF-S2
○ 5-3-3. CAF-S3(健康组织中含量丰富)
○ 5-3-4. CAF-S4(促转移功能)
○ 5-3-5. CAFap(抗原呈递 CAF,apCAF)
(+) ACTA2、HLA-DRA、CD74
○ 5-4. 乳腺成纤维细胞
○ (+) ARSG、THBS2、JHDM1D-AS1、CLMP、RSPO3、TWIST1、MMP3、LOX、FRMD4A、SLC7A2(白板)
○ 5-5. 心脏组织成纤维细胞
○ (+) CDH19、CRLF1、FMOD、FAIM2、ADAMTSL2、ABCA6、PRLP、MATN2、PLEKHH2、FIBIN(白板)
○ 5-6. 肌成纤维细胞
○ (+) ACTA2、CDH11、CTHRC1
⑦ 6. 杯状细胞
○ (+) CLCA1、FCGBP、MUC2、Ido1» ○ (+) TFF3、FCGBP、STARD10、TSPAN1、CKB、MUC4、GOLM1、TMC5、PIGR、SLC26A2(白板)
⑧ 7. 角膜缘基质细胞
⑨ 8 类. 黑素细胞
○ (+) MIA、TYR、SLC45A2、CDH19、PMEL、MFSD12
○ (+) TYR、MITF、TRPM1、MLANA、TYRP1、DCT、BCAN、PMEL、CHCHD6、GPR143(白板)
⑩ 9.类梭形细胞
⑶ 组织 2. 肌细胞
① (+) CMSS1、MT1A、AXL、SLC7A2、PHLDB2、ADAMTS4、KCNE4、VASN、TWIST1、MTHFD2(白板)
② 1.类支气管平滑肌细胞
○ (+) ENAH、PDLIM7、NTRK3、RASL12、DES、AOC3、GUCY1B3、C2orf40、CASQ2、ACTG2(白板)
③ 2.类心肌细胞(cardiomy cell)
○ (+) Myh6、Myh7、Tnnc1
○ (+) MYH6、TECRL、COL2A1、AC020909.2、NKX2-5、FBN2、TNNT2、MYL4、MYL7、ACTC1(白板)
○ (+) RP11-439H8.4、RNA5SP327、CTD-2552K11.2、Y_RNA、AC018464.3、HHATL、BMP10、RP11-461A8.4、UGT2B4、PRSS42、WI2-1896O14.1、FABP2、EPN3、 RP11-406O23.2,AC009878.2(sc型)
④ 3.类骨骼肌细胞
○ (+) RP11-755O11.2、ASB15、RP11-456H18.2、RPL7P3、PVALB、RN7SL365P、RP11-432J24.5、C8orf22、ASB10、RP5-921G16.2、CLDN9、RP5-1039K5.13、 AC137723.5、RP11-255G21.1、AC093063.2(sc型)
○ 3-1. 成肌细胞
○ 3-2. 肌细胞
○ 3-3. 卫星小区
○ (+) Sds、Myod1、Chrdl2、Asb5、Fam132b、Popdc3、Chodl、Ank1、Gdnf、Des(白板)
⑤ 4. 快肌细胞
○ (+) MYH2、MYL1、KLHL40、TNNC2、TNNI2、MYLPF、RPL3L、ATP2A1、FHL3、MYBPC2(白板)
⑥ 5. 类慢肌细胞
○ (+) MYL1、RP11-451G4.2、RPL3L、MYL6B、MYL2、ANKRD2、MYOZ1、TNNC2、CKM、NRAP(白板)
⑦ 6.类平滑肌细胞
○ (+) AKR1C1、AVPR1A、CCL8、CRISPLD2、CTH、FOXC2、FSTL3、LARS、MYH11、PDGFRB、PDK4、SSTR2、THAP2、TAGLN、Myh11、Pde8b、Mgp
○ (+) OR51E2、AC131025.8、ADORA2B、MYH11、SLC38A11、MIR143HG、MIR145、RP11-1101K5.1、P2RX3、GPR176、ANO1、OR51E1、CORIN、CACNA1C-IT3、TMC4(sc型)
○ (+) MYH10、ITGA8、NOV、SUSD5、SORBS1、MYH11、BGN、CNN1、SMTN、LTBP1(白板)
○ (+) ACTA2、CNN1、NOTCH3、MYH11、ACTG2、SOD3、LMOD1、MSRB3、BGN、MYL9、MYLK、SNCG、PLN(PanglaoDB)
○ 6-1. 气道平滑肌细胞
○ 6-2. 肌上皮细胞
○ (+) CNN1、MYH11、ACTG2、MYLK、MYL9(PanglaoDB)
○ 6-3. 肌成纤维细胞
○ 6-4. 肺血管平滑肌细胞
○ 6-5. 血管平滑肌细胞
○ (+) S100A6、ADIRF、TAGLN、TPM2、ACTA2、MUSTN1、CRIP1、C5H11orf96、TPM1、DSTN(Tabula Microcebus)
⑧ 7类. 腱细胞
○ (+) FMOD、THBS4、TNMD、MYOC、XG、ITGA10、FIBIN、CDO1、GEM、CILP(白板)
⑨ 8. 类舌肌细胞
○ (+) PHACTR3、PAX7、TLN2、CHRNA1、KLHL41、MAP1A、MUSK、H19、HTRA3、NPTX2(白板)
⑩ 9.类血管相关平滑肌细胞
○ (+) RERGL、FHL5、ACTA2、CNN1、MRGPRF、MYLK、ACTG2、TBX2、AOC3、PTP4A3(白板)
⑪ 10.类巨核细胞
○ (+) PF4、ITGA2B、LIPH、ELOVL7、GP6、ITGB3、PTGS1、RP11-480G7.1、RP11-170N16.2、C3orf55、RP4-655J12.4、TUBB1、DCLRE1A、TMEM40、GNAZ(sc型)
⑫ 11 类. 施万细胞
○ (+) UGT8、POU3F1、PMP2、GFRA3、KCNC2、MPZ、SOX10、PTPRZ1、COL20A1、LINC01037、BCAN、C2orf72、C10orf82、RP11-946L20.2、MAG(sc 型)
⑬ 12 类. 基质细胞
○ (+) WSCD2、C13orf45、LINC00645、RP1-300G12.2、RP11-217C7.1、RP11-332E3.2、RP11-473E2.4、CTD-2555C10.3、RP11-342A23.1、WNT10B、ACKR4、 DIO3、CCDC129、ZCCHC5、RP11-38H17.1(sc 型)
⑭ 13. 级卫星细胞
○ (+) AC004014.3、MYEOV、TACR3、GDPD4、USP44、RGR、RP11-320P7.2、FAM132B、GPR123、CTB-175P5.4、ENPP7P10、CHRDL2、PAX7、RP11-706J10.1、MAPK15(sc 型)
⑮ 14类. 子宫肌细胞
○ (+) C16orf45、ACTG2、FHL5、KCNMB1、DES、CNN1、RRAD、HILPDA、LMCD1、PPP1R14A(白板)⑷ 组织3.干细胞
① (+) DMRTA2、FGFR3、RASSF6、COL17A1、PAX6、CHL1、TNS4、KRT12、COL7A1、SYT8(白板)
② 1.类脑神经干细胞
○ (+) SOX2、PROM1、NES、SOX9(sc 型)
③ 2类.癌症干细胞
○ 2-1. 肾癌干细胞
○ (+) EPCAM
○ 2-2. 胰腺癌干细胞
○ (+) CD24、CD44、FLOT2
○ 2-3. 肝癌干细胞
○ (+) ANPEP、CD44、EPCAM、POU5F1、PROM1、THY1
○ 2-4. 肺癌干细胞
○ (+) ABCG2、ALCAM、ALDH1A1、BMI1、CD24、CD44、KIT、NANOG、NES、PDPN、POU5F1、PROM1、SOX2、THY1
○ 2-5. 脑癌干细胞
○ (+) FUT4、MSI1、NES、PROM1、SOX2、THY1
④ 3.类免疫系统干细胞
○ 3-1. 胰腺免疫系统干细胞
○ (+) MS4A1、CD19、CD4、CD8A、CD7、CTLA4、CD27、CCR7、CYTIP、IGHD、CD38、IL2RA、ISG20、卖出、IL7R、FOXP3、IGKC、IGLC3、IGLC2、CD79A、CD68、CD163、CD14、ITGAM、MRC1、 MS4A7、CD3D、CD3E、CD3G(sc 型)
○ 3-2. 肝脏免疫干细胞
○ (+) CD19、MS4A1、IL2RA、PTPRC、CD4、CD8A、CD3D、CD3E、CD3G、CD11c、CD14、CD16、CD56、CD16、CD42b、CD7、CD8、IgD、CD38、CD24、CD20、CD14、CD16、HLA-DR、CD11b、CD11c、 CD123、CD15、CD33、CD66b、CD27、CD94、CD45(sc 型)
○ 3-3. 脑免疫干细胞
○ (+) MS4A1、CCR6、CXCR3、CD4、IL2RA、ISG20、TNFRSF8、Trac、Ltb、Cd52(sc 型)
○ 3-4. 肺免疫干细胞
○ (+) ADGRE1、ARG1、BIRC5、CCL17、CCL18、CD14、CD163、CD19、CD22、CD3D、CD3E、CD3G、CD4、CD44、CD5、CD68、CD74、CD80、CD83、CD86、CD8A、CD8B、CDCA3、CDK1、CEBPE、CR2、CSF1R、 EAF2、FCER2、FCGR3A、FLT3、GIMAP3P、HLA-DRA、HMMR、IGHM、IL2RA、ITGAE、ITGAM、ITGAX、LAX1、MS4A14、MZB1、NRP1、NUSAP1、PAX5、PRG2、PTPRC、SLPI、THBD、TNFRSF17、TRBC1、XCR1(sc 型)
⑤ 4.类间充质干细胞
○ 4-1. 肝间充质干细胞
○ (+) CD44、ENG、NT5E、ITGB1、THY1(sc 型)
⑥ 5级骨骼肌卫星干细胞
⑦ 6. 角膜缘干细胞
⑧ 7类.表皮干细胞
○ (+) ITGA6、ITGB1
⑸ 组织 4. 骨基质
① 1. 类成骨细胞
○ (+) BGLAP、COL1A1、IBSP、Bglap、Alpl
② 2.类破骨细胞
○ (+) TRAP、降钙素受体 (CTR)、组织蛋白酶 K、NFATC1、SMAD2/3、RXR
③ 3. 类骨细胞
④ 4.类破骨细胞前体细胞
⑹ 组织5. 肝基质(肝基质)
① 1. 类造血细胞
○ (+) CD34、PTPRC
② 2.类肝星状细胞(HSC):这些细胞在肝纤维形成中发挥重要作用。它们与内皮细胞和肝上皮细胞相互作用。
○ (+) Desmin、Cd48、Ddx4、Flt3、Kit、Mecom、Procr、Runx1、Slamf1
○ (+) CYGB、PPARG、PDGFRA、RGS5、PPARA、FOXF1、ALB、NR1H4、CCN2、SEMA7A、WT1、FGF10、GFAP、NGFR、VEGFA、ACTA2、MYB、DES、FAP、SLC8A1、RELN、SYP、VCL、TIMP1、COL1A1、TAGLN、 COL1A2、COL3A1、SPARC、RBP1、DCN、MYL9、TPM2、MEG3、BGN、IGFBP7、IGFBP3、CCN1、OLFML3、IGFBP6、CCL2、COLEC11、HGF(sc 型)
○ (+) PPARG、ALB、CTGF、ACTA2、VCL、TIMP1、COL1A1、COL1A2、COL3A1、SPARC、RBP1、DCN、MYL9、TPM2、MEG3、BGN、IGFBP7、IGFBP3、CYR61、OLFML3、IGFBP6、CCL2、COLEC11(PanglaoDB)
③ 3. 肝母细胞
○ (+) AFP、ALB、CEBPA、KRT14、DLK1、CDH1、FOXM1、GGT1、HNF4A、PROX1、MAP2K4、SMAD5、KRT18、KRT8、HNF1B、HHEX、MET(sc 型)
④ 4.类肝细胞:占【肝脏成分】的60-80%(https://jb243.github.io/pages/82#:~:text=%E2%91%A1-,Composition,-%E2%97%8B%20Type%201)。
○ (+) ALB、Apoc4、Uox、Tat、Slc25a47、Cxadr、Gpd1、Hc、Proz、Pzp、Sardh、ASGPR» ○ (+) AFP、HNF4A、KRT8、ALB、KRT18、FOSL1、EPPK1、UCP2、GCK、LRP5、SLC10A1、NOS2、ATP7B、GJB2、FGFR4、PROX1、CRP、SLC2A2、TFR2、KIF13B、LIPC、VDR、ASGR1、ARG1、G6PC、 OTC、SERPINA1、ZHX2、HHEX、FOXA3、FOXA2、FOXA1、CYP2E1、CYP1A2、CEBPA、CDH1、GPC3、AHR、CPS1、GLS2、PCK1、TAT、WT1、PRRG4、SULT1A1、APOH、CTNNB1、ABCC3、FGB、AQP3、PLSCR1、FGA、 APOB、ANG、ANXA13、SAT2、SFRP5、A1CF、APOA1、BNIP3、FGL1、PAH、SERPINA6、APOA2、AZGP1、FGG、APOC3、DEFB1、TM4SF4、GC、AMBP、ORM1、TTR、HAL、ASS1、SCD、HMGCS1、ACSS2、TM7SF2、SEC16B、 SLBP、RND3、BCHE、GHR、ALDH6A1、MASP2、AKR1C1、HAMP、GLUL、ACLY、ASL、TMEM97、CP、SLPI、ACAT2、TM4SF5、MSMO1、LEPR、RCAN1、AR、RPP25L、HSD11B1、APOM、TKFC、G0S2、PON3、C1orf53、 TTC36、FST、MCC、AQP9、GSTA2、NNT、SAA4、MRPS18C、OCIAD1、APOA5、ENTPD5、C4B、EID2、TP53INP2、ATIC、SERPINH1、SAMD5、GRB14、CD3G、RHOB、EPB41L4B、GPAT4、SPTBN1、SDC2、PHLDA1、 WTAP、ACADM(sc 型)
○ (+) MAT1A、AGXT、KNG1、TAT、CRP、ITIH1、HPX、APOA2、CYP2E1、CPS1(白板)
○ (+) ALB、SERPINA1、APOH、FGB、FGA、APOA1、FGL1、APOA2、FGG、APOC3、AMBP、ORM1、TTR(PanglaoDB)
○ 4-1. 门静脉周围肝细胞
○ (+) SDS(糖异生)、Alb、Cyp2f2、Sds(糖异生)
○ 4-2. 中央周围肝细胞(小叶中心肝细胞)
○ (+) GLUL、CYP2E1、Cyp2e1、Gsta3
○ 注意。 pericentral → periportal 渐变(ref)
○ Glul、燕麦、Cyp2a5、Mup9、Mup17、 style=”font-color: Yellow;”>Cyp2c29、Cyp2e1、Mup11、火腿、Ass1、 style=”font-color: blue;”>Serpina1e、Cyp2f2、Alb、Mup20
⑺ 组织 6. 眼基质
① 1. 类双极电池
○ (+) NRSN1、SLC24A2、VSX2、CELF3、STMN4、MDGA2、TMEM179、TMEM196、GNG13、GNG3(白板)
○ 1-1. 棒状双极电池
○ (+) PRKCA、PCP4、RCVRN、SLC1A2、Car8、Sebox、Vsx2、Otx2、GRM3、KCNA4、KCNMA1、RORB、Casp5、Og9x、Vstm2b、Casp7、Rpa1、GABRA1、LHX4(sc 型)
○ 1-2. 锥体双极电池
○ (+) PCP4、RCVRN、SLC1A2、Car8、Scgn、Vsx2、Otx2、MIP、GNAS、ISL1、SLC1A7、GJD2、GNB3、GRIA4、TJP2、LRIT2、Cabp5、Scgn、Vsx1、GABRA1、LHX4、LHX3(sc 型)
② 2. 米勒池
○ (+) Apoe、Glul、Rlbp1、Abca8a、Vim、Aldh1a1、RLBP1、GLUL、PAX6、CA8、EDN2、KCNJ2、PRSS56、RGR、ApoE、Aqp4(sc 型)
○ (+) RLBP1、RAX、FABP7、GFAP、CRABP1、MT-TV、LINC00461、DEFB119、RGR、LINC00632(白板)
③ 3. 星形胶质细胞
○ (+) PRDX6、SLC1a3、PAX2、Rlbp1、GFAP、S100B(sc 型)
④ 4. 视网膜神经节细胞
○ (+) BMP4、GRIA4、GRM3、KCNJ2、MED1、NMT、POU6F2、ZIC2、SLC17a6、Pax6、THY1、Nefl、Pou4f2、SNCG、NRN1、Cerkl(sc 型)
○ (+) NHLH2、SMIM18、CCDC184、NKAIN3、SRRM3、NARF、CPNE4、CACNB3、SLC17A6、DNER、FXYD7、NEFM、SNCG(胖老数据库)
⑤ 5.类视网膜祖细胞
○ (+) PAX6、CALB2、SIX6、RHO、SIX3、NEFH、LGR5、SAG、RAX、NOTCH1、HES1、MSI1、SOX9、KIT、PDGFRA、Og9x、Sfrp2、Fgf15(sc 型)
⑥ 6. GABA能无长突细胞
○ (+) Pax6、Tfap2a、Gad2、Fut4、Calb2、Pvalb、Pcp4、Vip、Thy1、STX1A、MIP、GNAS、ISL1、Gad1、ZEB2、TJP2、SEMA3D、POU6F2、KCNMA1、KCNA4、GRM3、GJD2、FRMPD2、Prox1、Nr4a2、 Ngn2、C1ql2、Reln(sc 型)
⑦ 7级. 水平单元» ○ (+) Rcvrn、Prox1、Ntrk1、Lhx1、Lim2、Calb2、CALB1、LIM1、DLG2、TFAP2B、ZEB2、Lim1(sc 型)
⑧ 8 类. 突触
○ (+) SYP、DLG4、HOMER1、SLC32A1(sc型)
⑨ 9 类. 成纤维细胞
○ (+) PAX6、COL1A1、TGFB1、ACTA2、ICAM1、FBLN1、CRHBP、FN1、PDGFRA(sc 型)
⑩ 10 类. 周细胞
○ (+) Kcnj8、Rgs5、Dlk1、Abcc9、SUR2B、DLK1、VCAM1(sc 型)
⑪ 11.类细胞外基质细胞
○ (+) ANTXR2、COL10A1、EFEMP1、LAMA2、SNTB1、TCF7L2、TGFBR1、TMEM98、VIPR2、ZIC2(sc 型)
⑫ 12 类. 甘氨酸无长突细胞
○ (+) Pax6、Tfap2a、Fut4、Calb2、Pvalb、Slc6a9、Pcp4、Vip、Thy1、STX1A、MIP、GNAS、ZEB2、TJP2、SEMA3D、POU6F2、KCNMA1、KCNA4、GRM3、GJD2、FRMPD2、Prox1、GlyT1、TgfB2、 BE996002、Camkv、TCF4、Efna5、Dab1、Slc6a9(sc 型)
⑬ 13 类. 胆碱能 GABA 能无长突细胞
○ (+) Pax6、Tfap2a、Gad2、Fut4、Calb2、Pvalb、Pcp4、Vip、Thy1、STX1A、MIP、GNAS、ISL1、Gad1、ZEB2、TJP2、SEMA3D、POU6F2、KCNMA1、KCNA4、GRM3、GJD2、FRMPD2、Prox1、Nr4a2、 Ngn2、C1ql2、Reln、VAChT、Tac1、Scube2、Cpne4、Sox2、Slit、SCGN(sc 型)
⑭ 14 类. 速激肽 GABA 能无长突细胞
○ (+) Pax6、Tfap2a、Gad2、Fut4、Calb2、Pvalb、Pcp4、Vip、Thy1、STX1A、MIP、GNAS、ISL1、Gad1、ZEB2、TJP2、SEMA3D、POU6F2、KCNMA1、KCNA4、GRM3、GJD2、FRMPD2、Prox1、Nr4a2、 Ngn2、C1ql2、Reln、ZPF58、Cdh4、Grik4、Grm8、Slit2、SCGN(sc 型)
⑮ 15 类. 星爆无长突细胞
○ (+) Pax6、Tfap2a、Fut4、Calb2、Pvalb、Pcp4、Vip、Thy1、STX1A、MIP、GNAS、ZEB2、TJP2、SEMA3D、POU6F2、KCNMA1、KCNA4、GRM3、GJD2、FRMPD2、Prox1、GAD1、CHAT、SLC5A7(sc 型)
⑯ 16 类. 脂肪细胞
⑰ 第 17 类. 睫状体
⑱ 18 类. 束细胞 (A/B/X/Y):成纤维细胞样(ref)
⑲ 19类. JCT(近小管组织)细胞
⑳ 第 20 类. 视网膜神经元层
○ L1
○ L2
○ L3
○ L4
○ L5
○ L6
○ L7
○ L8
○ L9
○ L10
⑻ 组织 7. 胰腺间质
① 1 类 胰腺腺泡细胞
○ (+) CTRB1、KLK1、RBPJL、PTF1A、CELA3A、PRSS1、SPINK1、ZG16、CEL、CELA2A、CPB1、CELA1、RNA酶1、AMY2B、CPA2、CPA1、CELA3B、PNLIP、CTRB2、PLA2G1B、PRSS2、CLPS、REG1A、SYCN、 PNLIPRP1、CTRC、REG3A、PRSS3、REG1B、CFB、GDF15、MUC1、C15orf48、AKR1C3、OLFM4、GSTA1、LGALS2、PDZK1IP1、RARRES2、CXCL17、GSTA2、ANPEP、LYZ、ANGPTL4、ALDOB(sc 型)
○ (+) AMY2A、CELA3B、CELA3A、CELA2A、CTRB2、CPA2、PRSS3P2、PNLIPRP1、CTRL、PNLIPRP2(白板)
○ (+) PRSS2、CPA1、CTRC、LOC105875474、LOC105873340、CTRB1、LOC105873633、CLPS、PLA2G1B、LOC105873613(Tabula Microcebus)
○ (+) CTRB1、KLK1、CELA3A、PRSS1、SPINK1、CPB1、RNA酶1、CPA2、CPA1、CELA3B、PNLIP、CTRB2、PLA2G1B、PRSS2、CLPS、REG1A、SYCN、PNLIPRP1、CTRC、REG3A、PRSS3、REG1B、GDF15、MUC1、 C15ORF48、AKR1C3、OLFM4、GSTA1、LGALS2、PDZK1IP1、RARRES2、CXCL17、GSTA2、ANPEP、ALDOB(PanglaoDB)
② 2. 胰腺α细胞
○ (+) GCG、LOXL4
○ (+) GCG、TTR、ARX、POU3F4、NKX2-2、RESP18、PYY、PCSK2、SLC38A5、TM4SF4、CRYBA2、NKX6-1、KCNK16、PCSK1、PRRG2、IRX2、ALDH1A1、PEMT、CHGA、SMIM24、F10、SCGN、SLC30A8、 SH3GL2、SCGB2A1、FAP、DPP4、MAFB、PAX6、NEUROD1、PLCE1、GC、KLHL41、FEV、PTGER3、RFX6、SMARCA1、PGR、LDB2、IRX1、UCP2(sc 型)
○ (+) GCG、TTR、PCSK2、TM4SF4、CRYBA2、ALDH1A1、PEMT、CHGA、SMIM24、F10、SCGN、SLC30A8、SCGB2A1、MAFB、NEUROD1、GC、FXYD5(PanglaoDB)
③ 3 级 胰腺 β 细胞
○ (+) INS
○ (+) FXYD2、PDX1、INS、GCGR、JPH3、CD40、HAMP、EZH1、NTRK1、SLC2A2、NKX6-2、NPY、RIMS1、MAFA、EFNA5、LMX1A、NKX2-2、NKX6-1、PAX4、IAPP、PCSK2、G6PC2、SLC30A8、PCSK1、 GJD2、SCGN、IGF2、SYT13、FFAR2、NPTX2、PFKFB2、EDARADD、HOPX、SH3GL2、ADCYAP1、SCGB2A1、CASR、MAFB、PAX6、NEUROD1、ISL1、TGFBR3、SMAD9、SIX3、SIX2、BMP5、PIR(sc 型)» ○ (+) PDX1、INS、MAFA、NKX2-2、NKX6-1、IAPP、PCSK2、G6PC2、SLC30A8、PCSK1、GJD2、SCGN、SYT13、NPTX2、HOPX、ADCYAP1、SCGB2A1、MAFB、PAX6、NEUROD1、ISL1、DLK1、MEG3(庞老数据库)
④ 4. 胰腺 delta 细胞
○ (+) 海温
○ (+) SST、PDX1、FFAR4、PCSK9、RBP4、PAX4、RESP18、HHEX、ISL1、SCGN、KCNK16、IAPP、FXYD2、NPTX2、GPC5-AS1、UCP2、LEPR、BAIAP3、MS4A8、CASR、BCHE、GABRB3、UNC5B、EDN3、PRG4、 FRZB、PCSK1、GABRG2、POU3F1、BHLHE41、EHF、LCORL、ETV1(sc 型)
○ (+) SST、RBP4、HHEX、ISL1、SCGN、IAPP、GPC5-AS1、PCSK1(PanglaoDB)
⑤ 5 级 胰腺 epsilon 细胞
○ (+) GHRL、ANXA13、PHGR1、BMP4、HMGCS2、TM4SF5、OLFML3、ASGR1、COX6A2、NPY1R、SLC7A9、BHMT、OPRK1、PTGER4、ITGA4、EYA4、XYLB、ELOVL2、AFF3、CORIN、MYO1A、HRH2、 SLC6A16、PCSK6、ADAMTS6、COL22A1、FAM124A、COL12A1、CD109、THSD4、ARX(sc 型)
⑥ 6. 胰腺伽马 (PP) 细胞
○ (+) PPY、SCGN、FXYD2、SCGB2A1、GPC5-AS1、CMTM8、ARX、ETV1、PXK、SERTM1、SLITRK6、SEMA3E、APOBEC2、ABCC9、NEUROD1、PAX6、ISL1、CARTPT、THSD7A、AQP3、ENTPD2、PTGFR、CHN2、EGR3、 LMO3、MEIS1、ZNF503(sc 型)
○ (+) PPY、SCGN、SCGB2A1、GPC5-AS1、CMTM8、NEUROD1、AQP3(PanglaoDB)
⑦ 7 类. 朗格汉斯细胞
○ (+) CD1A、兰格林 (CD207)、EpCAM、CD11c、RUNX3、ID2、AHR
○ (+) CD207、CCL22、DAPP1、C15orf48、TRAF1、NEDD4、HLA-DQA2、GNA15、GPR157、HLA-DQB2(白板)
○ (+) HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DRA、HLA-DRB1(PanglaoDB)
⑧ 8. 胰腺 A 细胞
○ (+) GCG、KCNK16、CRH、SLC30A8、CPLX2、NKX2-2、CRYBA2、CHGA、INSM1、RFX6(白板)
⑨ 9 类. 胰腺 D 细胞
○ (+) KCNK16、GCG、SST、CRH、AVPR1B、GAD2、GPC5-AS1、ACTL6B、CPLX2、RP5-984P4.6(白板)
⑩ 10 类. 胰腺 PP 细胞
○ (+) PPY、GPC5-AS1、GAD2、PAM、NKX2-2、CALB1、SLC30A8、ARX、SCG2、STMN2(白板)
⑪ 11 类. B 型胰腺细胞
○ (+) KCNK16、GAD2、G6PC2、IAPP、FAM159B、RP5-984P4.6、MIR7-3HG、NKX2-2、SLC30A8、CELF3(白板)
⑼ 组织 8. 肠间质
① (+) TRAC、TRBC1
② 1. 类肠上皮细胞
○ (+) 猪
○ (+) KRT20、PPARG、FABP1、ANPEP、CA1、FABP2、VIL1、CDH17、CDC42EP5、HNF4A、TMEM45B、ELF3、TMC4、PPP1R14D、CEACAM1、KLF5、CDX1、CDX2、PRR15L、MUC13、PHGR1、LGALS2、 CD55、SLC26A2、SLC26A3、SLC51B、ABCG2、ACSL5、AQP8、SLC39A5、MAOA、DGAT1(PanglaoDB)
○ 1-1. 未成熟肠上皮细胞
○ 1-2. 成熟肠上皮细胞
○ (+) UGT2B17、LGALS4、FABP2、CHP2、CDX2、PPP1R14D、FABP1、CDH17、TSPAN8、CES2(白板)
○ 1-3. 近端肠上皮细胞
③ 2. 隐窝细胞
○ 2-1. 肠隐窝干细胞
○ (+) TSPAN8、UGT2B17、SLC12A2、URAD、LEFTY1、ADH1C、RGMB、CDX2、LGALS4、CHP2(白板)
○ 2-2. 大肠肠隐窝干细胞
○ (+) RN7SK、RNU6ATAC、MAFA、HSPA2、HIST4H4、CSRNP2、HIST1H2AG、PARD6G-AS1、DLL4、MTMR11(白板)
○ 2-3. 小肠肠隐窝干细胞
○ (+) APOBEC1、CCL25、RBP2、CLDN15、MISP、SLC39A4、PRAP1、ARL14、RHPN2、AC021218.2(白板)
④ 3. 杯状细胞
○ (+) MUC2、ITLN1、TFF3、AGR2、PHGR1、MUC13、FCGBP、ZG16、KLK1、SPINK4(PanglaoDB)
○ 3-1. 大肠杯状细胞
○ (+) MUC2、BEST2、CLCA1、ZG16、TFF3、ST6GALNAC1、REP15、FCGBP、HEPACAM2、WNK4(白板)
○ 3-2. 小肠杯状细胞
○ (+) CLCA1、MUC2、ZG16、SPINK4、FER1L6、TFF3、ITLN1、SCNN1A、REG4、GALNT8(白板)
⑤ 4. 级传输放大单元
○ 4-1. 大肠转运放大细胞
○ 4-2. 小肠转运放大细胞
○ (+) CCL25、RBP2、FABP2、MUC17、SLC5A1、CLDN15、PRAP1、OLFM4、CHP2、VIL1(白板)
○ 4-3. 结肠转运扩增细胞»> ○ (+) NOX1、URAD、LEFTY1、UGT2B17、LGALS4、CDX1、CDX2、NXPE4、TSPAN8、PPP1R14D(白板)
⑥ 5.类肠内分泌细胞
○ (+) NKX2-2、INSM1、MIR7-3HG、FEV、CHGA、RFX6、CRYBA2、RIMBP2、PCSK1N、SCG3(白板)
○ (+) SCGN、SST、GCG、CHGB、CPE、IAPP、CHGA(PanglaoDB)
○ 5-1. D 细胞
○ (+) 海温
○ 5-2. I 细胞
○ (+) CCK
○ 5-3. K 细胞
○ (+) GIP
○ 5-4. 钼电池
○ (+) MLN
○ 5-5. S 细胞
○ (+) SCT
○ 5-6. L 细胞
○ (+) GCG、PYY
○ 5-7. 肠嗜铬细胞
○ (+) TPH1
⑦ 6.类肠簇细胞
○ (+) TRPM5、IL17RB、PLCG2、SH2D6、LY6H
○ (+) GNAT3、SH2D7、GNG13、CCDC129、TRPM5、LRMP、SH2D6、MATK、CCSER1、POU2F3(白板)
⑧ 7类.肠神经胶质细胞
○ (+) Sox2, Plp1
○ (+) GFRA3、MPZ、LGI4、RGS16、ALDH1A1、L1CAM、DKK3、INTS6、DHRS3、S100B(PanglaoDB)
⑨ 8 类. 肠神经元
⑩ 9.类肠嗜铬细胞
⑪ 10 类. 中心凹细胞
⑫ 11类. 胃主细胞
⑬ 12. 类微折叠细胞
⑭ 13 类. 潘氏细胞
⑮ 14类. 壁细胞
⑯ 15 类. 特细胞
⑰ 16 类. TA2 电池
⑱ 17类. Cajal间质细胞
○ (+) 套件、阳极
⑲ 18类.肠干细胞
○ (+)RGMB、SOX9、SMOC2、LGR5
⑽ 组织 9. 肾基质
① 1.类足细胞
○ (+) NPHS1、NPHS2、EZR、TDRD5、SEMA3G、SEMA5A、SEMA3E、PLA2R1、COL4A4、ARHGAP24、WT1、COL4A3、RHPN1、MAFB、PODXL、CLIC5、CD2AP、NOTCH2(sc 型)
○ (+) PODXL、VEGFA、SYNPO、NPHS1、NPHS2、WT1、PTPRO、THSD7A、MAFB、ENPEP、CLIC5、BCAM、MAGI2、EFNB1、PLOD2、SRGAP1、TCF21、PTH1R、CTGF、TRIB2、DACH1、AIF1L、GOLIM4、TOB1(PanglaoDB)
② 2.类癌症干细胞
○ (+) EPCAM
③ 3.类系膜细胞
○ (+) PDGFRB、PDGFB、LAMA4、ITGA8、LGALS1、ARID5B、CCR7、FN1、GATA3、PAWR、SERPINE2、TBX18、TEK、THY1、REN、ZEB2(sc 型)
○ (+) PDGFRB、ANGPT2、CTGF、GATA3、ITGA8、ARID5B、FN1、PTN、MYL9、TPM2、CALD1、HOPX、ACTN1、AKAP12、ROCK1、SH3BGRL、FILIP1L、FLNA、MEF2C、CSTB、MAP3K20(PanglaoDB)
④ 4. 帽间充质细胞(间充质细胞)
○ (+) SIX2、ITGA8、NR2F2、EYA1、MEIS2、CITED1、MUC1、NOTCH2(sc 型)
⑤ 5.类基质细胞
○ (+) MEIS1、TCF21、COL1A2、COL3A1、TNC、COL6A3、LGALS1(sc 型)
⑥ 6. 肾小球旁细胞
○ (+) REN、CRIP1(sc 型)
⑦ 7类. 肾间质(间质细胞)
○ (+) SFRP1、MEIS1、PDGFRA、C7、MGP(sc 型)
⑧ 8.类癌症干细胞
○ (+) EPCAM (sc型)
⑨ 9. 肾祖细胞
○ (+) PAX2、EYA1、WT1、CITED1(PanglaoDB)
⑩ 10.类主细胞
⑪ 11.类近曲小管细胞
⑫ 12 类. 瞬时细胞
⑬ 第 13 类. Norn 细胞:肾脏中产生促红细胞生成素 (Epo) 的细胞
○ (+) Dcn、Lpar1、Col1a1、Cxcl12、Cxcl14、Cfh
⑾ 组织 10. 脑基质
图 3. 由大脑主动细胞普查创建的脑基质分类法
① 1 类. 神经元
○ (+) NEUN(神经核标记物)、CTIP2、SATB2、TBR1、CUX2/1、Synaptophyn(突触蛋白标记物)、RBFOX1、神经丝-L、PSD-95、GAD67、BDNF
○ (+) ENO2、NEFM、SLC12A5、TMEM130、CLSTN3、ARID4A、RHBDD2、TMEM59L、MIAT、AAK1、SPOCK3、DNM3、DNER、CHN1、GABBR2、MEG3、BEX2、BEX1、CAMK2N1、PNISR、STMN2、SNAP25、VSNL1、 ATP6V0A1、MYO5A、DYNC1I1、ELAVL3(PanglaoDB)
○ (+) CAMKV、EPHA3、NEUROD6、SLC24A2、NELL1、GAP43、SOX11、ELAVL4、BEX1、RTN1、SNAP25、SYT1、ELAVL3、STMN2、STMN4(SCEVAN)
○ (-) CD45、CD11b
○ 1-1. 胆碱能神经元
○ (+) SLC18a3、SLC5A7»> ○ (+) CHAT、SLC18A3、ACHE(sc 型)
○ 1-2. 多巴胺能神经元
○ (+) Slc6a3、Ddc
○ (+) TH、SLC6A3、FOXA2、KCNJ6、NR4A2、LMX1B、DBH、SLC6A2、PPP1R1B(sc 型)
○ 1-3. GABA能神经元
○ (+) Slc32a1
○ (+) SLC6A1、GABBR1、GABBR2、GAD2、GAD1、SLC32A1(sc 型)
○ 1-3-1. 抑制性 GABA 神经元
○ (+) Gad1、Gad2、Gabra1、Sst
○ 1-4. 谷氨酸能神经元
○ (+) Slc17a7、Slc17a6 (vGLUT2)、Slc17a8、罗拉、Zic1
○ (+) SLC17A7、SLC17A6、GRIN1、GRIN2B、GLS、GLUL、GRIN2A(sc 型)
○ 1-5. 血清素能神经元
○ (+) Slc6a4、Tph2
○ (+) TPH1、SLC6A4、FEV、HTR1A、HTR1B(sc 型)
○ (+) TPH1、FEV、DDC (PanglaoDB)
○ 1-6. 肾上腺素能神经元
○ 1-7. 甘氨酸能神经元
○ (+) Slc6a5
○ 1-8. 去甲肾上腺素能神经元
○ (+) Slc6a2
○ 1-9. 组胺能神经元
○ (+) Hdc
○ 1-10. 双极神经元
○ 1-11. 未成熟神经元
○ (+) DCX、NEUROD1、TBR1、STMN1、NCAM1、TUBB3(sc 型)
○ 1-12. 成熟神经元
○ (+) RBFOX3、MAP2、SYP、DLG4、TUBB3、MAPT、INA、GAP43、NRP1(sc 型)
○ (+) TUJ1
○ 1-13. 神经祖细胞
○ (+) CSPG4、RNF5、EOMES、SOX2、SOX1、NES、PAX3、PAX6、OTX2、CNTNAP1、ASCL1、SMARCA4、MSI1、MSI2(sc 型)
○ 1-14. 神经干细胞
○ (+) SOX2、PROM1、NES、SOX9(sc 型)
○ 1-15. 中间神经元
○ 1-15-1. 中间神经元祖细胞
○ (+) Dlx1、Dlx2、Lhx6、Nkx2-1
○ 1-16. 周围神经
○ (+) MPZ、S100B、LGI4、PLP1
○ 1-17. 运动神经元
○ 1-18. 去甲肾上腺素能神经元
○ 1-19. 浦肯野神经元
○ (+) Pcp4、Car8、Calb1、Slc1a3、Ppp1r17、Pvalb
○ 1-20. 锥体细胞
○ 1-21. 三叉神经元
○ 1-22. 颗粒神经元
○ (+) Snap25、Cbln3、Gabra6
○ 1-23. MSN(中型棘神经元)
○ (+) Gpr88
○ 1-24. 小脑神经元
○ (+) Cbln1
○ 1-25. 嗅球
○ (+) Eomes,Gng4
○ 区域 1. 肾小球层
○ 区域 2. 二尖瓣层
○ 1-26. 凯尼恩电池
○ 1-27. 大神经元
○ 1-28. 吊灯神经元
○ 状态 1. 抑制神经元
○ (+) Lamp5、Sncg、Vip、Sst、Pvalb、Pnoc、Npy
○ 状态 2. 兴奋性神经元
○ (+) Pcp4、Camk2a、Ppp3ca、Slc1a2
② 2.类神经胶质细胞
○ (-) CD45、CD11b
○ 2-1. 成胶质细胞
○ (+) Aldh1l1、Efna5、Wnt1、Wnt9a、Rspo1/2/3
○ 2-2. 神经母细胞
○ (+) Npas3、Adgrb3、Fgf15、Wnt7b、Tnc
○ (+) NEUROD1、DCX、DLX2、PROX1、EOMES、TUBB3(sc 型)
○ 2-3. 放射状胶质细胞
○ (+) Mki67、Dbx1、PAX6、HES1、HOPX
○ (+) VIM、NES、PAX6、HES1、HES5、GFAP、SLC1A3、FABP7、TNC、CDH2、SOX2(sc 型)
○ (+) SOX15、RP11-54H7.4、FAM83A、LAMC2、BNC1、IRF6、ITGA2、DMRTA2、COL17A1、LAMA3(白板)
○ 2-4. 施万细胞
○ (+) UNC93B6、FOXD3、AC012470.1、DLX1、FOXD3-AS1、RP5-907C10.3、GDNF-AS1、SMIM41、PLP1、KLHDC8A
○ 2-4-1. 髓鞘雪旺细胞
○ (+) SOX10、EGR2、MBP、MPZ(sc 型)
○ 2-4-2. 非髓鞘雪旺细胞
○ (+) SOX10、GAP43、NCAM1、NGFR(sc 型)
○ 2-4-3. 雪旺前体细胞
○ (+) SOX10、GAP43、FABP7、MPZ、DHH、NGFR(sc 型)
○ 2-5. 星形胶质细胞
○ (+) GFAP、Gfap、S100b
○ (+) GFAP、SLC1A3、SLC1A2、GLUL、S100B、ALDH1L1、AQP4、IGFBP3、ATP13A4、CBS、SOX9、CD40、CD80、CD86、C5AR1(sc 型)
○ (+) S100B、SLC1A2、GFAP、SLC1A3、FGFR3、AQP4、AGT、GPR37L1、SLC6A11、SYNE1、PLXNB1、GJA1、APOE(PanglaoDB)
○ 2-6. 少突胶质细胞
○ (+) Mbp、Plp1、Mobp、Car2、Cnp
○ (+) OLIG1、OLIG2、OLIG3、CLDN11、MBP、MOG、MAG、GALC、CNP、SOX10、FA2H、UGT8(sc 型)» ○ (+) MOG、tf、tf6a、PTGDS、Myrf、Sema4d、GJB1、ermn、CLDN11、Anln、PLLP、PEX5L、ST18、MAG、ENP2、PLP1、MBP (PANGLADB)
○ (+) Olig2、NKX2-2、SOX10、AACS、ABCA6、ABCA8、ABCB4、ABHD4、ABLIM2、ABBTB2、AC023908.1、AC1
○ 2-6. 少突胶质细胞前体细胞(OPC,NG2)
○ (+) PTPRZ1、Olig2、pdgfra
○ (+) lhfpl3、MEGF11、PCDH15、Pdgfra、CSPG4、RNF5(SC 型)
○ (+) Pdgfra、GPR37L1、VCAN、EPN2、Olig1、TNR、CNP(Panglaodb)
○ 2-6-2. 髓鞘少突胶质细胞
○ (+) galc、gpr17、Myrf、CNP、hes5、il1rap、NKX2-2、MBP、CLDN11、plp1ugt8、mog、sox10、ermn、mag、movan (scevan)
○ (–) PTPRZ1
○ *2-6. 成熟少突胶质细胞
◗ (+) Olig2、Pdgfra、MBP、MOG
○ *2-6. 未成熟少突胶质细胞
○ (+) ctps、DHCR24、TMEm1
○ 2-7. 坦尼特
◗ (+) 拉克斯
○ (+) GPR50、Col23a1(SC型)
○ 2-8. 伯格曼胶质细胞
◗ (+) gfap
○ 2-9. Cajal-Retziusus 细胞
○ 2-10. 神经节细胞
○ 2-11. 松果体细胞
○ 2-12. 卫星胶质细胞
③3级神经内分泌细胞
○ (+) kcna1、olfr558、mpz、casq2、rgs5、plp1、pln、SOX10、nrip2、rgs4(白板)
④ 4. 脊髓
○ (+) hoxb6, Slc6a5
⑿ 组织 11. 肺基质
① 1 类. Cililit 细胞
○ (+) dynlrb2、foxj1
○ (+) Appl2、ATP5md、CCDC153、CCDC17、CCDC181、CCDC39、Cyp21、FAM161a、Foxj1、LRC23、ODF3B、s12a1l3、sc14l3、Tspan19、Tub4b(SC 型)
○ (+) RP11-680N20.1、Apobec4、RP11-60l3.6、RP11-122m14.1、EPPIN、DNAI1、AC0
○ (+) c20orf85、sntn、ankrd66、c11orf88、TMEm190、FAM216b、Srgap3-as2、STOML3、Pih1D3、C1orf194(至 FAVA SAPIENS)
○ *1-1.** 气道纤毛细胞
② 2 级 气道杯状细胞
○ (+) Agr2、AQP5、ceacam1、DMBT1、dusp4、FXYD3、galnt6、GGH、GLPH、GP2、il19、lipf、ltf、lynx1、msln、muc16、mucr、nos2、mucr、nos2、mucr、mucr、nos2、mucr、nos2、mucr、 nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, mucr, nos2, Mc5, mucr, nos2, mucs, mucg4, mucs, mucs, mucg4, mucs, mucs, muc 42. SCGB3A1、SEC23B、SPDEF、TFF2(SC型)
③3. 毛囊细胞
○ (+) Krt5、Krt1
④ 4. 离子细胞(氯细胞):富含线粒体的细胞
○ (+) GPRC6A、ASCL3、fox1、BSnd、fox2、LCNKB、mprss11E、ATP6V0A4、TMEM61、ATP6V1C2(白板)
⑤ 5 类. 神经元
⑥ 6 类. 肺离子细胞
○ (+) DMRS2
○ (+) cftr、clcnkb、fox1、chnma1、SCGB1A1、SLC12a2、TFCP2L1(SC 型)
○ (+) CLDN25、ATP6v1g3、Lingc0706、ASCL3、LANC01187、DDX4、Stap1、SP9、BSDND(TABULA SAPIENS)
⑦ 7 级 呼吸杯状细胞
○ (+) SCGB1A1、BPFB1、SCGB3A1、CYP2F1、VMO1、Muc5B、CXCL6、MSMB、CCNO、Cyp2J2(图拉智人)
⑧ 8类. 呼吸道粘液细胞
⑨ 9 级 周细胞
⑩ 10 类. 纤维纤维
○ Col3a1、DPT、FN1、GSN、LRP1、PDGFRA、TCF21(SC型)
○ 10-1. 外膜纤维:专门的周细胞
○ 10-2. 肺泡成纤维细胞
○ 10-3. 中度病理性纤维瘤
○ 10-4. 中膜纤维瘤
○ 10-5. 病理性纤维瘤
⑪ 11类. 基底细胞(气道祖细胞)
○ Abi3BP、AQP3、DAPL1、GSTM2、hpgd、iCam1、KRT14、KRT15、PHLDA3、RPS18、SDC1(SC型)
○ *11-1.** 气道基底细胞
⑫12 级. 克拉拉细胞
○ Ahr、aldh1a1、BPIFA1、CTse、Cyp2e1、ERN1、foxm1、lepr、muc1、muc1、muc5b、rab3d、scgb1a1、sftpc、sftp、sftp、sft 、sftp、sft 、sftp、sftp、sftp、sftp、sft 、sftp。 (SC型)
○ ScGB1A1、SCGB3A2、SFTPC、MC1、CYP4B1B1、SCGB3A1、Sftpa1(Paglaodb)
⑬ 第 13 类. 秘密细胞
○ muc5B、Pigr、SCGB1A1(SC型)
⑭ 14 类. 气道粘液细胞
⑮ 15 类. 平滑肌
○ *15-1.** 气道平滑肌
○ *15-2. 血管平滑肌
⑯ 第 16 类. 癌症干细胞» ○ (+) ABCG2、ALCAM、ALDH1A1、BMI1、CD24、CD44、KIT、NANOG、NES、PDPN、POU5F1、PROM1、SOX2、THY1(sc 型)
⑰ 第 17 类. 外膜细胞:特化周细胞
○ (+) TSKU、GFPT2、MFAP4、PCOLCE、SPOCK1、GPR133、PI16、GFRA1、FIBIN、PDGFRL(白板)
⒀组织 12.肾上腺间质
① 1类. CSH1_CSH2阳性细胞
○ (+) CGB、GH2、PSG5、CGA、CSH1、ERVW-1、CSH2、PSG7、PSG11、HSD3B1、PSG9、PSG1、PSG6、PLAC4、PSG4(sc 型)
② 2.类巨核细胞
○ (+) C15orf54、GP9、PF4、PPBP、GP1BA、MEGT1、LY6G6F、GP6、ITGA2B、C6orf25、ALOX12、FCER1A、ELOVL7、NRGN、RP11-930O11.1(sc 型)
③ 3 级 施万细胞
○ (+) WNT16、MPZ、FOXD3、SOX10、CDH19、GPR17、PMP2、COL20A1、INSC、RP4-792G4.2、TTYH1、SOX2、LAMP5、OLFML2A、ATP1A2(sc 型)
④ 4. 交感神经细胞
○ (+) NPAS4、SLC24A2、RP11-542G1.2、PENK、LINC00890、KLK4、RP11-17A4.2、RP5-1096J16.1、C18orf42、TTC40、ARC、FAM19A3、VWA5B1、PPP1R17、 RP4-718N17.2(sc型)
⑤ 5.类基质细胞
○ (+) MIR1245A、NPY5R、RP11-60A8.1、RP11-254F19.2、RP11-494K3.2、RP11-758M4.4、RP11-142A23.1、RP11-752L20.5、OSR1、 RP11-867G23.13、SULT1E1、HHIP、MGP、PRELLP、TWIST2(sc 型)
⑥ 6 类. 嗜铬细胞
○ (+) NRG1-IT3、RNU6-457P、LINC00594、AC018643.4、RP11-159N11.3、CTC-537E7.1、Y_RNA、snoU13、CTD-2006K23.2、RP5-955M13.4、INSRR、KCNK10、 PHEX-AS1、RP11-958J22.1、FLJ30594(sc 型)
⑦ 7 类. 肾上腺皮质细胞
○ (+) RP1-145M24.1、RP11-238I10.1、AC005392.13、RP11-316I3.2、RP11-501O2.4、SDIM1、RP11-258O13.1、AJ006998.2、CTD-2517O10.5、 RNU6-944P、CTB-43E15.4、RP11-34F13.3、RP11-536K7.5、RP11-183M13.1、RNU6-56P(sc型)
⑧ 8类. SLC26A4_PAEP阳性细胞
○ (+) IL1A、SLC26A4、SNX25P1、VMO1、CTD-2210P15.2、CTC-360P9.4、ULK4P1、SNORA14A、RNU6-518P、RP11-431N15.2、RP11-26J3.3、RP11-378A12.1、 SPINK8、HSD3B2、KIRREL-IT1(sc 型)
⒁ 组织 13. 心脏基质
①巨核细胞
○ (+) MEGT1、LY6G6F、TUBB1、PPBP、PF4、GP9、TPSB2、HBD、AC137932.6、ITGA2B、GP1BA、CLEC1B、PTCRA、BEND2、RP11-179A10.1(sc 型)
②心外膜脂肪细胞
○ (+) RP11-89M22.3、CTD-3012A18.1、PRG4、KRT7、SPRR2F、KLK11、MKRN9P、UPK1B、EPGN、NPHS1、ITLN1、LRRN4、CST6、GSDMA、RAET1E(sc 型)
③雪旺细胞
○ (+) GFRA3、SOX10、MPZ、LINC00466、COL20A1、MIA、ASPA、ERBB3、TFAP2A、INSC、ARTN、PMP2、S100B、FOXD3、AP000797.3(sc 型)
④心内膜细胞
○ (+) ANGPTL5、APCDD1L、NPPC、SLC6A4、SALL1、LEPR、C3orf36、AC004562.1、FAM3D、HAPLN1、APCDD1、LYPD2、FOXC1、MPZL2、RP11-849I19.1(sc 型)
⑤ 基质细胞
○ (+) RP11-60A8.1、SCARA5、DPT、CILP、ZCCHC5、AGTR2、MFAP5、RP11-71N10.1、LUM、ABCA10、RP11-31K23.2、CCL11、NRK、PDGFRA、LPAR4(sc 型)
⑥ 平滑肌细胞
○ (+) PDE4C、RP11-112H10.4、RP11-598F7.5、RP11-626H12.1、HCG22、CTD-3064M3.3、RP11-231I13.2、GPR20、RP11-267N12.1、OR51E1、THBS4、 MIR143HG、PDGFRB、AOC3、ENPEP(sc 型)
⑦ SATB2_LRRC7阳性细胞
○ (+) NEUROD2、FEZF2、NEUROD6、TBR1、MPPED1、SATB2、FOXG1、PCDH11Y、CAMKV、BHLHE22、SLIT1、C14orf23、RP11-562L8.1、LINC00966、DRAXIN(sc 型)
⑧内脏神经元
○ (+) GATA3-AS1、GAL、CHRNA3、PRPH、PHOX2A、GALR1、NXPH1、TMC3、DDC、SST、OPRM1、PIRT、NECAB2、ECEL1、SLC10A4(sc 型)
⑨ 心肌细胞
○ (+) Myh6、Myh7、Tnnc1
○ (+) MYH6、TECRL、COL2A1、AC020909.2、NKX2-5、FBN2、TNNT2、MYL4、MYL7、ACTC1(白板)
○ (+) RP11-439H8.4、RNA5SP327、CTD-2552K11.2、Y_RNA、AC018464.3、HHATL、BMP10、RP11-461A8.4、UGT2B4、PRSS42、WI2-1896O14.1、FABP2、EPN3、 RP11-406O23.2,AC009878.2(sc型)
⑩ ELF3_AGBL2阳性细胞
○ (+) C1orf194、ZMYND10、MS4A8、IL20RA、ELF3、SCGB3A2、EFCAB1、SFTPB、WDR65、CP、PIH1D2、AGBL2、SFTPC、DNAH9、MUC1(sc 型)
⑪ CLC_IL5RA阳性细胞» ○ (+) FAM209A、CERKL、CLC、PRG2、MS4A3、IL5RA、ZC2HC1C、CTD-2620I22.1、CTD-3032H12.2、RP11-252E2.1、AC011524.1、S100A1、Y_RNA、LINC00407、 RP11-516C1.1(sc型)
⑫ 心脏干细胞和前体细胞
⑬ 他的束细胞
⑭ 浦肯野纤维细胞
⑮ 卡哈尔细胞
⒂ 组织 14. 肠基质
①嗜铬细胞
○ (+) ARX、NKX2-2、CCK、CRYBA2、NEUROD1、FEV、MLN、ASIC5、ONECUT3、SST、RP11-788H18.1、PAX4、KCNH6、SSTR5、PCSK1(sc 型)
②平滑肌细胞
○ (+) ACTG2、GREM2、CNN1、RP11-467I20.6、WIF1、TACR2、OVCH2、FRMD6-AS2、DES、MYH11、RP11-626H12.1、ANO1、CHRDL2、TAGLN、FBXL22(sc 型)
③ ENS 胶质细胞
○ (+) SERPINA3、RLBP1、GPR12、RP4-792G4.2、CDH19、COL20A1、SOX10、PLP1、SOX2、FOXD3、MPZ、BCAN、TFAP2A、SOX2-OT、PTPRZ1(sc 型)
④ ENS 神经元
○ (+) PDIA2、RP11-672L10.2、GRP、DRGX、GCGR、SLC18A3、PHOX2A、HECW1-IT1、RP11-202H2.1、IQCJ、STMN4、TTC9B、GAL、CEND1、NEFL(sc 型)
⑤ 基质细胞
○ (+) RP11-13P5.2、MSC、RP1-283K11.3、RP5-1077H22.1、CTD-2541J13.1、AC002511.2、AC002511.3、MMP27、CTD-2334D19.1、CXCL14、FZD10、PDGFRA、 AC003090.1、RP1-288H2.4、ITGA11(sc型)
⒃ 组织 15. 胎盘基质
① PAEP_MECOM 阳性细胞
○ (+) RP11-98L5.2、AC104654.1、PAEP、RP11-274B18.4、PIGR、TSPAN1、AC012593.1、RP11-510D19.1、POU5F1、UGT2B7、DEFB1、RP11-697E22.2、SLC18A2、 PAX8、SLPI(sc 型)
② AFP_ALB 阳性细胞
○ (+) SLC2A2、ALB、APOB、AFP、ITIH2、F2、MAT1A、APOC3、SERPINC1、FABP1、APOA2、AHSG、SERPINA10、SLC38A3、SERPINA4(sc 型)
③绒毛外滋养层
○ (+) AC022596.6、GKN1、CILP2、LINC00330、PDE6H、PRG2、RP11-872D17.8、HLA-G、ASCL2、NOTUM、AC006262.5、DAW1、NOG、TAC3、RP11-420L9.4(sc 型)
④滋养层巨细胞
○ (+) CCK、CTA-833B7.2、PSG1、CGB、CSH2、PSG6、KISS1、INHBA、GH2、PSG9、CRH、PSG8、RP11-76E12.1、PSG4、TREML3P(sc 型)
⑤ 平滑肌细胞
○ (+) RP11-162G9.1、FAM162B、WNT3A、AFF2、CDH19、SCN11A、GPR20、COX4I2、AGTR1、ADAMTS20、RP11-123O22.1、HIGD1B、AC020571.3、COLEC10、KCNK17(sc型)
⑥ IGFBP1_DKK1阳性细胞
○ (+) RP3-404K8.2、RP11-486P11.1、FOXL2、WT1、RP11-171A24.3、SCARA5、LRRN4CL、S100A3、WT1-AS、PRL、WNT4、AC012065.7、APOD、BRINP2、RORB(sc型)
⑦ 基质细胞
○ (+) AP006285.6、AC002451.1、RP11-99L13.2、RP1-79C4.4、MMP23B、RP11-248N22.2、LA16c-380H5.4、MIR218-1、C8orf87、SNORD113、 RP11-74M11.2、HSD3BP2、AP001605.4、LINC00314、AC007394.3(sc 型)
⑧ 合体滋养细胞和绒毛细胞滋养细胞
○ (+) CTD-2050E21.1、POTEKP、RP11-344B2.3、RP11-366M4.3、RP11-2A4.4、RP11-483F11.7、FTLP14、RP11-718G2.5、RP11-18D7.3、CLCA2、 KB-1440D3.13、CTBP2P8、RP11-359P18.1、HSPD1P6、AC124861.1(sc型)
⑨ 巨核细胞
○ (+) EGF、TUBB1、PPBP、ITGA2B、RP11-930O11.1、RP11-152K4.2、LINC00989、PF4、C6orf25、LINC00534、PKHD1L1、NRGN、DNM3、RP11-466L17.1、 RP11-142C4.6(sc型)
⒄ 组织 16. 脾基质
① AFP_ALB 阳性细胞
○ (+) SERPINA6、PLG、AMBP、SERPINC1、BHMT2、LBP、PRAP1、APOB、SERPINA1、FGB、VTN、SLC2A2、FGG、MT1G、ITIH1(sc 型)
② 基质细胞
○ (+) CTD-2270F17.1、ENPP7P4、AC105053.3、RP11-388K12.1、SCTR、KBTBD11-OT1、ADRA1B、NPM1P10、NPY5R、TPH2、CTC-535M15.2、MIR143HG、KLHL29、 AC023481.1,CADPS(sc型)
③ STC2_TLX1阳性细胞
○ (+) CAMK2N2、CLVS2、RP11-384O8.1、FBXL16、GABRG2、HRK、EBF3、TRH、AC018730.1、CTD-3193O13.9、CPLX2、ATP1A3、TMEM119、IFI27L2、PET117(sc型)
④巨核细胞
○ (+) RAB27B、RP11-556I14.2、EGF、GP6、RP11-930O11.1、LINC00989、SELP、GP1BA、HPSE、RP11-152K4.2、LINC00504、MMRN1、ITGB3、ELOVL7、LY6G6F(sc型)
⒅ 组织 17. 胃基质
①神经内分泌细胞
○ (+) SLC18A1、GHRL、GAST、FEV、NKX2-2、CRYBA2、MBOAT4、CDK5R2、RFX6、HAP1、RP11-82C23.2、RBPJL、PTF1A、PAX6、CACNA1A(sc 型)
② 顶细胞和主细胞» ○ (+) RP11-467I20.6、ETNPPL、ATP4B、FGB、FGA、SIGLEC11、FRMD1、TRIM50、ALB、ATP4A、ANGPTL3、MFSD4、APOBEC2、CKM、PAQR5(sc 型)
③ MUC13_DMBT1阳性细胞
○ (+) ISX、GUCA2B、ENPP7、MIR194-2、BTNL3、TM4SF20、SI、SLC17A4、ALDOB、CDX1、DMBT1、CHP2、KRT20、SLC5A12、ADRA2A(sc 型)
④ 杯状细胞
○ (+) UGT2B15、IL17C、GKN2、SLC22A8、CXCL5、CSF3、TFF2、A4GNT、FBP2、FGF20、MUC6、GKN1、CXCL1、MUC5AC、CA9(sc 型)
⑤ 基质细胞
○ (+) AC002511.2、PTGER1、OSR2、AC003090.1、ACTG2、INHBA、HSPB6、AC131025.8、SHISA3、DPT、TRPA1、ACTA2、TWIST2、CXCL14、GLIS1(sc 型)
⑥ ENS 神经元
○ (+) PRPH、STMN2、ATP1A3、KCNIP4、NKAIN1、INA、GAP43、ATCAY、CNGB1、TCEAL5、STAC、DCX、RP11-457K10.1、FAM163A、CNTN5(sc 型)
⑦ ENS 神经胶质细胞
○ (+) SOX10、MPZ、ATP1A2、BAI1、PLP1、CDH19、COL20A1、ELOVL2、NOV、PRIMA1、RP11-308N19.1、SLC35F1、LGI4、VGLL3、EGFLAM(sc型)
⑧ PDE1C_ACSM3 阳性细胞
○ (+) RP11-690G19.4、ACSM3、C1orf95、KCNE4、PDE1C、PSEN2、ERBB4、ATP6V0A4、TFCP2L1、WNK3、GABRB2、ADARB2、AMACR、SHISA2、NOX4(sc型)
⒆ 组织 18. 胸腺基质(甲状腺基质)
① 基质细胞
○ (+) PLAC9、LOX、MGP、COL1A2、COL5A3、COL1A1、ASPN、FGF18、MMP2、ISLR、DCN、SFRP2、COL3A1、SCARA5、COL6A6(sc 型)
②胸腺细胞
○ (+) RP11-104L21.3、BEST3、HKDC1、KLRC4-KLRK1、RP11-305P22.9、LTA、TMSB15B、RP11-739G5.1、UBASH3A、PLK4、FBXO41、LIN28B、SKA3、CD40LG、AC002454.1 (sc型)
○ (+) C1orf228、VIPR2、SLAMF1、CCR9、CHRM3-AS2、SMC4、LEF1、ARRDC2、BACH2、SCML1(白板)
③滤泡细胞
⒇ 组织 19. 膀胱基质
①成纤维细胞
②肌成纤维细胞
③周细胞
④平滑肌细胞
⒇ 组织 20. 生殖系统(例如前列腺)
① 蜕膜细胞
○ (+) XCL1、IGFBP1、XCL2、CTSW、IL32、TRDC、KLRC1、PRL、AREG(PanglaoDB)
② 生殖细胞
○ (+) DDX4、PRM1、ODF2、CRISP2、TCP11、PHF7、SPINK2、TSACC、PGK2、GTSF1、LELP1、MAEL、CCDC91、COX8C、FAM71E1、SPATA33、HMGB4、ROPN1L、TNP1、SMCP、LDHC、PRM2、DKKL1、MLF1、 NR6A1、RSBN1L、DYNLT1、MRPL14、CREM(PanglaoDB)
③颗粒细胞
○ (+) AMH、INHA、TNNI3 (PanglaoDB)
④ 间质细胞
○ (+) INHA、DHCR7、CALB2、CYP17A1、CYP11A1、INSL3、LHCGR、STAR、PTGDS、HSD17B3、SMOC2、GJA1(PanglaoDB)
⑤ 黄体细胞
⑥ 肾小管周围肌样细胞
○ (+) SAT2、GSTM3、RNA酶1、OSR2、MYL9(PanglaoDB)
⑦ 支持细胞
⑧ 精母细胞
○ (+) PRM1、PRM2、TNP1(PanglaoDB)
⑨ 精子
6。类型 5. 其他
⑴胚胎
① 1. 类外胚层细胞
② 2. 成血管细胞
③ 3.类滋养层
○ 3-1. 滋养层细胞
○ 3-2. 滋养层祖细胞
○ 3-3. 滋养层干细胞
○ 3-4. 合体滋养层 (STB)
○ 3-5. 细胞滋养层 (CTB)
○ 3-6. 非增殖性间质细胞滋养层 (npiCTB)
○ 3-7. 绒毛外滋养层 (EVT)
○ 3-8. 滋养层巨细胞 (TGC)
④ 4.类胚胎干细胞(受精卵)
(+) NANOG, POU5F1
⑤ 5. 体节
⑵母胎边界
① 1. 间质
○ 1-1. 基质
○ 1-2. 成纤维细胞
○ 1-3. 子宫内膜
○ 1-4. 蜕膜
② 2. 内皮细胞
○ 2-1. LED(淋巴内皮蜕膜)
○ 2-2. HSC(造血干细胞)
③ 3. 骨髓细胞
○ 3-1. 单核细胞
○ 3-2. 巨噬细胞
④ 4. 淋巴样
○ 4-1. T 细胞激活
○ 4-2. T 细胞静息
○ 4-3. NK 细胞
○ 4-4. B 细胞
⑶ 沿头尾轴的神经模式
① 中脑
○ (+) OTX2
②后脑(中)
○ (+) HOXB1
③后脑(尾侧)
○ (+) HOXB4
④脊髓
○ (+) HOXC9
⑷ 状态1. EMT(上皮间质转化):转移的主要机制> ① (+) GATA3、TWIST2、SNAI2、VIM、SLUG、ZEB1、S100A4
② (-) DEFB4A、LCN2
⑸ 状态 2. MET(间充质到上皮细胞的转变)
⑹ 状态 3. EndMT(内皮-间质转化)
⑺ 状态 4. MMT(间皮-间质转化)
⑻ 状态 5. MMT(单核细胞向肌成纤维细胞转分化)
输入 : 2020.02.06 00:43
修改时间 : 2023.08.27 00:49