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生物信息学分析目录

推荐文章： 【生物学】【生物信息学】(https://jb243.github.io/pages/1831)、【算法索引】【算法】(https://jb243.github.io/pages/1278)

最近更新

• 生物库 (23.12.11)

• 分子库 (23.12.11)

• HTML 应用程序库 (23.12.08)

这是根据我在生物信息学领域工作五年的工作经历写的文章。

Ⅰ。背景理论

生物信息学

测序技术

Kaplan-Meier 生存曲线

二。先决条件

线性代数

统计

算法

计算机科学导论

C 目录

C++ 目录

Java 目录

Python 目录

RStudio 目录

Linux服务器

Windows 服务器

NAS

MinIO

docker

Ⅲ。数据采集和处理

了解FASTQ、FASTA、GTF、GFF文件

RNA测序质量控制（QC）

HDF 文件和filtered_feature_bc_matrix.h5

【获取TCGA数据】(https://jb243.github.io/pages/1694)

网页抓取示例

四。数据分析

【生物信息学RStudio实用函数大全】(https://jb243.github.io/pages/2156)

【生物信息学Python实用函数合集】(https://jb243.github.io/pages/1892)

有机化学Python函数合集

转录组学流程

在Bulk RNA-seq中获取DEG（DESeq2、t-test、ANOVA）

细胞类型分类管道

使用Seurat确定细胞类型

通过分散确定细胞类型

使用scanpy确定细胞类型

【Seurat与scanpy的比较】(https://jb243.github.io/pages/363)

配体-受体相互作用分析

理解并运行MIA

理解和运行RCTD

了解并运行XFuse

生物信息学和语言模型

Ⅴ。数据可视化

Python 应用程序库

HTML 应用程序库

Ⅵ。附录

分子库

基因库基因评分库

细胞类型标记基因

生物库

疾病库

生物信息学笔记

输入： 2022.07.20 19:28

修改： 2023.06.16 11:42