<正文>
<tr样式=“高度:22px;”>
| 类别 |
说明 |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, J.、Kim, S.、Kim, J.、Lee, D.、Bae, S.、Shin, H.、Lee, D. 和 Choi, H. (2025)。 CELLama:利用语言模型能力的细胞嵌入实现单细胞和空间转录组学的基础模型。 先进科学。第一作者。 [链接] [GitHub] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, J. Y. 等人。 (2025)。用于靶向肿瘤微环境的精确糖基化可点击白蛋白纳米平台的工程和评估。 治疗诊断学。共同第一作者。 [链接] |
</tr><tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Lee, S. 等人。 (2025)。使用负载氧化铁纳米颗粒的脂质纳米颗粒进行基于磁共振成像的内体逃逸定量。 先进的医疗保健材料。共同第一作者。 [链接] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Kim, S., Kim, Y.K., Kim, S., Choi, Y. S., Lee, I., Joo, H., ... & Kim, I. S. (2025) 双模式动作可扩展、高质量的工程干细胞衍生的 SIRPα 细胞外囊泡,用于治疗急性肝衰竭。 自然通讯。 [链接] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, J.、Cook, S.、Lee, D.、Choi, J.、Yoo, S.、Im, H. J., ... 和 Choi, H. (2024)。使用深度图像先验从基于条形码的空间转录组生成超分辨率图像。 细胞报告方法,5(1)。第一作者。 [链接] <a href = “https://github.com/portrai-io/SuperST">[GitHub]</a> |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Lee, D.、Park, J.、Cook, S.、Yoo, S. J.、Lee, D. 和 Choi, H. (2024) IAMSAM:使用分段任意模型进行基于图像的分子特征分析。 基因组生物学。共同第一作者。 [链接] [应用] [GitHub] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, S.、Park, J.、Kim, J.、Choi, H.、Kim, I.、Chung, E-J. 和 Kwon, J. (2024)。分析癌症空间转录组中未映射的 RNA-seq 数据以破译癌症微生物组。 bioRxiv。第二作者。 [链接] [GitHub] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Ohn, J.、Seo, M. K.、Park, J.、Lee, D. 和 Choi,H.(2024)。 SpatialSPM:统计参数映射,用于比较多个空间转录组数据集中的基因表达模式图像。 核酸研究。第三作者。 [链接] [GitHub] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Choi, T. H.、Yoo, R. J.、Park, J. Y.、Kim, J. Y.、Ann, Y. C.、Park, J., ...和 Lee, Y. S. (2024) 开发用于巨噬细胞耗竭的微调脂质体纳米平台。 纳米生物技术杂志。第六作者。 [链接] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, J.、Lee, D.、Lee, J. E.、Lee, D.、Song, I. H.、Park, H. S....和 Im, H. J. (2024) 基于空间转录组学的无标记方法,用于评估肺纤维化小鼠模型中的人类干细胞分布和影响。 先进疗法。第一作者。 [链接] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Oh, C.、Lee, W.、Park, J.、Choi, J.、Lee, S.、Li, S....和 Im, H. J. (2023)。开发针对脾脏的 H2S 供体负载脂质体,用于有效的全身免疫调节和治疗炎症性肠病。 ACS 纳米,17(5),4327-4345。第三作者。 [链接] |
</tr>
<tr样式=“高度:22px;”>
期刊 |
Park, J.、Choi, J.Y.、Choi, H. 和 Im, H. J. (2022)。基于空间转录组学的癌症组织中纳米药物分布分子标记的鉴定。 小方法,6(11),2201091。共同第一作者。 [链接] |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
期刊 |
Park, H. R., Im, H. J., Park, J., Yoon, B. W., Lim, Y. H., Song, E. J., ...以及 Paek, S. H. (2022)。双侧丘脑底核深部脑刺激对帕金森病患者的长期结果:10 年及以后。 神经外科,10-1227。 2022 年;第三作者。 [链接] |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>期刊 |
Lee, H.、Park, J.、Im, H.J.、Na, K. J. 和 Choi, H. (2021)。发现 COVID-19 患者严重炎症的潜在影像学和治疗靶点。 科学报告, 11(1), 1-9;第二作者。 [链接] |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Im, H.-J.、Park, J. 和 Lee, S. 大韩民国专利商标局。申请号:10-2022-0181667。申请日期:2022年12月22日。注册号:10-2743800。报名日期:2024年12月12日。脂质纳米颗粒内体逃逸效率分析方法;第二发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Lee, D.、Park, J.、Kook, S.、Jeong, Y.、Im, M.、Lee, J. 和 Lee。 D. 大韩民国专利商标局。申请号:10-2024-0012396。申请日期:2024年1月26日。注册号:10-2728909。报名日期:2024年11月7日。一种用于从空间转录组中分离或分析核心的装置或方法以及存储在计算机可读存储介质中用于执行该装置或方法的程序。第二发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Choi, H.、Im, H.-J.、Park, J. 和 Lee, D。韩国专利商标局。申请号:10-2023-0060674。申请日期:2023年5月10日。超分辨率空间转录组图像生成方法、执行该方法的设备以及记录在计算机可读介质中用于执行该方法的程序。第三位发明家。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Park, J.、Lee, J.、Lee, D. 和 Lee, D。韩国专利商标局。申请号:10-2023-0048433(初步)、10-2023-0104148。申请日期:2023年4月12日(初稿),2023年8月9日,注册号:10-2718648,注册日期:2024年10月14日。利用空间转录组学探索干细胞治疗肺纤维化的微观分布和治疗效果;第一发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 | Im, H.-J.、Choi, H.、Li, S. 和 Park, J. 大韩民国专利商标局。申请号:PCT/KR2023/004192。申请日期:2023年3月29日。一种通过单细胞转录组分析推荐癌症微环境中细胞簇靶标候选的方法、装置及其程序;第四发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Im, H.-J.、Park, J. 和 Lee, S. 大韩民国专利商标局。申请号:PCT/KR2022/021076。申请日期:2022年12月22日。脂质纳米颗粒内体逃逸效率分析方法;第二发明人。 [链接] |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Im, H.-J.、Park, J.、Choi, J. 和 Choi, H。韩国专利商标局。申请号:10-2022-0057185。申请日期:2022年5月10日。注册号:10-2489146。注册日期:2023年1月11日。使用空间分辨转录组学技术寻找与荧光标记药物的组织分布相关的分子谱的装置、系统或计算机程序;第二发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Im, H.-J.、Choi, H.、Li, S. 和 Park, J. 大韩民国专利商标局。申请号:10-2022-0038613。申请日期:2022年3月29日。一种通过单细胞转录组分析推荐癌症微环境中细胞簇靶标候选的方法、装置及其程序;第四位发明家。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
专利 |
Im, H.-J.、Park, J.、Choi, J. 和 Choi, H。韩国专利商标局。申请号:10-2022-0042378。申请日期:2021年6月25日。注册号:10-2489145。注册日期:2023年1月11日。一种利用空间分辨转录组学技术寻找与荧光标记药物组织分布相关的分子谱的方法;第二发明人。 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
书籍 | Kim, S.K., Park, J.B. (2023) 统计中的第一到第十步。 FESTBOOK 媒体。 ISBN:979-11-92302-33-1(第一版)、979-11-92302-44-7(第二版)、979-11-92190-14-3(第三版);第二作者。 [链接] [韩国] [Eng] |
</tr>
| 书籍 |
Park, J.B. (2022) 整个生命科学 - 微观理解。 FESTBOOK 媒体。 ISBN:979-11-92302-81-2(POD)、979-11-69291-13-2(电子书);第一作者。 [链接] [韩语] [英语] |
<tr风格=“高度:17px;”>
书籍 |
帕克,J.B.,李,E.J. (2022)你想知道的有机化学。 FESTBOOK 媒体。国际书号:979-11-92302-09-6 15430;第一作者。 [链接] [韩语] [英语] |
</tr>
</tbody>
</表>
E.演示文稿
<正文>
| 持续时间 |
说明 |
| 2025.10.20 |
Park, J.、Zhang, T.、Cong, M.(2025 年,9 月 19 日)。组成:使用空间知情主题推断的可扩展概率优化进行细胞类型和空间组织建模。 OGPS/PIBS 海报之夜 |
| 2025.09.19 |
Zhang, T.、Park, J.、Cong, M.(2025 年,9 月 19 日)。组成:使用空间知情主题推断的可扩展概率优化进行细胞类型和空间组织建模。 DCMB/CCMB 年度静修 |
| 2024.03.22 | Choi, J. Y.、Park, J.、Lim, M.、Lee, D.、Lee, J. E.、Choi, H. 和 Im, H.-J. (2024 年 3 月 22 日)。摘要 3481:针对同一分子的单克隆抗体的比较空间转录组分析:西妥昔单抗和帕尼单抗之间的比较。在癌症研究协会年会上展示的海报会议,发表于 Cancer Res, 84(6_Supplement), 3481。[链接] |
| 2024.03.22 |
Lee, D.、Park, J.、Cook, S.、Yoo, S.、Lee, D. 和 Choi, H.(2024 年,3 月 22 日)。摘要 7431:IAMSAM:使用 Segment-anything 模型对分子特征进行基于图像的分析 - 肿瘤微环境的综合分析工具。在癌症研究协会年会上展示的海报会议,发表于 Cancer Res, 84(6_Supplement), 7431。[链接] |
| 2024.03.22 |
Park, J.、Cook, S.、Lee, D.、Choi, J.、Yoo, S.、Im, H.-J.、Lee, D. 和 Choi, H.(2024 年,3 月 22 日)。摘要 2329:通过空间转录组数据的超分辨率重建算法,使用空间基因表达模式定义癌症区域。在癌症研究协会年会上展示的海报会议,发表于 Cancer Res, 84(6_Supplement), 2329。[链接] |
| 2024.03.22 |
Park, J.、Park, S. H.、Lee, D.、Lee, J. E.、Lee, D.、Na, K. J.、Choi, H. 和 Im, H.-J. (2024 年 3 月 22 日)。摘要 4881:使用空间转录组学上未映射的 RNA 读数检测癌症微生物群。在癌症研究协会年会上展示的海报会议,发表于 Cancer Res, 84(6_Supplement), 4881。[链接] |
| 2023.01.10 |
放射医学网络杂志采访 2023 年 1 月:基于空间转录组学的肿瘤组织中纳米药物分布分子标记的识别 |
| 2022.11.24 |
基于空间转录组学的肿瘤组织中纳米药物分布分子标记的识别;韩国生物研究信息中心 |
| 2022.09.30 | 韩国 iBRIC访谈:基于空间转录组学的肿瘤组织中纳米药物分布分子标记的鉴定 |
| 2022.03.18 |
胰腺癌基质靶点的发现; 2022 AACR 海报 |
| 2022.01.10 |
韩国放射医学科学研究所海报 |
| 2021.11.25 |
2021 年纳米融合展演示 |
| 2021.11.17 |
自然会议“仿生纳米材料”简短对话 |
| 2021.11.15 ~ 17 |
自然大会“仿生纳米材料”前 20 支团队 演示文稿 |
| 2021.07.07 ~ 09 |
纳米韩国2021纳米技术融合展海报会议 |
| 2016.06.09 |
顶点:轮椅足球的创新 |
</tbody>
</表>
F.项目经验
<正文>
<tr样式=“高度:22px;”>
| 持续时间 | 描述 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2022.03 ~ 现在 |
项目工艺:抓取公共 scRNA-seq 和 ST 数据以匹配类似数据集 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2025.03 ~ 2025.11 |
单细胞分辨率空间转录组数据的可扩展建模 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2022.08 ~ 2025.10 |
Albani 项目:基于不同糖化类型的白蛋白纳米平台研究肝脏和肿瘤中的积累模式 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2021.12 ~ 2024.12 |
SuperST项目:利用深度图像先验的超分辨率算法开发与应用 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2022.03 ~ 2024.06 |
SpatialSPM:用于比较多个空间转录组数据集中基因表达模式图像的统计参数映射 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.10 ~ 2024.02 |
肿瘤浸润淋巴细胞的定量 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.08 ~ 2024.02 |
建立标准化基于图像的空间转录组学的方法 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.08 ~ 2024.02 |
PortraiTME 项目:通过数字病理学评估肿瘤微环境 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.04 ~ 2024.02 | 多组学研究封装 H2S 供体脂质体治疗小鼠炎症性肠病的全身免疫评价 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.05 ~ 2023.11 |
自动化生物信息学下游分析和报告生成 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2022.09 ~ 2023.11 |
基于空间转录组学的无标记方法评估肺纤维化小鼠模型中的人类干细胞分布和影响 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2020.05 ~ 2025.07 |
基于 MR 成像的脂质纳米颗粒内体逃逸评估 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2023.04 ~ 2023.05 |
IAMSAM:基于图像的分子特征分析和分段模型 |
</tr>
| 2023.02 ~ 2023.03 |
用于巨噬细胞耗竭的微调脂质体纳米平台以及组织上纳米平台的计算评估 |
| 2022.12 ~ 2023.02 |
MERFISH 和 Visium 小鼠大脑样本下游分析的比较 |
| 2022.12 ~ 2023.02 |
通过 Hi-C 和 ChIP-seq 鉴定肺癌特异性 TAD 和基因 |
| 2022.07 ~ 2023.01 |
利用前列腺癌的批量 RNA-seq、scRNA-seq、ST、Chip-seq、Hi-C seq 和转录因子数据库鉴定 CRISPR-Cas9 的靶位点治疗 |
| 2022.08 ~ 2022.12 |
使用 AlphaFold2 和 PepNN 进行肽蛋白模拟 |
| 2022.11 ~ 2022.12 |
多种疾病模型中的基因靶标探索 |
| 2022.09 ~ 2022.12 |
使用 VistoSeg 标记训练 CNN,用于 Visium 数据集中的细胞计数 |
| 2022.08 ~ 2022.12 |
开发脾脏靶向 H2S 供体负载脂质体,用于有效的全身免疫调节和治疗炎症性肠病 |
<tr风格=“高度:17px;”>
2021.08 ~ 2022.11 |
基于空间转录组学的紫杉醇纳米凝胶对肿瘤组织的疗效分析 |
</tr>
<tr风格=“高度:35px;”>
2020.01 ~ 2022.10 |
基于空间转录组学的肿瘤组织纳米药物分布分子标记识别 (PortraiDRUG) |
</tr>
<tr风格=“高度:60px;”>
2021.07 ~ 2022.07 |
基于空间转录组学的抗体药物偶联物相关分子标记鉴定 |
</tr>
<tr风格=“高度:60px;”>
2022.05 ~ 2022.07
|
利用空间转录组学来识别炎症性肠病微生物组的空间分布 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2022.04 ~ 2022.05 |
利用胶原酶活性的Lipobot |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2021.07 ~ 2022.04 |
磁高温氧化铁与替莫唑胺联合治疗胶质母细胞瘤 |
</tr>
<tr风格=“高度:35px;”>
2021.11 ~ 2022.02 | 开发联合药物发现的药物匹配管线:以CLDN3(暂定)抗体为主 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2020.12 ~ 2021.05 |
抑制 GLUT1 的癌症免疫疗法 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2020.07 ~ 2021.02 |
发现 COVID-19 患者严重炎症的潜在影像学和治疗靶点 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2021.01 ~ 2021.01 |
棕色脂肪组织 (BAT) FDG-PET 成像数据分析 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2020.03 ~ 2021.01 |
毕业论文:韩国水稻种子品种分类算法的开发 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2020.07 ~ 2020.07 |
多巴胺转运蛋白成像用于评估帕金森病 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
2020.04 ~ 2020.06 |
微处理器应用课程:物联网空气净化器与Web&App应用联动 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2018.07 ~ 2018.07 |
Hackathone:用于检测 CBR 情况的 DetecTrone |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2017.07 ~ 2017.07 |
发明大赛:局部使用磁共振成像仪 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2016.06 ~ 2016.06 | 顶点:轮椅足球的创新 |
</tr>
<tr风格=“高度:30px;”>
2016.03 ~ 2016.05 |
Google Science Fair:库恩人工智能理论的实现 |
</tr>
</tbody>
</表>
G.奖学金信息
<正文>
| 句点 |
名称 |
来源 |
| 2024.09 ~ |
每年 13,000 美元,自 2024 年 9 月起最多 5 年 |
韩国高级研究基金会 (KFAS) 资助 |
| 2023.09 ~ 废弃 |
政府基金(最长 2 年) |
外交部国立国际教育研究所(NIIED) |
| 2021.03 ~ 08 |
BK21四项奖学金 |
首尔国立大学基金会 |
| 2020.09 ~ 02 |
发展基金奖学金 |
首尔国立大学基金会 |
| 2020.03 ~ 08 |
发展基金奖学金 |
首尔国立大学基金会 |
| 2017.03 ~ 08 |
国家奖学金 |
韩国学生援助基金会;科萨夫 |
| 2016.09 ~ 02 |
国家奖学金 |
韩国学生援助基金会;科萨夫 |
| 2016.03 ~ 08 |
GPA奖学金 |
首尔国立大学 |
| 2015.09 ~ 02 |
国家奖学金 |
韩国学生援助基金会;科萨夫 |
| 2015.03 ~ 08 |
国家奖学金 |
韩国学生援助基金会;科萨夫 |
</tbody>
</表>
H.技能和技术
<正文>
<tr风格=“高度:30px;”>
| 类别 | 说明 |
</tr>
<tr风格=“高度:300px;”>
实验技术 |
pH 计、氧化铁溶剂热合成、脂质体制备、脂质纳米颗粒 (LNP) 制备、放射性同位素标记、动态光散射 (DLS)、Zeta 电位、微孔板读数仪、紫外-可见光谱仪、Nanodrop、傅里叶变换红外光谱仪 (FT-IR)、透射电子显微镜采样 (TEM)、冷冻-TEM、体外 MR 成像、细胞培养、细胞冷冻和解冻、流式细胞术、共焦成像、Tomocube、MTT 测定、乳酸测定、生物 TEM 采样、GFP 转染活细胞成像、组织荧光显微镜、肿瘤建模、体内成像系统 (IVIS)、离体成像、牺牲、最佳切割温度 (OCT) 肿瘤成型、组织冷冻切片机、体内 MR 成像、PET 成像 |
</tr>
<tr风格=“高度:60px;”>
适用的编程语言 |
C/C++, Java, RStudio, Python, HTML、Javascript、处理中,Verilog, Arduino, Linux |
</tr>
<tr风格=“高度:60px;”>
其他 | 使用 SolidWorks 或 Inventor 的计算机辅助设计 (CAD),3D 打印, 电路设计,物联网实现,网站管理 |
</tr>
</tbody>
</表>
我。课程作业
<正文>
<tr风格=“高度:17px;”>
| 类别 |
说明 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
Master Process研究生院课程 |
临床蛋白质组学(ENG), 分子成像和纳米医学(ENG), 治疗诊断学和精准医学, 药物开发原理与实践, 数据科学原理与应用, 放射医学研讨会,研究生院论文研究 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
普通本科学校课程 | 微积分 1, 物理,了解流行艺术,科学的哲学理解,朝鲜研究,心理学概论,生物学、英语基础(ENG)、大学写作:过程与结构、大学英语 1(ENG)、微积分 2, 生物实验室。,表演艺术简介,量子理论与人类文明,新生研讨会,重量训练,电气和计算机工程简介,创新顶点设计 2,初级西班牙语 1,计算机工程研讨会,逻辑设计(ENG), 人脑的结构和功能, 物理实验室。,化学,自行车和运动科学,计算机编程(ENG) |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>本科专业课程 |
生物系统与生物材料科学与工程简介,计算机编程简介, 生物应用材料工程, 生物系统工程生物学, 生物产品中的传热和传质(ENG), 应用数学 1, 动态, 流体力学与机械(ENG), 生物热力学, 应用工程数学2, 有机化学(ENG), 统计和实验室简介。, 电气电子工程与实验室应用。, 收获后工艺工程和实验室。, 生物力学和实验室。, 生物产品和实验室的工程特性(ENG),生物系统实验,生物系统控制和实验室。, 微处理器应用、生物系统工程实践、生物系统工程研讨会 |
</tr>
<tr风格=“高度:17px;”>
辅修本科生课程 |
经济学家入门统计, 计量经济学(ENG), 微观经济学(ENG), 经济学数学, 经济史,经济学原理 1, 宏观经济学 |
</tr>
</tbody>
</表>
J.参考
联系方式:jeongbp@umich.edu
正文>
正文>
正文>
正文>
正文>
正文>
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