CellPhoneDB 教程
推荐帖子： 【生物信息学】【配体-受体相互作用分析】(https://jb243.github.io/pages/841)
1. 安装
2. 参考文献
1.安装
⑴【准备Linux环境】(https://jb243.github.io/pages/2147)或【anaconda3安装](https://jb243.github.io/pages/2069#:~:text=Valid%20version%20of%20Python%20必需,-2.%20Anaconda%20安装,-%E2%91%B4%20Web%20Site%20安装)
⑵ 输入文件
① cellphonedb_meta.txt
② cellphonedb_count.txt
⑶ 示例代码
① 如果缺少“–counts-data=gene_name”，则会出现错误消息“所有计数已过滤：您使用的是人类数据吗？”将显示。
⑷ 生成的文件
① 解卷积.txt
② 手段.txt
③ pvalues.txt
④values_means.txt
⑤significant_means.txt
2.参考文献
⑴ https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32103204/
CellPhoneDB：从多亚基配体-受体复合物的组合表达推断细胞间通信 - PubMed 由配体-受体复合物介导的细胞间通讯对于协调不同的生物过程（例如发育、分化和炎症）至关重要。为了研究不同细胞类型的上下文相关串扰如何使…… pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
⑵ https://www.cellphonedb.org/documentation
CellPhoneDB - 欢迎 数据库设计和分析方法 数据库输入文件 CellPhoneDB 存储配体-受体相互作用以及相互作用伙伴的其他属性，包括它们的亚基结构以及基因和蛋白质标识符。为了创建… www.cellphonedb.org
⑶ https://github.com/Teichlab/cellphonedb
GitHub - Teichlab/cellphonedb 通过在 GitHub 上创建帐户来为 Teichlab/cellphonedb 开发做出贡献。 github.com
输入日期：2021-04-13 20:40