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生物体建模库

推荐:【生物信息学】【生物信息学分析索引】(https://jb243.github.io/pages/836)



1. 智人(人类)

⑴ 所有基因均为大写字母。

基于GRCH38参考(ENSG)的36601个单位

⑶【人类基因注释(24424个基因)】(https://blog.kakaocdn.net/dn/DDvvR/btrWdo57NBX/rl44TYcuzWAujKrqW8RAL0/ human%20gene%20annotation.csv?attach=1&knm=tfile.csv)

① 基因ID

② Entrez ID

③染色体数目、起始、终止、宽度

④股线

⑤ 成绩单ID(transcript_id)

⑥ 生物型

⑦ 别名

⑧ 蛋白质ID(p_id)

⑨ 说明



2. 小家鼠(小鼠)

⑴ 基因仅第一个字母大写,其余均为小写。

基于mm10参考(ENSMUSG)的32285个单位

⑶【人鼠基因同源性基因](https://nate9389.tistory.com/2156#:~:text=%EC%82%AC%EB%9E%8C%EA%B3%BC%20%EB%A7%88%EC%9A%B0%EC %8A%A4%EC%9D%98%20%EC%83%81%EB%8F%99(%C2%A0同源性%C2%A0在%C2%A0人类%C2%A0和%C2%A0小鼠之间))

⑷【小鼠基因注释(23282个基因)】(https://blog.kakaocdn.net/dn/VJl3Y/btrTkgIpca8/pIsadqvI4sqGIr849rDzM1/mouse%20gene%20annotation.csv?attach=1&knm=tfile.csv)

① 基因ID

② Entrez ID

③染色体数目、起始、终止、宽度

④股线

⑤ 蛋白质ID(p_id)

⑥ 成绩单 ID (transcript_id)

⑦ tss_id

⑧ 生物型

⑨ 别名

⑩ 说明



3。 E。大肠杆菌

2,639个基因基于ASM584v2 (K-12)参考文献

⑵ 参见_E.大肠杆菌_维基



4。 斑马鱼(斑马鱼)

47394个基因基于GRCz11参考。

⑵ 含有70%的人类基因。

⑶ 研究人员可以轻松操纵受精前后的遗传信息。

⑷ 与哺乳动物不同,没有肺、前列腺、乳腺等。



5。 拟南芥(婴儿杆)

⑴ 2000年测序:第一株植物测序。

38309个基因基于TAIR10.1参考。



6。 烟曲霉

9,870个基因基于ASM265v1参考。



7. 金牛座(牛)

30842个基因基于ARS-UCD 1.3参考。



8. 秀丽隐杆线虫

⑴ 1998年测序:第一个多细胞真核生物测序

46928个基因基于WBcel235参考。



9。 果蝇(果蝇)

⑴ 2000年测序。

17616 个基因 基于 Release 6 加 ISO1 线粒体基因组参考。



10。 鸡内金(鸡)> ⑴ 25,486 个基因 基于 bGalGal1.mat.broiler.GRCg7b 参考。



11。 Oryza sativa(大米)

35222个基因基于IRGSP-1.0参考。



12. Pyrenophora teres(植物病原体之一)

⑴ 基于ASM1433481v1参考,…(目前无参考数据)



13。 褐家鼠(大鼠)

35236个基因基于mRatBN7.2参考。



14。 酿酒酵母(酵母)

⑴ 1996年测序:第一个真核生物基因组测序。

6464个基因基于R64参考。



15。 Zea mays (玉米)

46263个基因基于Zm-B73-REFERENCE-NAM-5.0参考。



16。 Oryctolagus cuniculus(兔子)

29480基于UM_NZW_1.0参考的基因

29480个基因基于OryCun2.0参考

染色体定位及注释 Broad Institute




输入:2022.07.20 19:46

修改时间:2022年8月23日 09:24

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